月球的能量風暴平息後，宇宙卻陷入更深層的紊亂。熵蝕會利用竊取的星孩能量，在人馬座旋臂深處激活了十二座“混沌增幅塔”。這些由黑色晶體堆砌的巨型建築如同寄生在宇宙脈絡上的腫瘤，不斷吞噬周邊恆星的光能，將其轉化為能瓦解物質結構的熵化射線。首批遭受攻擊的是“翡翠星鏈”——三顆以生態醫療聞名的星球，在射線籠罩下，植被瞬間碳化，水體沸騰成毒霧，數十億居民的身體化作閃爍的量子塵埃。
自由殘缺派的偵查衛星捕捉到異常能量波動時，領袖的生命已進入倒計時。他躺在由甦瑤藥晶碎片改造的治療艙中，皮膚下的血管泛著詭異的紫黑色，卻強撐著啟動全息會議︰“熵蝕會的目標是徹底打破宇宙的熵平衡...他們想讓一切回歸混沌原點。” 話音未落，劇烈的咳嗽震得治療艙警報大作，年輕學者看著監測儀上的數據，眼眶通紅︰“您的基因鏈已經斷裂超過70...” 領袖卻抬手阻止他繼續說下去︰“去聯系白焰，星孩融合時的能量共振，或許能...” 話未說完，他的意識已陷入黑暗。
白焰在量子空間獲得的光蓮之力，正以意想不到的方式覺醒。當他駕駛飛船途經“銹骨星域”時，探測到一艘被熵化射線重創的醫療艦。艦體外殼布滿蛛網狀裂痕，內部數百名醫護人員的身體正在經歷分子級解構。白焰眉心的光蓮突然迸發強光，他本能地伸出手掌，光流所及之處，消散的分子重新聚合，斷裂的基因鏈自動修復。但治療結束後，他劇烈嘔吐出帶著星光的血沫——光蓮之力在對抗熵化能量時，正在反噬他的本源。
火種重啟派內部也在經歷分裂。部分科學家在研究《醫道起源》後，對“完美基因”理念產生動搖。首席科學家的得意門生艾琳，偷偷將實驗室里的歸墟引擎殘片數據上傳至公共星域︰“我們都成了瘋狂計劃的幫凶！看看這些數據，引擎最初的設計目的是守護生命多樣性！” 她的舉動引發軒然大波，支持者與頑固派在總部大樓爆發械斗。混亂中，一枚失控的能量彈擊中存放星孩胚胎研究資料的服務器，珍貴數據在爆炸中化作紛飛的光屑。
熵蝕會的首領此時正在混沌增幅塔核心，將收集的星孩能量注入一個巨大的胚胎狀容器。容器表面浮現出類似星孩的輪廓，卻纏繞著毒蛇般的黑色紋路︰“真正的星孩被那些蠢貨搞成了四不像...只有我能孕育出純粹的混沌之種。” 他癲狂地大笑時，十二座增幅塔同時亮起猩紅光芒，一道橫跨百萬光年的熵化光束射向銀河系中心的黑洞——他們企圖用黑洞的吞噬力，將整個宇宙拖入熵寂深淵。
自由殘缺派聯合新倒戈的火種重啟派科學家，組成“逆熵聯盟”。他們發現，若要阻止熵化光束，必須在其路徑上建立能量對沖場。洛影主動請纓帶隊執行最危險的任務——在光束必經的“碎星帶”部署三百座量子共振器。碎星帶布滿因超新星爆發形成的高速隕石，每顆隕石都攜帶著足以摧毀戰艦的動能。當聯盟艦隊進入區域時，隕石群突然產生詭異的磁場變化，無數隕石表面浮現出熵蝕會的蛇形圖騰，如同一支機械蟲群撲向艦隊。
白焰在收到聯盟求援信號的同時，再次進入量子空間。這一次，融合後的星孩以少年形態現身，他的左眼閃耀著治愈之光，右眼卻流淌著黑色能量︰“熵蝕會觸踫了不該觸踫的禁忌...混沌之種若誕生，連我也無法阻止宇宙坍縮。” 星孩將一縷融合能量注入白焰體內︰“去找齊散落在宇宙的‘醫道星核’，它們是初代神農為平衡熵增留下的後手。” 白焰甦醒時，導航系統自動標記出七個閃爍的坐標，最近的一個，竟指向被熵蝕會摧毀的翡翠星鏈廢墟。
在翡翠星的焦土上，白焰找到了第一顆醫道星核。這顆拳頭大小的晶體內部，封存著無數生命的記憶與治愈力量。當他握住星核的瞬間，數以萬計的全息影像在廢墟上空浮現︰孩童歡笑奔跑、醫者徹夜救治、情侶在星空下相擁...這些美好的畫面卻在熵化射線的侵蝕下化作灰燼。白焰攥緊星核，指甲深深刺入掌心︰“不會再有更多犧牲了。”
此時，熵化光束已逼近銀河系中心。逆熵聯盟的量子共振器僅完成60部署，洛影看著蜂擁而至的隕石蟲群，咬牙啟動戰艦的自毀程序︰“所有人員撤離！我來為共振器爭取時間！” 巨大的爆炸在碎星帶炸出絢麗的火花，為後續部署爭取到了關鍵的三分鐘。而在混沌增幅塔核心，混沌之種即將破繭，它的第一聲“啼哭”，讓整個宇宙的星光都黯淡了一瞬。
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