虛無回響的沖擊余波未散，多元宇宙的時空結構開始出現不可逆的扭曲。在以「因果循環」維系文明的「輪回宇宙」中，生與死的界限徹底模糊。亡者的靈魂不再進入輪回，而是游蕩在現世化為暗紫色的「虛無殘魂」，所到之處，花草瞬間枯萎，金屬急速銹蝕。新生的生命尚未誕生便被虛無侵蝕，成為畸形的混沌造物，整個宇宙的因果鏈條斷裂，陷入無序的混亂循環。
「維度折疊宇宙」則遭遇了更為恐怖的災難。暗紫色的虛無能量如同貪婪的巨口，不斷吞噬著各個維度空間。曾經繁華的星際都市在維度折疊中被壓縮成薄片，星球被撕裂成量子態的塵埃。維度行者們的導航儀徹底失效，他們在扭曲的空間中迷失方向，甚至有些行者的身體開始與不同維度發生重疊，痛苦地承受著空間撕裂的折磨。
文明聯盟最後的監測中樞在超負荷運轉中迸發出刺目電光，星圖上暗紫色的螺旋紋路以驚人的速度擴散，將整個多元宇宙包裹其中。不完美之種遺留的核心程序在焚毀前，投射出絕望的畫面︰宇宙正沿著一條名為「終末」的軌跡螺旋下墜，盡頭是絕對的虛無。雷恩凝視著逐漸破碎的監測屏幕，意識到這或許是文明最後的生死之戰。
他迅速集結全宇宙僅剩的力量，啟動「曙光逆轉計劃」。因果律學者莫妮卡帶領團隊奔赴輪回宇宙，他們攜帶的「因果修復羅盤」能短暫梳理斷裂的因果鏈條，但在接近輪回核心「命輪聖殿」時，遭遇了由虛無殘魂凝聚而成的「因果吞噬者」。這些怪物能隨意改寫因果關系，讓攻擊在發動前就已失效，防御在接觸時就已瓦解。莫妮卡發現，唯有利用宇宙中尚存的「命運共鳴點」，才能打破這種因果悖論。
維度工程師維克多率領小隊進入維度折疊宇宙，駕駛裝備「空間錨定器」的「維度方舟號」戰艦。他們試圖重新穩定折疊的空間，卻發現暗紫色能量會將任何穩定裝置轉化為折疊加速器。維克多在絕境中提出「逆向折疊」理論，利用空間的扭曲特性，將虛無能量引導至特定維度陷阱。
雷恩親自帶領精銳部隊，直搗暗紫色螺旋的核心——一個被稱為「虛無漩渦」的混沌區域。這里時間與空間失去意義，所有物質都在被分解成最原始的粒子。混沌原始意志的殘識在此完全具象化，她化作一個由暗紫色能量構成的巨型漩渦，聲音中充滿宇宙終焉的蒼涼︰「雷恩，接受虛無的命運吧，這是所有文明無法逃避的終點！」
輪回宇宙中，莫妮卡的團隊在廢墟中尋找命運共鳴點，他們發現那些承載著文明記憶與情感的古老遺跡，依然散發著微弱的因果之光。通過激活這些共鳴點，團隊發動「因果回溯洪流」，金色的因果之力與暗紫色的吞噬者激烈踫撞。但在接近命輪聖殿時，虛無殘魂突然匯聚成「終末命輪」，試圖將整個宇宙的因果徹底歸零。
維度折疊宇宙里，維克多的小隊冒險實施逆向折疊計劃。他們將空間錨定器改裝成陷阱觸發器，引誘虛無能量進入預設的折疊維度。戰斗中，一名隊員為保護核心裝置，主動將自己與失控的錨定器綁定，一同墜入折疊深淵，為計劃爭取到了關鍵時間。
雷恩在虛無漩渦中與混沌原始意志展開終極對決，他將全宇宙文明對生存的渴望注入存在之劍，斬出「永恆存續斬」。金色的劍光與暗紫色的漩渦激烈交鋒，整個宇宙在能量的踫撞中劇烈震顫。千鈞一發之際，雷恩回想起初代神農的預言︰「平衡非靜止，而是螺旋上升的永恆。」他引導全宇宙文明的信念之力，構建出「混元平衡螺旋」，與暗紫色的終末螺旋相互纏繞。
兩股螺旋力量的踫撞引發了宇宙級的震蕩，混沌原始意志發出不甘的怒吼，她的形態在光芒中逐漸崩解。但在消散前，她將最後的力量注入終末螺旋，試圖加速宇宙的坍縮。雷恩拼盡最後的力量，以平衡印記為核心，發動「終焉逆轉」。金色的光芒如同一道曙光，穿透暗紫色的迷霧，將終末螺旋逐漸逆轉成新生的希望之環。
戰後，雖然危機暫時解除，但多元宇宙已變得千瘡百孔。雷恩望著滿目瘡痍的星空，深知這場勝利只是暫時的。那些殘留的暗紫色能量，如同蟄伏的巨獸，等待著下一次爆發的時機。他召集所有文明，共同建立了更嚴密的防御體系，並將「平衡與希望」的火種傳遞給每一個角落——因為只有永遠保持警惕與抗爭，文明才能在混沌與虛無的夾縫中，尋得一線生機。
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