不過，新的線索很快就出現了！
伯恩找到報紙，並在上面找到了翁博西的發言。聯合這份發言，再聯系自己的行蹤，伯恩終于確認，自己就是那個去游艇上暗殺翁博西的凶手！
伯恩得知真相後，一臉沉重地告訴瑪麗︰“報上說，翁博西在被殺前兩周告訴警方，一名男子在距離馬賽八公里的海上，爬上了他的游艇，並企圖暗殺他。報上說他把那殺手趕下了船，並擊中他後背兩槍。”
“報上說，我是一名刺客。”
最後，伯恩直接把“那名男子”替換成了“我”。
他的心里，已經確認自己是那名殺手了。因為自己的背後就中了兩槍，而自己也出現在那片海域，並且是被一輛漁船救上來的。
到此，一條條線索都天衣無縫地串聯了起來。
伯恩的追尋身份之路，終于漸漸明朗起來！
看到這里，觀眾們也是一陣頭皮發麻。繞了這麼大一圈，伯恩終于明白自己是一個殺手了！
“哇，伯恩真厲害。”
“伯恩終于知道自己是一個殺手了！”
“簡直不要太酷，伯恩不僅身手好，思維也十分縝密，通過一個不起眼的小線索就能順藤摸瓜查到自己的身份，太酷了，我就喜歡這種層層解謎的諜戰片！”
“這下子輪到CIA有麻煩了！”
的確，這回輪到CIA頭疼了。不僅是頭疼伯恩會泄露踏腳石的秘密，還頭疼巴黎警察這群豬隊友。
因為在伯恩二人在外調查時，巴黎警方查到了二人在小旅館住過，並層層包圍了這里。
巴黎警察搞出這麼大陣仗，那以伯恩縝密的心思，肯定不會自投羅網。
于是乎，伯恩和瑪麗溜了。一直在這里蹲點的殺手“教授”，還沒等到伯恩回來，就宣告計劃破產。
而在CIA總部，亞歷山大大發雷霆，罵了法國那些豬隊友一通，然後下達命令，繼續嚴查伯恩和監視巴黎警察的一舉一動。
而沃德在見到伯恩搞出的一系列動靜後，再次找上了亞歷山大︰“現在過了24小時，但他沒有回來。你的這個秘密特工瘋了，他把美國一個領事館毀得一塌糊涂，如今又在歐洲四處逃命。而你還不知道原因何在，但我必須要面對檢察委員會。關于踏腳石行動，我能對他們說什麼？”
說個屁啊！
自己和亞歷山大以權謀私，要是被監察委員會發現了，兩個人都要完蛋！
之所以要派人去殺翁博西，就是因為這個黑人知道自己和沃倫貪污腐敗的秘密！
所以亞歷山大也不把鍋丟給伯恩了，干脆和自己上司沃德攤牌︰“你擔心的是預算會議吧？我們不負責此事，這事處理不好就干不下去了。我們會毀在這件事上，我們都得完蛋！”
這件事，自然就是踏腳石計劃和翁博西游艇被刺殺一事。
而這件事情的一個關鍵點，就在失控的伯恩身上。
所以，亞歷山大要不惜一切代價殺掉伯恩，以絕後患。
雖然他不知道伯恩現在的情況，也不知道伯恩失憶了....
但是去特麼的，只要伯恩死了就行，管他伯恩什麼情況。只有死人，才不會暴露CIA的秘密！
.......
