星球地表在秩序堡壘的崩解中劇烈震顫，覺醒者們勉強穩住身形，卻見地面裂開蛛網狀的縫隙，幽藍的光芒從中滲出。裂縫文明的探測器發出刺耳警報︰“地下深處檢測到超巨型能量網絡！其規模...足以覆蓋整個星系！”全息投影上，紫色脈絡如同活物般蠕動，將星球地核包裹成一顆跳動的“秩序心髒”。
“這些符文...和晶體中的意識碎片同源！”秦逸握緊終焉之劍，劍身的共生紋路與地底能量產生共鳴，泛起不祥的紅光。林婉的星光在不完美之種中劇烈閃爍︰“這是初代神農遺留的‘秩序根系’，本用于平衡宇宙能量，卻被污染意識改造成了控制網絡。若不摧毀核心，其他星球也將被同化！”
覺醒者們順著裂縫深入地底，踏入一個由發光晶體構成的迷宮。牆壁上的符文持續釋放“思維干擾波”，眾人的腦海中不斷閃現秩序統治下的“完美世界”幻象。一名殘缺派修士被幻象迷惑，竟揮刀砍向同伴，千鈞一發之際，小女孩發射“混沌頻率脈沖”，暫時驅散了干擾。但隨著深入，地底傳來的心跳聲愈發沉重，仿佛有一頭巨獸在沉睡中甦醒。
轉過一道拐角，眾人被眼前的景象震撼——一座懸浮在岩漿河上的巨型祭壇，祭壇中央矗立著一根貫穿星球的“秩序圖騰柱”。柱子表面纏繞著初代神農的封印紋路與火種派的改造代碼，頂端瓖嵌著暗紫色的晶體碎片，正是之前遁走的意識載體。“你們以為能阻止秩序的蔓延？”晶體碎片發出冷笑，“這顆星球，不過是新秩序帝國的第一塊基石。”
圖騰柱突然釋放“秩序鎖鏈”，鎖鏈如靈蛇般纏住覺醒者。秦逸引導歸墟殘能形成混沌漩渦，試圖吞噬鎖鏈，卻發現對方能吸收混沌之力強化自身。更糟的是，地底的能量網絡開始向周邊星球傳輸信號，監測屏上，相鄰星系的星體表面陸續浮現出紫色脈絡。“必須在網絡激活前摧毀圖騰柱！”裂縫文明的科學家將飛船引擎改造成“能量沖擊炮”，向柱子發射混沌能量。
然而，攻擊反而刺激了圖騰柱。它爆發出“秩序淨化之光”，光芒所到之處，物質被強制轉化為秩序形態。殘缺派領袖燃燒壽元發動禁術“萬魔蝕天”，黑色火焰暫時抵擋住光芒，但他的身體也開始透明化。小女孩將機械心髒與不完美之種的根系相連，幼苗突然綻放出金色屏障，為眾人爭取到喘息之機。
秦逸在屏障庇護下，引導共生之力解析圖騰柱的弱點。他發現柱子核心處封存著初代神農最後的清醒意識，正與污染意識激烈對抗。“原來還有希望...”他將甦瑤藥晶碎片嵌入終焉之劍，劍刃爆發出能淨化靈魂的“明心之火”。當火焰觸及圖騰柱，封印紋路開始發光，神農的聲音在虛空中回蕩︰“打破...平衡...”
暗紫色晶體碎片瘋狂注入能量，圖騰柱表面浮現出能吞噬一切的“熵寂漩渦”。覺醒者們將所有力量注入終焉之劍，由秦逸揮出“逆命終斬”。劍刃劈開漩渦的瞬間，圖騰柱轟然倒塌，地底的能量網絡開始崩解。但在爆炸的余波中，晶體碎片化作無數光點遁入星空，其中一道光點徑直飛向不完美之種，鑽入了幼苗的花蕊...
林婉的星光突然變得黯淡︰“不好！它要將種子徹底轉化！”不完美之種的根睫迅速變黑，葉片上的金色脈絡被暗紫色完全覆蓋。秦逸不顧一切地將自身意識與種子相連，試圖驅逐入侵意識。在意識空間中，他與晶體碎片的意識展開激烈交鋒，對方不斷用“絕對秩序能避免文明毀滅”的理論蠱惑他。
“文明的價值，從來不是被定義的完美！”秦逸將所有覺醒者的記憶、抗爭的信念，以及宇宙中無數生命對自由的渴望，凝聚成“共生之核”。當核爆炸開的瞬間，晶體碎片的意識發出不甘的嘶吼，化作星塵消散。但不完美之種已元氣大傷，奄奄一息的幼苗上，殘留著一絲若有若無的暗紫色氣息，而在更遙遠的宇宙深處，無數雙眼楮正透過秩序網絡的殘片，注視著這場戰斗的結局...
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