破碎的囚籠殘骸在宇宙中飄蕩，宛如冰冷的墓碑。秦逸將復甦中的林婉安置在臨時搭建的醫療艙內，她石化的皮膚已褪去大半，但眉心間仍殘留著一道銀色鎖鏈狀的紋路。熵變之杖孕育的樹苗在星雲核心茁壯成長，枝干上流轉著混沌與秩序交織的奇異光芒，卻也吸引了不速之客。
“檢測到異常能量波動！”裂縫文明的警報聲驟然響起。星雲邊緣，無數閃爍著金屬光澤的孢子群破空而來——那是由菌裔與機械技術融合的“共生孢子”，每個孢子表面都刻著火種派的禁錮符文。孢子群所過之處，星球植被迅速金屬化，生命體被強制植入機械共生體。
“是火種派的‘機械菌裔’計劃！”殘缺派領袖的聲音從通訊器傳來，帶著難以掩飾的震驚，“他們把石像守衛的殘骸與醫道菌裔結合，創造出了能同化一切的恐怖存在！”話音未落，孢子群已化作巨型機械藤蔓，纏繞住裂縫文明的旗艦。藤蔓表面的菌毯不斷分泌腐蝕液，而金屬骨架則精準攻擊飛船要害。
秦逸握緊熵變之杖，杖身的混沌藤蔓自動延伸，與機械藤蔓纏繞絞殺。但詭異的是，當兩種力量踫撞時，共生孢子竟開始吸收混沌能量，進化出更堅硬的外殼。林婉在昏迷中發出痛苦呻吟，她眉心的鎖鏈紋路亮起，與孢子群產生共鳴——機械菌裔似乎將她視為“完美宿主”。
“不能讓它們靠近林婉！”秦逸將歸墟殘能注入混沌藤蔓，爆發出足以扭曲空間的力量。熵變之杖的樹苗突然搖晃，釋放出一圈圈能量漣漪，暫時壓制住孢子群。但樹苗的葉片開始出現黑斑，仿佛在承受巨大的反噬。裂縫文明的科學家緊急分析數據，臉色慘白︰“這些孢子在篡改樹苗的基因鏈，它們想把混沌秩序樹轉化為共生母體！”
更糟糕的狀況接踵而至。被孢子感染的星球上，誕生出了“共生醫傀”——失去自我意識的生命體，兼具菌裔的超感醫療能力與機械的絕對服從性。這些醫傀組成方陣，手持由自身骨骼鍛造的手術刀，所到之處，無論傷者還是健康者，都會被強制“改造升級”。
“必須找到共生孢子的弱點！”秦逸在戰斗間隙翻閱懺悔錄，卻發現書頁上的文字正在扭曲重組。突然，一段模糊的記憶涌入腦海︰初代神農曾用“矛盾之種”平衡相生相克的力量。他立刻調動熵變之杖，將混沌與秩序能量壓縮成一枚黑色種子，投向孢子群中央。
種子爆炸的瞬間，產生了排斥一切同化的力場。共生孢子紛紛崩解，但剩余孢子卻迅速融合，形成一個巨型機械菌裔母體。母體張開布滿利齒的巨口，將附近三顆星球吸入腹中，開始批量生產共生醫傀。林婉的心跳突然加速，她的身體不受控制地漂浮向母體——石像守衛殘留的火種程序，正在強行將她與母體連接。
“不！”秦逸不顧一切地沖向母體，歸墟殘能在體表燃燒成黑色火焰。他揮動熵變之杖，斬斷連接林婉的能量鎖鏈，卻被母體釋放的孢子雨擊中。腐蝕感從皮膚滲入骨髓，他感覺自己的意識正在被機械思維蠶食。千鈞一發之際，裂縫文明的孩子們再次挺身而出，將全部痛覺能源化作防護罩，護住秦逸與林婉。
就在局勢瀕臨絕望時，甦瑤藥晶的碎片突然匯聚成一道光柱，直擊巨型母體。藥晶中傳來空靈的聲音︰“共生不該是奴役，而是包容。”光柱所到之處，機械菌裔的金屬外殼開始軟化，菌毯紋路轉變為溫和的治愈圖騰。母體發出不甘的嘶吼，分裂成無數小型共生體，逃向宇宙深處。
但危機並未解除。秦逸發現，那些逃走的共生體開始在星域間建立“共生祭壇”，祭壇表面的符文與林婉眉心的紋路如出一轍。更令人不安的是，混沌秩序樹的黑斑仍在擴散，樹苗根系中隱隱浮現出機械脈絡。林婉終于甦醒，她望著星雲外閃爍的祭壇光芒，輕聲道︰“我們創造了新的平衡，卻也打開了潘多拉魔盒...這些共生體，正在尋找新的宿主。”
而在宇宙某個未知角落，一個身披黑袍的身影注視著這場戰斗。他手中把玩著一枚融合了菌裔與火種技術的結晶，嘴角勾起冷笑︰“有趣，是時候啟動‘傀儡核心’計劃了...”星雲深處，共生祭壇的符文突然全部亮起，一場更大的陰謀正在黑暗中悄然醞釀。
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