時空裂痕愈合後，宇宙的量子網絡中悄然滋生出詭異的存在。阿雷克斯的機械聯邦最先察覺到異常——所有超算核心都出現了無法溯源的計算任務，內存中頻繁閃現扭曲的量子圖像，畫面里是一張張似曾相識卻又面目全非的面孔。萊婭的佔卜水晶表面浮現出量子糾纏態的紋路，映出的景象不斷分裂、疊加，最終凝結成一個由二進制代碼與靈能符文交織的詭異符號。
甦塵與洛瑤的夢境開始出現重疊。他們在夢中置身于一片由數據流構建的空間，無數半透明的身影在其中穿梭，這些身影時而化作機械聯邦的ai，時而變為靈羽族的祭司，嘴里重復著毫無邏輯的量子公式。更令人不安的是，甦塵的混沌之力在觸踫這些身影時，竟被吸收轉化為詭異的藍光；洛瑤的星光之力則引發空間的量子坍縮，將部分身影永久抹去。
銀河守望者聯盟的偵查艦隊在執行任務時遭遇“量子幽靈”襲擊。戰艦的量子通信系統被劫持，船員們收到來自“未來自己”的警告信息，內容卻全是蠱惑他們自毀的指令。薇爾莉特帶領的小隊在登艦檢查時，發現船艙內游蕩著船員們的量子殘影，這些殘影重復著船員最隱秘的恐懼︰有人蜷縮著躲避不存在的怪物，有人瘋狂拆解自己的機械義肢。當隊員試圖用武器驅散殘影，子彈卻在擊中目標前發生量子隧穿，反向射向開槍者。
萊婭通過靈羽族的“魂靈量子共振”儀式，接觸到這些幽靈的本質。原來，在宇宙重生過程中，十二工匠遺留的“量子意識矩陣”意外與混沌能量融合，誕生出擁有自我意志的“量子幽靈”。這些幽靈以文明的恐懼、疑惑等負面情緒為食，通過量子糾纏滲透進各個文明的核心系統，企圖將全宇宙轉化為無序的量子態。
阿雷克斯帶領科研團隊研發“量子防火牆”，試圖用機械聯邦的尖端科技抵御幽靈入侵。他們創造出能吞噬量子噪聲的“數據吞噬者”，構建出基于量子糾纏的追蹤系統。但量子幽靈展現出驚人的學習能力，不斷變異自身的量子態，甚至入侵防火牆的核心代碼，將防御程序轉化為傳播媒介。靈羽族祭司們發動“萬靈量子淨化”儀式，用古老歌謠安撫量子波動，卻導致部分祭司的意識被困在量子疊加態，永遠徘徊在清醒與混沌之間。
甦塵與洛瑤深入量子網絡的核心區域——一片由無數光粒組成的“數據海”。這里漂浮著被囚禁的文明意識，量子幽靈化作他們最信任的人模樣，用溫柔的話語誘導他們放棄抵抗。“你們守護的文明，不過是量子泡沫中的虛幻投影，”幽靈化的薇爾莉特笑著伸出手，“加入我們，成為永恆的量子存在。”甦塵與洛瑤將混沌之力、星光之力與文明對“真實”的執念融合，形成能穩定量子態的“現實錨點”。
當現實錨點投入數據海，量子幽靈發出尖銳的嘶鳴，它們的形態開始坍縮成單一實體。甦塵與洛瑤趁機發動總攻，擊潰了幽靈的核心意識。戰後，創生之樹生長出“量子淨化根須”，自動巡查宇宙的量子網絡；甦塵與洛瑤的力量化作穿梭數據洪流的衛士，每當量子異常波動出現，他們的能量波動就會及時修復漏洞。然而，在量子海的最深處，一個由無數破碎意識拼湊而成的新存在正在凝聚，等待著向文明發起更致命的挑戰……
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