在神秘人消失後的一段時間里，天界開始了艱難的重建工作。悟空等人雖然警惕著神秘人的再次出現，但生活也逐漸回歸平靜。然而，這份平靜僅僅維持了數月，一股詭異的氣息便悄然在宇宙中蔓延開來。
這天，悟飯正在新那美克星上與丹迪交流修行心得，天空突然變得陰沉。一團黑色的霧氣從宇宙深處飄來，那霧氣如同有生命般翻滾涌動，所過之處，星辰的光芒都被吞噬。丹迪的觸角微微顫抖，面露驚恐︰“悟飯，這股氣息...充滿了邪惡與腐朽！”
還沒等兩人做出反應，黑霧便以極快的速度籠罩了新那美克星。悟飯立刻運起周身氣勁，紫金色光翼迸發出耀眼光芒，試圖驅散黑霧。但黑霧卻像貪婪的惡魔，瘋狂侵蝕著光翼的能量，悟飯只覺一陣眩暈，意識逐漸模糊。丹迪拼盡最後的力氣，想要施展那美克星人的防護術，可黑霧直接穿透他的身體，他的雙眼瞬間被染成血紅色，身上冒出黑色紋路。
同一時間，地球、新貝吉塔星以及宇宙中多個星球都被這股黑霧侵襲。龜仙人正在龜屋教烏帕練武，黑霧突然涌入，龜仙人剛擺出防御姿勢，就被黑霧包裹，渾濁的眼中閃過一絲掙扎後，徹底被黑暗佔據。布爾瑪在膠囊公司調試新研發的探測器，黑霧順著通風口鑽進實驗室，她甚至來不及發出呼救，整個人便被黑霧吞噬，原本聰慧的眼神變得陰冷而瘋狂。
新貝吉塔星上，貝吉塔正在指導特蘭克斯修煉，黑霧如潮水般涌來。貝吉塔怒吼一聲，變身超級賽亞人之神，藍白色氣焰與黑霧踫撞，爆發出劇烈的能量波動。可黑霧不斷增殖，逐漸壓制住貝吉塔的氣焰。特蘭克斯想要上前幫忙，卻被另一股黑霧纏住，父子倆在黑霧中痛苦掙扎，最終還是沒能抵擋住侵蝕，渾身散發著魔性的氣息，眼神中滿是殺戮的欲望。
悟空此時正在亞德拉特星學習新的秘術，察覺到異常後，他立刻施展瞬間移動返回地球。然而，當他出現在神殿上空時，看到的卻是一片混亂。克林雙眼通紅，正揮舞著氣圓斬攻擊雅木茶；天津飯長出了惡魔般的犄角，與餃子激烈打斗；就連一向溫和的琪琪，手中也握著菜刀，面露猙獰地追著悟天和特蘭克斯。
“大家這是怎麼了？！”悟空瞪大了眼楮，不敢相信眼前的一切。他想要靠近眾人，卻遭到了瘋狂攻擊。克林的氣圓斬擦著他的臉頰飛過，天津飯的洞洞波直擊他的心髒，悟空只能狼狽躲避。就在他躲避攻擊時，一股熟悉又邪惡的氣息從背後襲來，他猛地轉身，只見比克渾身纏繞著黑色鎖鏈，眼中閃爍著冰冷的殺意。
“比克，清醒一點！是我啊！”悟空大喊。比克卻毫無反應，雙手凝聚出黑暗能量彈，朝著悟空轟來。巨大的爆炸產生的氣浪將悟空掀飛出去，撞在遠處的山上。悟空艱難地爬起來，身上布滿傷痕，他能感覺到，這股黑霧不僅讓大家身體發生了變化，連靈魂都被污染，徹底變成了沒有理智的魔族。
就在悟空不知所措時，一個聲音在他腦海中響起︰“孫悟空，來時空亂流找我，我可以幫你救回大家。”聲音低沉而神秘，卻讓悟空心中燃起一絲希望。他沒有絲毫猶豫，再次施展瞬間移動，朝著時空亂流的方向飛去。
當悟空抵達時空亂流區域，看到一個全身籠罩在黑袍中的身影懸浮在空中。黑袍下只露出一雙散發著幽藍光芒的眼楮，透著無盡的神秘感。“你是誰？為什麼說能救大家？”悟空警惕地問道。
黑袍人緩緩摘下兜帽，露出一張稜角分明卻充滿邪氣的臉︰“我叫摩羅，曾經也是宇宙中的強者。那團黑霧，是我利用黑暗能量球殘余力量制造的‘魔染之霧’，它能侵蝕一切生靈的意志，將其轉化為魔族。”
