暗紫色晶體上的預言如重錘般砸在所有覺醒者心頭，而宇宙的異變正以肉眼可見的速度加劇。在以「概率演算」構建文明的「熵算宇宙」，所有的概率模型突然失效。預測百年繁榮的星系瞬間因未知災害化為廢墟，本應萬無一失的星際航線突現致命引力漩渦。科學家們驚恐地發現，暗紫色的混沌紋路正如同病毒般侵蝕著概率雲，將確定的未來扭曲成無序的混沌。
同一時刻，「靈魂鑄形宇宙」陷入更深的災難。用于塑造靈魂形態的「鑄魂熔爐」被暗紫色物質入侵，新生的靈魂剛一成型便扭曲成怪物，而成熟的靈魂則被抽離出負面情感，化作散播絕望的「噬魂者」。整個宇宙的靈魂共鳴網絡淪為混沌的傳聲筒，不斷播放著文明末日的幻象。
文明聯盟的中樞系統響起刺耳的紅色警報，量子望遠鏡捕捉到驚人畫面︰連接原初混沌海的裂縫處，暗紅色光芒徹底凝聚成一只布滿星雲紋路的巨眼。它每一次開合，都在虛空中掀起足以撕裂空間的波紋，暗紫色的能量如血淚般滴落，所到之處的星體瞬間坍縮成黑洞。不完美之種最後的量子意識在湮滅前，傳來一段混亂的波動︰「眼瞳啟封...萬物歸零...」
林夜緊急召開全宇宙文明會議，決定啟動「終末防線計劃」。小女孩帶領科研團隊爭分奪秒改良「規則隔離罩」，將其升級為能抵御混沌規則侵蝕的「混元秩序盾」，但需要全宇宙文明的能量同步供應才能維持運轉；洛璃則率領科技精銳前往熵算宇宙，試圖用「概率錨定儀」重新穩定概率雲，卻在途中遭遇由混沌概率構成的「無序巨像」，這些巨像能將任何攻擊轉化為隨機事件，時而讓炮彈原路返回，時而讓戰艦陷入永無止境的時空循環。
甦瑤的靈能小隊深入靈魂鑄形宇宙的「鑄魂聖殿」，發現混沌力量已將熔爐核心改造成「靈魂絞肉機」。隊員們與噬魂者展開慘烈戰斗，其中一名年輕的靈能者為保護同伴，主動引動自身靈魂之力自爆，以同歸于盡的方式撕開防線缺口。甦瑤強忍悲痛，帶領眾人激活聖殿中的「靈魂共鳴陣」，將純淨的靈魂之力注入熔爐，暫時壓制住混沌侵蝕。
林夜親自率隊前往虛空墳場，直面那只即將完全睜開的混沌之眼。覺醒者艦隊剛進入戰場，便遭遇「混沌凝視者」的阻攔。這些怪物由暗紫色能量與扭曲的時空構成，它們的目光所及之處，物質的分子結構會瞬間崩解。林夜揮舞新終焉之劍，斬出蘊含秩序法則的劍氣，卻發現攻擊在接近混沌之眼時被其引力場吞噬。
千鈞一發之際，全宇宙文明完成能量輸送，混元秩序盾在混沌之眼周圍展開金色屏障。但混沌之眼突然釋放「原初熵能射線」，暗紫色的光束輕易穿透護盾，所過之處的星系如同被橡皮擦抹去般消失。林夜意識到，單純的防御無法取勝，必須找到混沌之眼的「意識核心」。
通過與小女孩的遠程協作，林夜發現混沌之眼的虹膜深處，藏著一顆跳動的暗紫色晶體——正是混沌本源晶核的最終形態。他帶領精銳小隊駕駛特制的「維度滲透艙」，冒著被時空撕裂的風險，直插混沌之眼內部。在晶體周圍，他們遭遇了混沌意志的終極造物「熵寂守護者」，這些守護者由宇宙中所有未被淨化的負面情緒凝聚而成，擁有扭曲現實的能力。
戰斗中，林夜的平衡印記突然發出前所未有的光芒，浮現出初代神農留下的最後啟示︰唯有將秩序與混沌的本質調和，方能終結這場永恆之戰。他引導全宇宙文明的意志，將希望、勇氣等正面情感與混沌之眼的毀滅能量融合，揮動新終焉之劍，斬出蘊含萬物平衡之道的「混元歸一斬」。
金色與暗紫色的能量踫撞產生劇烈震蕩，混沌之眼發出痛苦的嘶吼，其表面開始龜裂。但在徹底崩潰前，混沌本源晶核分裂出無數碎片，散入多元宇宙的各個角落。林夜知道，這場戰爭遠未結束——那些散落的碎片，隨時可能成為新的混沌源頭。而宇宙深處，原初混沌海傳來更加低沉的轟鳴，仿佛在醞釀著一場更大的風暴。戰後的多元宇宙滿目瘡痍，覺醒者們望著布滿裂痕的星空，握緊手中的武器，準備迎接真正的終局之戰。
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