鏡頭一轉，伯恩繼續和瑪麗逃亡。而為了瑪麗的安全，伯恩決定把她送到一個安全的地方，然後自己獨自去面對以後的一切。
最後，瑪麗選擇了自己哥哥的老家。
而CIA也通過大數據判斷出瑪麗在歐洲經常去的地方，然後通過通話記錄，鎖定了他們的目的地。
而前去暗殺的殺手正是“教授”！
不過，教授依然不是伯恩的對手，一場槍與槍的決斗之後，教授被伯恩精準的槍法擊倒。
而伯恩在教授臨死前得到了一個信息︰自己曾經是踏腳石計劃的一員！
而像他這樣的成員，遍布歐洲各大城市，專門執行各種刺殺行動。
不過更多的，失了憶的他就不清楚了。
之後，伯恩通過教授身上的手機，聯絡上了CIA總部，並和亞歷山大約在巴黎新橋見面。
可笑的是，電話兩頭的二人，連對方的想法都沒搞清楚。亞歷山大不知道伯恩失了憶，他以為伯恩搞出這些動作，是準備叛變，是不可控的意外，所以他才想殺伯恩滅口。而伯恩只是想弄明白自己和CIA的聯系而已，他只想找回自己的身份。
失了憶的他，根本就不記得踏腳石計劃和自己為什麼要刺殺翁博西。
說起來，這都是命運在開玩笑！
.......
鏡頭中，亞歷山大在下午趕到了大橋，不過被伯恩發現他安插了許多的眼線，所以踫頭計劃破產。
不過伯恩留了一個心眼，他在亞歷山大來的車下裝了一個跟蹤器。這玩意兒，是他殺了教授獲得的戰利品。
晚上，伯恩沿著追蹤器找到了亞歷山大的落腳點，並偷偷摸摸地溜了進去。
終于，亞歷山大和伯恩二人在最後時刻見了面！
“我到底是誰？”伯恩問出了這個問題，一個他最想知道的問題，一個觀眾們也迫切想知道的問題。
看著伯恩這幅樣子，亞歷山大氣就不打一出來︰“你是美國政府的資產！你是身價三千萬但卻出了岔子的一件武器！”
武器，一件武器.....
听到這個詞匯，觀眾們和伯恩都不由自主地瞪大了眼楮。
眾人算是懂了，伯恩就是CIA秘密培養的一個超級殺手，一個花了三千萬、專門為CIA清理絆腳石的超級殺手！
“那你為什麼要殺我？”伯恩繼續問道。
亞歷山大罔若未聞，只是問︰“馬賽那邊到底出了什麼事？”
“你派我去殺翁博西！”伯恩說道，這也是觀眾們一致的認為。
但不料......
“殺翁博西？沒錯，我們可以隨時去做這件事情，甚至我可以派其他人去做這件事情，真特麼見鬼！”亞歷山大破口大罵︰“翁博西本來在兩周前就該死掉的，他的死本該只有唯一一種解釋，那就是他是被自己的一名隨從謀殺的！”
“我不會派你去暗殺，我派你是去隱藏起來，我派你是因為你這個人根本就不存在！”
亞歷山大氣憤無比，因為翁博西聲稱自己知道一些有關于美國政府的秘密，而這個秘密就與自己和自己的上司的貪腐有關。
所以，為了自己的小命亞歷山大必須除掉翁博西，只不過除掉的方式沒那麼直接而已。
而踏腳石計劃可以先斬後奏，所以他派出伯恩去潛伏在翁博西的身邊，制造出翁博西被他隨從殺死的假想，把凶手栽贓到其他人身上。這樣，翁博西的死就不會遷怒到CIA和美國政府頭上來。
所以，之前翁博西被教授暗殺，沃倫才會那麼氣憤。而亞歷山大之所以這麼做，純粹是破釜沉舟了。
但是亞歷山大就是不清楚，本來好好的一個潛伏計劃，為什麼會暴露！
而且伯恩失手之後，還與他斷了聯系。而在翁博西發表聲明後，現在全世界都知道有人去暗殺了翁博西，如果伯恩暴露了，並牽扯出幕後的CIA，他鐵定要完蛋，所以亞歷山大才會不顧一切殺了伯恩！
