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話說藥師如來等人斬殺藥師佛，奪回了琉璃淨光世界。
藥師如來用無相神功吞噬了藥師佛的本源，就算是如來親臨，也看不出來他已經頂替了藥師佛，如來一來，他就可以在佛門臥底，待天地大劫，徹底與佛門撕破面皮時，對如來進行反戈一擊，讓如來肉痛。
齊天道人笑道︰“好好好！藥師佛已死，現在你已經掌控了琉璃淨光世界，我們可以更好進行算計了。不過，藥師如來你也要好好應付好如來，不要讓他看出破綻來，以免到時候功虧一簣。”
藥師如來道︰“這個自然！我用無相神功施展神通，融合了藥師佛的魂魄，已經得到了他的記憶，應付如來不會有絲毫破綻的，放心就是。”
這些真偽佛陀，本來就混淆氣運，藥師佛掌握了琉璃淨光世界，就是代表著佛門未來氣運，而今藥師如來奪回來，氣運便加持到了他的身上來，而藥師佛則應了劫難。
“既然你已經掌控了琉璃淨光世界，我們也該走了！不然一會兒佛門有人前來。”齊天道人說道。
藥師如來道︰“我還得在琉璃淨光世界當中收拾殘局，諸位去便是了。”
齊天道人道︰“走！”
一干人等皆是駕雲而起，各自散去，好像這件事從未發生過一樣。
藥師如來施展神通，修復整個琉璃世界，齊天道人持玄黃寶塔返回太清天，將之送還給老君。
卻說如來在靈山之上與悟空解惑，忽然感覺到心血來潮，但是卻又算不清發生了什麼事情。
便使不動明王前往琉璃淨光世界詢問藥師佛，而今藥師如來出世。隱藏三百年，如果要有什麼事的話，估計也是發生在琉璃世界當中。
不動明王降臨琉璃淨光世界。藥師如來出來迎接，道︰“明王世尊駕臨！有失遠迎！”
不動明王蹙眉道︰“你的山門怎麼都被毀了？”
藥師如來嘆息道︰“適才有幾個道門高手前來作亂。聲稱要討伐貧僧，貧僧正在靜修，他們便將貧僧山門打碎，然後遠遁而去，倒是死了不少手下人。”
不動明王點了點頭，道︰“而今藥師如來應運而生，乃是你的劫數，你卻要十分小心了。莫要讓藥師如來鑽了空子。把琉璃淨光世界給奪回去，這是你的根基，被人奪走，劫數會將你毀滅。”
藥師佛和淨光世界是相輔相成，劫運纏繞的，失去琉璃淨光世界，那自然就是應劫的時候了。
只是，不動明王看不出來，此人並非藥師佛，而是藥師如來。藥師佛早已經被眾人斬殺，魂魄也被他以無相神功所同化了，他一念之間可以變化為藥師佛。就算是聖人，都看不出來兩人有什麼差別。
“有勞不動明王費心了！貧僧自然會多加小心，不讓那藥師如來鑽了空子的，一旦發現不妙，便會求助世尊。”藥師如來笑道。
他談笑自如，無有一點不自在，與藥師佛並沒有什麼相異之處，不動明王壓根就看不出來。
不動明王道︰“毀壞你山門的那幾個道門高手是什麼來頭？”
藥師如來道︰“我也不知，這幾個道人用法寶蒙蔽了自身氣息。難以看得出來，不過。好似有那赤松子在里頭。”
不動明王冷哼一聲，道︰“一群偷雞摸狗之輩！尤其是這赤松子。仗著自己有三皇五帝撐腰，便肆無忌憚，斬殺彌勒尊者，而今又想殺你，實在是罪不可恕，待天地大劫來臨，本座要親自將他斬殺！”
佛門中人恨赤松子入骨，畢竟他斬殺了彌勒，這彌勒可是佛門的重要高手，被人斬殺，奇恥大辱。
“這是自然，我等與赤松子此人不共戴天，若是下次能遇到他，我也要傾力將之殺了！”藥師如來一臉殺氣，說道。
他這演戲的功夫實在是好，不動明王雖然心中有些疑惑，但卻也說不出，一股怪異的感覺繚繞在心頭，但看到藥師如來並沒有什麼異狀，只道是自己多心了。藥師如來心中卻暗暗冷笑，想著到時候怎麼斬殺這不動明王等人。
