暗紫色光束如瘟疫般擴散至各個星系，裂縫文明的監測網絡瞬間癱瘓。殘存的數據顯示，那些被光束擊中的星球，地殼下正滋生出詭異的紫色脈絡，其蔓延速度遠超常規生物的生長周期。不完美之種的藤蔓突然集體蜷縮，葉片滲出腐蝕性的黑色汁液，林婉的星光在花蕊中閃爍出不詳的血色︰“這些脈絡...是失衡種子的根系，它們在汲取星球的本源能量！”
秦逸的平衡印記泛起灼燒般的劇痛，他的意識被拽入一片由破碎星圖構成的空間。無數暗紫色的種子懸浮其中，黑袍人的意識如霧氣般纏繞著種子︰“秦逸，你以為斬斷核心就能阻止失衡？這些種子早已植入文明的根基。”隨著他的低語，種子紛紛裂開，釋放出的黑霧中浮現出文明墮落的幻象——機械文明將整個星系改造成吞噬能量的巨構，修真文明為爭奪資源發動毀天滅地的戰爭。
覺醒者們緊急啟動“清種計劃”，駕駛配備了量子掃描儀的“淨界號”戰艦奔赴受感染的星域。然而，剛進入人馬座β星系，飛船便遭遇“畸變守衛者”的阻攔。這些怪物由被污染的星球生態與失衡能量融合而成，形態怪誕至極︰有的化作長滿金屬藤蔓的巨型樹人，每片葉子都能發射腐蝕光線；有的分裂成無數液態生物，可隨意重組形態並吞噬攻擊。殘缺派修士結出“萬劫混沌破”，黑色的混沌能量卻在接觸怪物時被轉化為強化它們的養分；裂縫文明發射的“維度裂解彈”，反而引發了空間的連鎖崩塌。
“它們的弱點是能量共鳴頻率！”小女孩將機械心髒與不完美之種的幼苗相連，啟動“生命頻率同步”程序。金色的共振波穿透戰場，部分守衛者的動作出現僵直，顯露出體內跳動的暗紫色核心。秦逸趁機揮動融合武器，斬出“逆命清肅之光”，劍刃上的共生紋路與平衡印記交相輝映，成功擊碎了部分守衛者。但每摧毀一個怪物，其殘骸中的紫色能量便會注入地底，加速失衡種子的生長。
突破防線後，眾人抵達被感染星球的地表。眼前的景象觸目驚心︰城市淪為廢墟，植物扭曲成尖銳的骨刺，天空中漂浮著由暗紫色能量構成的漩渦。在星球核心處，一顆巨大的失衡種子正在膨脹，其表面浮現出與黑袍人意識相同的紋路。“想要阻止種子萌發，必須同時摧毀所有根系！”裂縫文明的科學家分析道，“但這些根系已滲透星球的每個角落，常規攻擊只會加速爆炸。”
千鈞一發之際，秦逸引導共生之力，在虛空中構建出“生命共鳴網絡”。他將全宇宙文明對自然的敬畏、對生命的尊重注入網絡，金色的光芒順著紫色脈絡蔓延，逐漸淨化被污染的能量。然而，當光芒觸及種子核心時，黑袍人的意識突然爆發︰“太晚了！”種子劇烈震顫，釋放出“失衡終焉波”，所到之處，物質被分解成秩序與混沌的混亂狀態。
淨界號在波流中搖搖欲墜，船員們的身體開始出現量子化分解。關鍵時刻，小女孩將機械心髒與星橋的所有能量連接，啟動“希望共振矩陣”。全宇宙文明的祈願化作璀璨的星河，與終焉波激烈踫撞。秦逸抓住機會，將共生之力、不完美之種的淨化能量，以及初代神農殘留的秩序本源全部注入武器，斬出“逆命共生淨化”。
光芒擊碎種子的瞬間，整個星球發出痛苦的轟鳴，紫色脈絡開始崩解。但在種子徹底毀滅前，無數細小的孢子從核心噴射而出，飛向各個星系。黑袍人的意識在消散前發出狂笑︰“失衡的循環...永不停息！”戰斗結束，受感染的星球逐漸恢復生機，但秦逸望著漫天飄散的孢子，深知這場與失衡種子的博弈才剛剛開始。不完美之種重新綻放出新芽，藤蔓纏繞在淨界號上，仿佛在傳遞新的希望——只要共生的信念不滅，就永遠有對抗黑暗的力量。
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