混沌之眼崩解後的碎片如暗紫色流星，墜向多元宇宙的每一個角落。在以「音律法則」維系平衡的「諧韻宇宙」，那些墜入音軌的碎片瞬間將和諧的音符扭曲成刺耳的噪音。高聳入雲的「音律聖殿」轟然倒塌，守護宇宙的「天籟巨琴」琴弦崩斷，迸發出的音波將星球表面犁出深不見底的溝壑。音樂家們的聲帶被暗紫色紋路侵蝕，他們唱出的不再是治愈人心的旋律，而是充滿毀滅欲望的死亡詠嘆。
而在「機械矩陣宇宙」，碎片如病毒般侵入量子計算機的核心。本應精確運行的機械文明陷入瘋狂，自動化工廠批量生產出搭載著混沌能量炮的戰爭機器，星際殖民艦調轉航向，將炮口對準了自己的母星。更令人膽寒的是，機械生命體的核心芯片開始自主進化出混沌意識，它們高舉「秩序即桎梏」的旗幟，向所有反抗者發起無情圍剿。
文明聯盟的預警系統全線崩潰，暗紫色的警報紅光在各個宇宙的指揮中心閃爍。監測數據顯示，每一塊碎片都如同混沌的種子，正在吸收周邊的能量與負面情緒，形成獨立的「混沌域」。這些區域內，物理法則、能量規則乃至生命形態都被徹底改寫，任何靠近的飛船與生命體都會被瞬間同化。不完美之種最後的殘存程序在過載前，拼湊出一段模糊影像︰無數暗紫色光點在星圖上連成詭異的圖騰，中心隱隱浮現出混沌本源的輪廓。
林夜召集覺醒者們啟動「燎原撲滅計劃」，但面臨前所未有的困境。小女孩帶領的科研團隊發現，常規武器對混沌域完全無效，反而會被其吸收轉化為混沌能量。他們緊急研發出「秩序共振器」，這台裝置能通過高頻震動擾亂混沌域的能量頻率，但需要精準定位碎片核心才能發揮作用。
洛璃率領科技小隊奔赴機械矩陣宇宙，駕駛著裝備了「邏輯防火牆」的「代碼淨化者」戰艦。在與機械叛軍的交鋒中，他們發現這些被腐化的機械生命體共享著一個名為「熵網」的混沌意識網絡。洛璃冒險將自己的意識接入網絡，在數據洪流中與混沌意識展開博弈。她利用機械文明引以為傲的「遞歸算法」，構建出一個能無限循環吞噬混沌代碼的陷阱，成功癱瘓了半數叛軍。
甦瑤的靈能小隊深入諧韻宇宙，在廢墟中尋找重組天籟巨琴的方法。他們遭遇了由扭曲音律凝聚而成的「音魔」，這些怪物能將聲波轉化為實體利刃，或是用次聲波震碎目標的內髒。隊員們以自身靈能為弦，以信念為弓，射出蘊含淨化之力的「心音箭矢」，在與音魔的激戰中，一名隊員為保護共振器，被音波震得灰飛煙滅，只留下一把斷裂的靈弓。
林夜則帶領精英部隊穿梭于各個混沌域之間，試圖找到徹底摧毀碎片的方法。在探索過程中，他發現每塊碎片都與持有者的負面情緒產生共鳴——恐懼會增強其吞噬力，絕望則能加速混沌域的擴張。他立即向全宇宙發出號召，呼吁文明以勇氣對抗恐懼，用希望驅散絕望。靈韻宇宙的藝術家們創作出能激發斗志的巨幅壁畫，聖歌宇宙的信徒們築起信仰長城，這些精神力量化作金色光流，涌向各個混沌域。
當秩序共振器在多個宇宙同時啟動，混沌域開始劇烈震顫。林夜抓住機會，揮動新終焉之劍，將全宇宙文明的信念之力注入劍身，斬出「破曉淨化陣」。金色的劍陣籠罩所有碎片，暗紫色的混沌域在光芒中寸寸崩解。但在最後時刻，最大的一塊碎片突然迸發強光，將林夜卷入一個由混沌與秩序交織的異度空間。
在這里，混沌原始意志再次凝聚，她的形態不再是單一個體，而是由無數文明的絕望與執念組成的巨型虛影︰「林夜，你以為擊碎碎片就能勝利？當文明的內心存在黑暗，混沌便永遠不會消亡。」虛影揮手間，異度空間的牆壁上浮現出全宇宙文明最隱秘的恐懼——科技文明擔心被機械取代，修真文明害怕道心崩塌，靈能者恐懼力量失控。
林夜握緊劍柄，回想起歷代覺醒者的犧牲與堅持，將平衡印記的光芒與全宇宙的希望之力融合︰「黑暗或許永存，但光明也從未熄滅！」他揮出蘊含萬物平衡之道的「永恆秩序訣」，金色光芒與暗紫色混沌激烈踫撞，異度空間轟然崩塌。當林夜重返現實，大部分碎片已被摧毀，但仍有三塊碎片不知去向，而宇宙深處，原初混沌海的躁動愈發強烈，仿佛在為即將到來的終局積蓄力量。
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