與此同時，CIA總部。
亞歷山大也得到了伯恩的消息。
亞歷山大︰“確定是他嗎？”
手下︰“是的，他去銀行了，是我們在銀行的線人匯報的。但他應該會想到我們在監視銀行。”
亞歷山大︰“我不知道...”
手下︰“我是說，他清空了保險箱里的東西，卻留下了槍，這是什麼意思？”
亞歷山大氣急敗壞︰“我說過我不知道，不過我更希望他已經死了！”
死了？？
觀眾們迷茫地眨眨眼，伯恩不是你的人麼，為什麼希望他去死？
眾人絲毫不懷疑，如果伯恩出現在亞歷山大的面前，他絕對會一槍崩了伯恩。
可這是為什麼？
因為伯恩刺殺翁博西的任務失敗，就要殺了他嗎？
還是說，亞歷山大擔心伯恩叛變，會泄露自己的計劃？
帶著不解，觀眾們繼續觀看電影。但心中的興趣，卻是愈發的濃郁了。
.....
鏡頭一轉，伯恩遇到了即將離開甦黎世的瑪麗（娜塔莉），並提出了搭順風車的想法。
在接過伯恩扔過來的一疊美金之後，瑪麗猶豫了良久，最終還是同意了。因為到達巴黎之後，伯恩還會再給一萬。
而現在的瑪麗，十分缺錢。
在伯恩搭上去往巴黎的順風車以後，CIA也開始針對伯恩布下了天羅地網！
亞歷山大激活了踏腳石計劃在歐洲的所有特工殺手，並全部派去暗殺伯恩。
其中，就有讓•雷諾扮演的儒雅殺手，代號︰教授！
巴塞羅那，德國漢堡，意大利羅馬...各大城市，所有特工齊出。
目標只有一個︰殺掉伯恩！
看到這殺手即將匯聚的大場面，在場所有觀眾的呼吸都急促了起來。
伯恩，能逃過追殺嗎？
“噢，天哪，這麼多殺手，全都去殺伯恩一個人....”
“他能扛得住嗎？”
“我看見羅馬那個特工，他也有很多國家的現金和護照，他們都是一類人！”
“真期待伯恩把他們打得落花流水的場面！”
.......
之後，伯恩和瑪麗在中途休息了一下，伯恩也借機展露了一下自己超強的判斷能力。
當听到伯恩能夠精確判斷出周圍環境的各種情況時，觀眾們再一次被震撼到了。
真是一次又一次的驚喜，不愧是頂尖的特工啊！
而CIA也通過監控，把瑪麗的身份鎖定，並且把她的資料交給了各個特工。讓他們務必把這二人一同鏟除掉！
但瑪麗這個單純的女孩兒卻還一直被瞞在鼓里，什麼都不知道。第二天，二人趕到了巴黎，並且來到了伯恩美國護照上的地址。
伯恩邀請瑪麗到他家里去做客。不過當伯恩到家時，卻發現這里幾乎都被搬空了，偌大的房間內，都沒什麼家具。
之後，伯恩通過調查巴黎女王飯店查自己的身份，當他說出杰森•伯恩的名字時，飯店查無此人的記錄，而他說出自己法國護照上的名字後，飯店查到了消息。
此人，已經在兩周前身亡！
自己在法國的身份死了？
而且自己家里的東西也被搬空了？
這是為什麼？
伯恩只感覺心里發涼，而就是這時，來自羅馬的殺手找上門來，想要刺殺伯恩。
但沒想到，即便他有槍，有武器，依然被伯恩給打成重傷。最後他為了不讓伯恩從自己這里或許更多的信息，殺手直接跳樓自殺。
這事兒驚動了法國警察，伯恩和瑪麗只好再次踏上了逃亡之路。
這次，伯恩上演了街頭飆車秀，見縫插針，九十度漂移，這些操作他是玩的滾瓜爛熟，把一群警察當成了亂飛的無頭蒼蠅來戲弄。
最終，警察裝毀了數量警車，受傷了無數警察，依然拿伯恩毫無辦法，只能眼睜睜地看著他瀟灑離去。
開玩笑，一流殺手都不是他的對手，警察靠著人數多就想懟死伯恩？
......