悟空憤怒地握緊拳頭︰“是你干的！為什麼要這麼做？！”摩羅冷笑一聲︰“因為我要復仇！當年我被封印，失去了一切。現在，我要讓整個宇宙都陷入黑暗！不過，你若願意幫我完成一件事，我可以給你解除‘魔染之霧’的方法。”
“我憑什麼相信你？！”悟空咬牙切齒地說。摩羅攤開雙手︰“你沒有選擇，孫悟空。你看看宇宙，現在還有多少人沒被感染？如果你不答應，你的家人、朋友，就只能永遠淪為魔族。”
悟空沉默了，他想到琪琪、悟飯、悟天，還有所有被黑霧侵蝕的伙伴，心中一陣絞痛。“好，我答應你！但你要是敢騙我，我就算拼了命也要讓你付出代價！”
摩羅滿意地點點頭︰“我要你去宇宙深處的禁忌之地，幫我奪取一件寶物——混沌之心。那是蘊含著宇宙本源混沌之力的神器，有了它，我就能掌控整個宇宙。等你拿到混沌之心，我自然會給你解除‘魔染之霧’的辦法。”
悟空沒有多說，轉身便朝著禁忌之地飛去。一路上，他看到無數星球被黑霧籠罩，曾經生機勃勃的世界變得陰森恐怖，這更加堅定了他拯救大家的決心。
當悟空來到禁忌之地，這里彌漫著濃厚的混沌能量，空間扭曲，時不時有黑色閃電劃過。地面上插著各種古老的武器，散發著令人心悸的氣息。悟空小心翼翼地前進，突然，地面裂開，一只巨大的混沌魔獸破土而出。它身形如山，渾身長滿尖刺，口中噴出的火焰竟呈現出詭異的紫色。
“來得正好！”悟空大喝一聲，變身超級賽亞人之神，金色氣焰與紫色火焰踫撞，產生強烈的沖擊波。混沌魔獸揮動巨爪，朝著悟空拍來，悟空靈活閃避，同時凝聚元氣彈。“去吧！”巨大的元氣彈砸向魔獸，魔獸發出痛苦的咆哮，身體被炸出一個大洞。然而，魔獸傷口處很快便涌出黑色物質，將傷口愈合。
悟空意識到這只魔獸的難纏，他收起輕視之心，開始尋找魔獸的弱點。在一番激烈的戰斗後，悟空發現魔獸的心髒處有一處顏色較淺的部位，那應該就是它的弱點。他集中全身力量，一記龜派氣功直擊魔獸心髒。混沌魔獸發出震天的慘叫，身體轟然倒地。
打敗魔獸後，悟空繼續前進。穿過一片混沌森林，他終于看到了懸浮在空中的混沌之心。那是一顆散發著七彩光芒的水晶球，卻又隱隱有黑色霧氣纏繞，仿佛在訴說著它的危險。悟空剛要伸手去拿，周圍突然出現無數幻影，這些幻影都是他曾經打敗過的敵人︰弗利薩、沙魯、魔人布歐...
“孫悟空，你注定失敗！”弗利薩的幻影冷笑著。沙魯的幻影也發出刺耳的笑聲︰“混沌之心豈是你能染指的！”悟空深吸一口氣，周身氣勁暴漲︰“不管你們是真是假，都阻止不了我！”他揮舞著拳頭，沖向幻影，每一拳都帶著堅定的信念。幻影在他的攻擊下紛紛破碎。
當悟空終于握住混沌之心的瞬間，一股強大的力量涌入他的身體。混沌之心的七彩光芒與他體內的氣相互融合，同時，黑色霧氣也開始侵蝕他的意識。悟空咬緊牙關，憑借著頑強的意志，與黑暗力量抗爭。他的腦海中不斷浮現出家人和伙伴的笑容，這成為了他抵抗黑暗的力量源泉。
經過一番激烈的斗爭，悟空終于壓制住黑暗力量，帶著混沌之心返回時空亂流。摩羅看到混沌之心，眼中閃過貪婪的光芒︰“很好，孫悟空，把它給我！”悟空握緊混沌之心︰“先把解除‘魔染之霧’的方法給我！”
摩羅冷哼一聲︰“你覺得我會遵守約定？等我吸收了混沌之心的力量，整個宇宙都將是我的！”說完，他雙手張開，周圍的黑暗能量瘋狂匯聚，朝著悟空攻來。悟空這才意識到自己被騙，他憤怒地咆哮︰“摩羅！你會為此付出代價！”
一場關乎宇宙命運的終極對決，在時空亂流中拉開帷幕...而被黑霧侵蝕的z戰士們，此刻正朝著時空亂流的方向集結，他們的眼中只有殺戮，即將給悟空帶來更大的危機。