吠陀洲是佛教一個重要根基，也就是密宗佛教，里面的金剛尤為厲害，大日如來坐鎮，香火願力無窮，是佛門的重要戰力！
說起赤松子來，佛門中人都是咬牙切齒，對他之恨，甚至已經超過了各位道門高手以及三清。
藥師如來道︰“就不留明王世尊了，貧僧這里還得趕緊收拾殘局，把山門重建，這次要布好陣法，免得下次又有宵小之輩來山門作亂。”
不動明王頷首道︰“既然如此，那本座便去了！藥師佛以後要是遇到麻煩，記得通訊世尊。”
藥師如來道︰“多謝明王世尊提醒，貧僧謹記了。”
不動明王轉身而去，藥師如來這才松了一口氣，應付這不動明王可不容易，他才吞噬了藥師佛的三魂七魄，還在同化當中，有時候思維會出現一些混亂，要是說錯話了，那立刻就是死無葬身之地！他現在掌握琉璃淨光世界，只要慢慢凝聚眾生之力，把琉璃淨光世界煉化到自己的身體當中來，化為佛國，隨身帶著行動，那他就很快能夠修煉到半聖。
這才是真正的得天獨厚，生下來就是混元金仙一重天，三百年修煉到造物主，只要再將琉璃世界煉化入體，那就可以成就半聖！這等修行速度，實在是讓人瞠目結舌，也可見，佛門的氣運之深厚。
如來得知藥師佛無事，這才松了口氣，其實悟空也暗中松了口氣，他看如來溝通不動明王，還真怕琉璃世界那邊出了什麼漏子，那就難以收場了。
“斗戰勝佛對藥師如來此人有什麼看法？”如來問道。
“藥師如來，雖然號稱如來，但卻不過是我佛門毒瘤，想要佔據琉璃世界！此人恐怕乃是我佛門中佛陀惡念所生，所以才會稱為毒瘤。毒瘤必須要拔除，不然我們整個佛門都會受其危害！我若見得藥師如來，定然要一棍將之斬殺，衛我佛門道統。”悟空信誓旦旦地說道。
如來對外宣揚，藥師如來乃是佛門毒瘤，為千萬年流毒應運而生，並非佛心所向，是來禍亂佛門的，是罪惡之根緣，雖然號稱如來，但行的卻是邪惡之事，所以要務必斬殺！
說來可笑，真正的未來治世之尊卻成了本門毒瘤，人人得而誅之之人，簡直是滑天下之大稽。
如來听悟空如此說話，心中甚是寬慰，道︰“斗戰勝佛所說不錯，那藥師如來實乃我佛門中毒瘤一枚，必須要將之斬殺，不然的話，我佛門會被他禍害。此人與藥師佛的劫運相互糾纏，來日兩人必有一戰，不是你死，就是我亡。而今彌勒尊者被賊子赤松子斬殺，我佛門僅存一位未來佛可接替我的位子，所以務必要保住藥師佛。我看你慧根深厚，若是藥師佛之後，再無有人應運而生，那你便可接任藥師佛的位子。”
悟空心中暗暗好笑，還來日必有一戰？那邊早已經結束了戰斗，藥師佛已經被藥師如來以無相神功給吞噬，真正的藥師如來掌控了琉璃淨光世界，到時候真正的佛門氣運復甦，又會有劫運纏繞。
悟空肅然道︰“貧僧曾經罪惡滔天，幸虧有佛祖點化，不然還在執迷不悟。貧僧修為時間賞短，這治世之尊大位，卻是接替不得的。”
要成為治世之尊，要有大氣運，大功德才行，而悟空絕對是有大氣運之輩，若是成就了治世之尊，那麼佛門的氣運也會隨著他水漲船高，稱霸四方。不過，如來也就是這麼一說，雖然而今悟空已經被佛門經法潛移默化，信仰佛門了，但不可控性因素太多了，要選他當治世之尊，還是不大可能。
“道門可惡，竟然敢庇護藥師如來這毒瘤，把他藏到了不知何處去！此子必須斬殺，不然禍害我佛門道統！”悟空大聲道。
“是也！所以斗戰勝佛你要多多留意。我听聞藥師佛山門受到赤松子這些賊子攻擊，想來這賊子是要為藥師如來奪回琉璃淨光世界。藥師佛一人恐怕難以應付，而今你成就造物主，法力非同小可，你便去坐鎮琉璃世界，同藥師佛論道**修行，若有人敢來攻擊山門，便替藥師佛將之擒拿斬殺，揚我佛門威風，以免宵小之輩上竄下跳，亂我佛門人心。”如來淡淡說道。