就在伯恩剛剛逃過了警察的堵截，這邊，翁博西也去了陳尸所。
作為一個領袖，被人刺殺了，他肯定要調查清楚是誰派來的人。
而CIA為了掩飾自己的計劃，弄了一具替代品尸體，以圖瞞天過海，騙過翁博西，讓他放棄繼續調查這件事情。
而這具尸體，就是伯恩在巴黎死去的那個“身份”，只是有一個可憐人做了替罪羊。
不過CIA失敗了，翁博西雖然不知道伯恩是誰，但他知道伯恩刺殺失敗逃離的時候，背後中了數彈。
而這具尸體的背後卻沒有彈孔。
CIA瞞天過海的計劃破產，沒有騙過翁博西。
亞歷山大慌了，如果翁博西繼續調查下去，把踏腳石計劃牽扯出來的話，那自己鐵定要玩兒完！
所以，亞歷山大派出“教授（讓•雷諾）”去刺殺翁博西。
只有死人，才能閉上嘴巴！
教授擅長狙擊，在他一套精密無縫的計劃下，翁博西被一槍爆了頭。
而當CIA的最高層得知這事兒後，十分驚怒。亞歷山大的上司沃德找到亞歷山大，希望他給出一個解釋。如果事情鬧大，知道踏腳石計劃的自己，也會吃不了兜著走！
而亞歷山大則把這一切推給了伯恩︰“是伯恩干的，我們幾乎可以斷定是他。他之前被分派了任務，但卻失手了，顯然他覺得自己必須完成任務。”
沃德將信將疑.....
........
而在另一頭，伯恩並不知道這一切，也不知道有人自算計他。
他還在一家小旅店里和瑪麗纏綿，二人一起經歷了這麼多逃亡，可以說已經不分彼此了。英雄和美人之間的感情，有時候來的就是這麼快。
之後，伯恩開始繼續調查自己的身份。
他通過巴黎女王飯店，拿到了自己法國身份“凱恩”的通話記錄。
然後，伯恩通過撥打通話記錄單上面的號碼，一個接著一個調查。
最後，伯恩查到了聯合安保公司，在這里，伯恩用凱恩的身份獲得了關于翁博西豪華游輪的一系列信息。
而伯恩現在已經確定，自己的確在法國有個凱恩的身份，而且法國這些人都只認識自己的凱恩身份，不知道伯恩身份。
但是根據瑪麗調查來的消息，凱恩已經死了，尸體就在陳尸所里面。
自己的尸體在陳尸所里面，搞錯沒？那我這個活著的凱恩又是怎麼回事？
觀眾們倒是會心一笑，因為他們知道這是CIA搞出來的偷梁換柱行動，雖然最後失敗了，沒有唬弄到翁博西。
但是伯恩不知道啊！
帶著不解，伯恩和瑪麗去到陳尸所，但是當他們趕到的時候，凱恩的尸體已經消失不見。沒看到尸體，但伯恩從陳尸所的來訪記錄中，查到翁博西曾經來過這里。
伯恩看見翁博西這兩個字，一下子便明白了許多。
他對瑪麗說道︰”翁博西去陳尸所看過凱恩的尸體，他也出現在了聯合安保的小冊里。所以，他知道實情！”
伯恩很自信自己的判斷，自己因為凱恩的身份和陳尸所還有聯合安保都有關系，而翁博西恰好也和這兩個地方有關系。
兩者一結合，伯恩判斷翁博西一定有自己不知道的實情。
但是當伯恩和瑪麗趕到翁博西住處外面時，才發現這里已經圍滿了警車。
翁博西，死了？
線索，難道就斷在了這里？
故事，變得撲朔迷離起來！