大明的軍隊包圍了柔佛民丹島，這里已經被葡萄牙人摧毀過一次。現在統治柔佛王朝的是甦丹阿拉烏丁二世，大明的軍隊包圍了這里，兩萬明軍在炮火的掩護下，乘坐登陸艇強行搶灘。
出來抵抗的一萬柔佛軍隊在海灘上被全殲，明軍的陸戰隊在海灘上升起了大明的國旗。
明軍的炮火可以直接轟炸柔佛甦丹的王宮，阿拉烏丁二世暗自叫苦，自從葡萄牙人于1511年佔領馬六甲之後，柔佛甦丹的家族就流年不利。他們一家似乎成了國破家亡的典型代表。
葡萄牙殖民者，幻想大明中如同馬六甲一樣可以輕易落入葡人之手，等他們來到大明沿海之後，發覺大明帝國並不是葡萄牙可以一口吞下的。
馬六甲王朝的滅亡，除了遭遇強大的外敵之外，還有一個重要原因就是內部的衰落與紛爭。
大明朝廷得知馬六甲被侵佔一事是在1520年，距馬六甲落入葡人之手已過了9年。而在這9年中，葡人的腳步早已穿過南中國海，進入大明廣東沿岸。
如果不是葡人的放肆，以及馬六甲王子賓塘王公的使者穆罕默德來到北京，向禮部送來馬六甲的求援信，馬六甲落入葡人之手一事，明廷就會一直被蒙在鼓里。而明武宗早已失去了解決此事的能力，這位荒誕的君主，在臥病三月後晏駕。但在當時一批大臣的建議下，終于對馬六甲的淪陷做出回應︰不許佛郎機（葡萄牙）入貢，同時葡萄牙出使中國的皮雷斯一行于同年春夏被押往廣州，並作為歸還馬六甲疆土之人質投入監牢。
當時的大明在東南亞一帶並沒有軍事存在，它與東南亞國家的朝貢關系只是彼此的一紙政治承諾書，蒼白無力。現在不一樣了，嘉靖的軍隊在果阿消滅了葡萄牙殖民者。
馬六甲港口的葡萄牙人成了孤軍，但是葡萄牙的馬六甲總督仍然不肯撤離。明軍的艦隊在馬六甲海峽佔有絕對優勢，明軍的火炮數量是葡萄牙人的六倍。當年葡萄牙在佔領馬六甲後，為防止當地勢力的反擊，建造了當時號稱東南亞最大和最堅固的堡壘-法摩沙堡，這座城堡在明軍進攻時，沒能抵擋住絕對優勢兵力的明軍。在大明軍隊進攻的時候，葡萄牙人在堡壘里和馬六甲城內有3300多人的兵力。
1511年，葡屬印度總督率領一支由18艘艦船、1200名葡萄牙士兵和200名印度雇佣軍組成的艦隊，橫跨印度洋，進入安達曼海，駛向馬六甲海峽，直抵馬六甲城下，他們向馬六甲國王提出割讓土地，修建要塞的無理要求，遭到了馬六甲國王的斷然拒絕，7月24日葡萄牙艦隊向馬六甲城發動了突然進攻。
盡管馬六甲守軍數倍于葡萄牙軍隊，馬六甲國王也帶領軍民進行了頑強抵抗，重創了葡萄牙侵略軍，但是僅憑大刀、長矛等冷兵器，怎能抵擋得住葡萄牙人堅船利炮的進攻，經過一個星期的激戰，8月24日葡萄牙軍隊攻陷了馬六甲城，佔領了升旗山上的馬來王宮，馬六甲王朝最後一任國王見大勢已去，帶著殘兵敗將，丟下富甲一方的馬六甲，慌忙逃往海峽對岸的甦門答臘島，不久在那里抑郁而亡。
馬六甲城陷落後，葡萄牙侵略者下達了屠城和掠奪的命令，大批的馬六甲居民慘遭殺害，數以萬計的珠寶被搶劫一空，就這樣建國110多年，曾經輝煌無比的馬六甲王朝滅亡了。
葡萄牙佔領馬六甲後，利用武力和宗教進行殖民統治，他們拆毀了升旗山上的王宮，建造了堅固的炮台，炮口直指海面和馬六甲城內，在馬六甲河口修建了聖保羅教堂，向當地居民傳播天主教，同時以海盜的方式壟斷了海峽貿易，向停靠馬六甲的商船收取高額“買路錢”，為葡萄牙攫取巨大的經濟利益。在殖民統治時期里，葡萄牙將馬六甲變成它在東南亞的殖民中心，葡萄牙人曾經不無得意地炫耀說“馬六甲是葡萄牙王冠上的一顆明珠”。
葡萄牙人獨霸馬六甲黃金水道，攫取了巨大的經濟利益，引起了大明嘉靖皇帝的不滿。大明軍隊在征服柔佛甦丹的同時，順便向葡萄牙發起了挑戰，他們以武力趕跑了葡萄牙人，佔領了馬六甲城。
和明軍戰斗，葡萄牙人還差了那麼點意思。大明的重炮向法摩沙堡轟擊。
