概念病毒的余波尚未平息，宇宙本源核心處傳來異常的能量脈動。裂縫文明的量子監測站發現，維持宇宙運轉的“本源核心”出現暗紫色裂痕，如同被腐蝕的心髒般緩慢跳動。不完美之種殘存的根睫在接觸到本源波動後瞬間碳化，空氣中彌漫著燒焦的概念氣息︰“孢子滲透進了宇宙本源...這是創世以來最致命的裂變！”
秦逸的平衡印記突然炸裂成無數碎片，又在劇痛中重組為扭曲的螺旋狀。他的意識被強行拽入一片混沌與秩序交織的虛域，這里漂浮著宇宙誕生時的原始粒子，卻被暗紫色的熵寂能量浸染。熵寂意識化作粒子間的陰影，聲音帶著創世者般的威壓︰“秦逸，當宇宙本源開始排斥文明的存在，你還能守護什麼？”領域內投影出末日場景︰恆星因本源失衡而集體坍縮，行星在規則紊亂中被撕成夸克塵埃。
覺醒者們意識到，常規的防御體系在本源層面毫無作用。經過緊急磋商，他們決定啟動禁忌方案——將全宇宙文明的核心能量，注入由初代神農遺留的“本源調和儀”，制造出能與熵寂抗衡的“共生本源體”。但調和儀需要在宇宙本源核心附近啟動，意味著“守源號”戰艦必須直面最危險的區域。
剛接近本源核心，守源號便遭遇“本源畸變體”的阻攔。這些怪物由被污染的本源能量凝聚而成，形態介于物質與概念之間︰有的化作能改寫物理常數的“法則之影”，揮手間引力與電磁力轟然顛倒；有的變形成吞噬秩序的“混沌之潮”，所過之處熵值無限攀升。殘缺派修士燃燒本源之力結出“混元歸一陣”，卻發現陣法在接觸畸變體的瞬間，反而加速了自身的本源流失；裂縫文明傾盡能源發射的“量子本源彈”，被直接轉化為強化敵人的養料。
“它們的弱點在于本源能量的排斥反應！”小女孩將機械心髒與全宇宙文明的生命火種連接，啟動“本源共鳴熔爐”。金色的共生能量與暗紫色的熵寂能量劇烈踫撞，產生的沖擊波震碎了部分畸變體的核心。秦逸趁機揮動融合武器，斬出“逆命守源斬”，劍刃上重組的平衡印記迸發本源之光，暫時撕開了防線。
突破阻攔後，守源號抵達本源核心。那里的景象令人窒息︰暗紫色的熵寂能量如同癌細胞般侵蝕著本源核心的每一道紋路，熵寂意識化作纏繞核心的巨蟒，獰笑著注入腐化之力︰“當本源徹底裂變，所有文明都將成為宇宙的棄子！”
本源核心突然釋放“熵寂裂變波”，暗紫色的能量震蕩直接作用于宇宙的根基。空間開始像破碎的鏡面般崩塌，時間線扭曲成莫比烏斯環，所有基于本源規則的科技與法術全部失效。守源號的船員們的身體開始出現粒子化分解，意識在本源紊亂中逐漸模糊。千鈞一發之際，秦逸引導全宇宙文明對生存的渴望、對秩序的堅守，將共生之力注入調和儀，在虛空中凝聚出“永恆本源壁壘”。
在與熵寂的終極對抗中，秦逸的意識深入本源核心。他發現孢子的終極目標是讓宇宙回歸“無意義的初始”，通過本源裂變抹除所有文明存在的痕跡。“文明的存在，就是宇宙賦予自身的意義！”他將共生本源體的能量、初代神農的調和智慧，以及全宇宙生命的存續意志融合，發動“逆命本源重鑄”。
光芒刺入本源核心的瞬間，整個宇宙劇烈震顫。熵寂意識發出震耳欲聾的怒吼，消散在能量風暴中。本源核心開始緩慢愈合，但在徹底修復前，一道暗紫色的孢子流突破防線，射向宇宙最隱秘的角落。秦逸望著逐漸穩定的本源核心，握緊手中殘缺的武器——這場關乎宇宙生死的本源之戰，只是熵寂與共生無盡博弈的又一個起點。
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