這才是真是的原因！
所以，他質問伯恩︰“我想知道在馬賽到底發生了什麼？你失手了，所以你要告訴我原因！”
伯恩十分糾結︰“我沒法告訴你，我記不起來了！”
“你激活了凱恩這個身份，你安排了與翁博西的見面，你找到了聯合安保公司，你闖了進去。見鬼，你竟然特麼的選擇游艇作為下手地點。”
亞歷山大最不能理解的就是伯恩為什麼要在游艇上下手，“你選了游艇，你選了日子，你跟蹤船員，食物燃料。你把時間和地點告訴了我們，你在那船上藏了五天。伯恩，你參與了這個計劃，你參與了！”
轟！
隨著亞歷山大的話，伯恩突然回想起自己去暗殺翁博西的記憶。的確，自己自作主張，沒有听從亞歷山大的話選擇潛伏，而是選擇直接去刺殺翁博西。
但不幸的是，伯恩在最後心軟了。在他拿槍頂著翁博西額頭的那一刻，他看見了他懷里的孩子，看見了他身邊熟睡的家人。
一種莫名的悸動在他心里糾纏，最終，他放棄了暗殺，頂著槍火跳入了海里。
回憶起自己刺殺翁博西的經過後，伯恩冷冷道:“我不想再干這個了。”
這也是他明目張膽去刺殺翁博西，而不是長久潛伏栽贓陷害他人刺殺翁博西的原因。
或許因為伯恩厭倦了，他想早點結束這一切。
現在，他準備繼續追尋自己的目的，于是伯恩威脅亞歷山大︰“杰森•伯恩死了，听見了嗎？他兩周前淹死了。你要告訴他們伯恩死了，明白嗎？我發誓，只要我覺得有人跟蹤我，我會不顧一切地把戰火燒到你家門口！”
說完，伯恩轉身離去，順便在離開的時候解決了兩個攔路的殺手。
當伯恩踩著尸體從高處降落，並在半空把另一個殺手一擊爆頭時，在場不少人都驚呼出來。
噢，這身手是真的要逆天了！
最後，伯恩消失在夜色之中。而在伯恩手下逃過一劫的亞歷山大，卻被另一個殺手無情擊殺。
而這個殺手，則是他的頂頭上司沃德派來的。
沃德已經知道伯恩退隱的決心，那翁博西一死，伯恩這個不穩定因素一排除，除了自己以外，那就只有亞歷山大一個人知道踏腳石計劃幕後的真相！
況且，伯恩根本就不知道踏腳石幕後的骯髒，他就是一個超級殺手而已，之前殺他純粹是怕刺殺翁博西的事兒暴露，牽扯到CIA，從而通過翁博西把幕後的骯髒牽扯出來。
現在翁博西死了，伯恩歸隱，那只要殺了亞歷山大就OK。
所以，殺了自己這個手下，沃德沒有絲毫心理障礙！
.......
不久後，面對著監察委員會，沃倫及其淡定地說道︰“踏腳石項目實際上已經被終止，本來主要是想把它設計成一種高級行動方案，我們本希望能把它變成一個出色的訓練平台，但說實話，對一項純理論訓練而言，這個代價也太高了。所以該項目到此取消。”
代價高？
那些錢還不是被你吃進肚里里去了？
看到這里，所有觀眾都不禁心生寒意。這個和善的大叔，殺了無數人，又殺了自己的手下，才圓回來這一個謊言，才讓這個謊言變得天衣無縫。
“那下面是什麼？”監察官說道。
“下面是黑煙斗項目.....”
踏腳石計劃破產後，那就再來一個類似的計劃繼續自己的貪污腐敗之旅。
沃德玩起這些，6得不行！
觀眾們倒吸一口涼氣，這些吃人不吐骨頭的官員，真特麼可怕！
這時，畫面一轉，來到一個碧海藍天的小島。
島上，歸隱的伯恩找到了瑪麗，二人熱情相擁。
這部電影電影還算是有了一個相對不錯的結局。
至此，諜影重重1在觀眾們的驚嘆聲中，落下了帷幕！