大明軍隊上午九時左右，從海上艦隊的發射的炮彈就對法摩沙堡密集轟擊，葡萄牙人的炮兵未發一彈，就全被毀滅。柳鐵塔將軍率領艦隊從海上進攻。大明第十六軍司令霍錢隆屬下的第三十一師中的步兵旅、第一炮兵團率領配備榴彈發射器和大炮的部隊，越過邊境從陸路進攻。
葡萄牙人守軍在眾寡懸殊的情況下，一夜之間被打得潰不成軍，下午三點馬六甲城淪陷，葡萄牙人退守法摩沙堡。晚上六點，明軍攻佔了水塘，切斷了葡萄牙人的淡水供應，大明發動進攻前，葡萄牙軍方估計，一旦大明進攻馬六甲，馬六甲至少可以抵坑六個月，這樣，葡萄牙援軍就趕到了。然而，這只是葡萄牙一廂情願的想法，
大明一交手，葡萄牙人就丟盔棄甲，潰不成軍。晚上9時許，馬六甲上空飄起了白色停戰旗，當天晚上，葡萄牙總督在馬士加路明軍海軍司令柳鐵塔簽署了正式投降書。
明軍以打死1200多名葡萄牙人、生俘近2100人的戰績，佔領了馬六甲。大明征服馬六甲後，對原來的葡萄牙建築沒有損毀。
聖保羅教堂由葡萄牙人于1521年建立，是歐洲人在東南亞修建最古的老教堂。因著名傳教士聖方濟埋葬于此，教堂前豎立著一個沒有右手的聖方濟雕像，基督徒們將其視為神明來祭拜呢，大明佔領馬六甲後，也曾把聖保羅教堂當作城堡使用。
由于建在高地上，游客們在觀光聖保羅教堂時也能順道俯瞰馬六甲市。現在教堂內豎立著一塊塊寫有拉丁文和葡萄牙文的石板，這就是當年葡萄牙貴族們的墓碑。可以說這座聖保羅教堂見證這馬六甲風雲變換的歷史，站在寬大無頂的教堂內，可以靜靜感受歲月留下的痕跡。
建于三保山上的三保廟，是為了紀念鄭和，這位對馬六甲發展有著重大貢獻的航海家而建的。在鄭和七下西洋期間，曾多次到訪馬六甲。
三保廟采用大明的建築風格，據說所有的建築材料和工匠都是從大明引進的呢！三保廟內院子里有一座鄭和像，氣宇軒昂，盡顯鄭和的英雄氣概。
第二天，柔佛甦丹阿拉烏丁二世也向明軍投降了。作為最強大的海軍力量擁有者大明帝國，開始向馬六甲以及馬來亞諸島移民。
為了給馬六甲這條黃金水道打上大明軍隊永久佔領的印記，大明不遠萬里運來紅色的磚石，沿著馬六甲河口兩岸修建了一組組大明特色的紅色建築，或做為大明學校傳播文化，或做為大明衙門行使統治權力，如今這一座座被稱作大明縣衙的建築，歷經數百年歲月風霜的洗禮，依然矗立在馬六甲河口，仿佛向人們訴說著它昔日的權威和輝煌。
大明控制馬六甲海峽後，采取了更加強硬的手段，要求過往商船繳納通行費。許多南下的商船為了逃避巨額“買路錢”，不得不避開馬六甲海峽，繞道甦門答臘島南部，使得進入馬六甲海峽的商船減少了許多。
馬六甲河口常年泥沙淤塞，原有的深水良港，已不能停靠大型船舶了，經過馬六甲海峽進入印度洋的商船就更少了，漸漸地昔日商賈雲集、千帆竟渡的馬六甲失去了曾經的繁華和興盛。
這時，大明的官員對馬六甲江河日下的港口貿易早就失去了興趣，將目光轉向了漫山遍野的原野，他們種植了大量的橡膠林。同時，開發被稱為“黑金”的錫礦，為了彌補當地勞動力的不足，大明從中原等地大量移民，並從南北印度行政區雇佣了大批勞工，對馬六甲的自然礦產資源進行開發和開采。
同時，大明開始設立馬六甲總督和馬來亞省。大明聯合艦隊一起向新興的亞齊王國艦隊發起攻擊。
大明艦隊全殲亞齊艦隊，佔領了彭亨，在馬根都希(今哥打丁)建立新省會。柔佛大區佔據了馬來半島大部分、廖內群島和甦門答臘的望加錫、監篦、碩坡的廣大地區。大明征服馬六甲後，從這里得到礦產、木材、香料、黃金、珠寶和大米。尤其是從東南亞進口的錫礦石和大米對大明經濟意義重大，前者可以用來制造銅錢和器皿，後者是供給閩粵居民的糧食來源。通過向東南亞出口或轉口，大明的制瓷業，紡織業，制茶業和造船業以及工業盈利甚巨。更重要的是，大明在東南亞海洋的活動，從而建立自己主導下的大明—東南亞體系，為自己拓展了一個的巨大的生存空間。
(本章完)