悟空一听，便點頭道︰“既然是佛祖法旨，那弟子自然會尊崇的，以後便坐鎮琉璃世界當中，為藥師佛鎮壓四方，有宵小之輩上竄下跳，便直接斬殺！”
如來道︰“好，很好！我佛門雖然慈悲為懷，但卻也要明悟我不下地獄，誰下地獄的道理。”
悟空同如來談論許久，這才起身去琉璃淨光世界，而今的他已經得到了如來的信任，以後在佛門行事，更加如魚得水了。
一路筋斗雲疾行，很快就到了琉璃淨光世界中來，見著藥師如來。
話說如來使悟空前往琉璃淨光世界當中去坐鎮，以免宵小之輩作亂，藥師佛一人應付不來。
到了琉璃淨光世界當中，藥師如來道︰“原來是斗戰勝佛大駕光臨，有失遠迎！”
悟空冷笑道︰“藥師如來，你好大的膽子，竟然斬殺藥師佛，奪取琉璃世界！你騙得了世尊，卻騙不了我。”
藥師如來不由臉色大變，沒想到這斗戰勝佛一來就將自己的本來面目看穿了，不過卻還是搖頭道︰“斗戰勝佛說笑了，貧僧就是藥師佛，藥師如來而今不知在何處潛身縮首，哪里尋覓得到？倒是巴不得他來打我琉璃淨光世界的主意，這樣才好將他一體擒拿！以絕後患。”
悟空也就是嚇唬藥師如來一下，不由哈哈大笑道︰“藥師如來你還真是謹小慎微，不過如此甚好，以免如來起來疑心。”
藥師如來心驚膽顫，盯著他看了半晌，卻不說話。
悟空這才道︰“那齊天道人乃是貧道的分身，貧道現在不過是委身佛門之中，與你一般，是個臥底。”
藥師如來恍然大悟，已經汗流浹背，他們這等修為之人，毛孔閉塞，渾身精氣包含不泄，要流汗實在不是一件容易的事情。
“原來你就是齊天道人，倒是嚇死我也！不知你這次來琉璃淨光世界，是所為何事？”藥師如來問道。
“如來听聞你山門被毀，所以讓我前來坐鎮幫忙，哈哈！”悟空大笑道。
藥師如來也忍不住發笑道︰“如來倒還真是好心！那你就在這里坐鎮一段時間吧。”
悟空說道︰“你滅殺藥師佛，我對于劫運一道略微有所領悟，而今準備修煉一門神通，便取劫運真意！已經有了些許苗頭。還要你指點這劫運關鍵。”
藥師如來和藥師佛這一次分出勝負，一人得運，一人應劫。正是劫運之道。世間萬物，陰陽相成。劫運也是陰陽，劫是因，運是陽，劫是死，運是生。劫運，是一種強大的力量，用這種力量開闢神通，那就十分恐怖。
悟空此前走的都是別人的道。是通天教主開創的三教合一法門，而今他成就造物主，要找出最適合自己的道，這一次藥師佛和藥師如來爭斗，他感悟劫運糾纏，生死奧妙，想自創一門神通。
悟空自然也有劫運，如來殺他是劫，也是運，劫運相互糾纏。所以他才能有今生如此修為。
他一路走來，劫運不斷，但好在總能化解劫難。增強氣運，現在成就造物主，要開闢自己的神通，領悟自己的道，如此，才能夠有希望去證那渺茫無比的混元大道！
混元大道十分渺茫，現在的聖人，都是開天闢地以來就存在的，後天之人。想要證道成聖，無外乎于天方夜譚一般。
成聖。也是一種氣運，亦是一種劫難！聖人號稱萬劫不磨。這就是劫運。
“這琉璃淨光世界是因果，阿彌陀佛為我所建，使我降生其中，而藥師佛佔據我的世界，我在未降生的時候就與他產生了大因果。因果也是一種劫運，所謂善因善果，惡因惡報，藥師佛鳩佔鵲巢，就是惡因，所以會得惡報，當然，若是他把我斬殺，那這惡報就會變成他的氣運。戰勝了的劫數，那就是氣運！”藥師如來這一次斬殺藥師佛，也領悟了劫運的真諦，緩緩道出他與藥師佛所結的因果來。