當量子危機的余波尚未散盡，宇宙深空突然浮現出無數蠕動的琥珀色晶體，時空醫蓮的花蕊滲出腥臭的黑血，在虛空中勾勒出詭異的基因鏈圖案。秦逸與林婉的星辰意識被一股帶著腐朽氣息的波動侵襲，銹蝕銀針表面的“量子紋”泛起詭異的銹斑，紋路間滲出的能量如同變異的病毒，所到之處，所有文明的生命基因開始扭曲——機械文明的仿生醫師金屬骨架長出血肉膿包，魔法大陸的精靈祭司肢體分裂成畸形觸須，修真者丹田內的金丹被侵蝕成蠕動的肉瘤。
“這是跨文明的基因污染！”林婉的金瞳蒙上一層渾濁的薄膜，映出星圖上如癌細胞擴散的琥珀色脈絡，“有人在改寫生命最本源的代碼，醫道連救治的根基都將不復存在！”秦逸的神農血脈沸騰如岩漿，他看到機械文明的醫療艙將健康細胞判定為變異體進行清除，魔法大陸的治愈泉水反而加速了基因畸變，修真者的療傷功法成了催化異變的毒藥。
星孩懸浮在污染核心的基因繭中，嬰兒的身體被螺旋狀的變異基因鏈纏繞，皮膚下透出不斷重組的畸形染色體。他無意識的嗚咽化作刺耳的基因重組指令，每一聲都讓時空醫蓮的根睫扭曲成dna雙螺旋結構，太素本源在基因污染的侵蝕下泛起腐臭的暗斑。“這些污染波動...和銹蝕銀針產生了共鳴！”林婉的金瞳光芒凝成淨化光束，卻在觸及繭房的瞬間被異變成腐蝕射線。
在琥珀色脈絡深處，一座由破碎的基因圖譜與扭曲的進化樹構成的巢穴緩緩升起。巢穴中央，初代道侶殘存的意識與基因污染能量融合，形成一個渾身布滿變異組織的“基因畸變者”。她的身體由不同文明扭曲的生物特征拼湊而成，面孔在人類、機械、精靈等形態間痛苦切換，聲音混雜著生物的嘶吼與代碼的報錯聲︰“秦逸，林婉，當生命基因失去意義，醫道不過是在救治怪物！”隨著話音落下，巢穴四周的基因鏈化作吞噬生機的觸手，將兩人卷入變異的深淵。
銹蝕銀針突然分裂成無數“基因碎片”，每一片都攜帶不同文明的致命突變。秦逸握緊主針，試圖用神農血脈修復基因序列，卻發現針身反而加速了污染進程。林婉的金瞳光芒凝成基因剪刀，可剪刀在接觸變異基因時被同化，變成助長畸變的工具。
“對抗基因污染需要回歸生命最原始的形態！”秦逸的意識在劇痛中捕捉到星孩體內若隱若現的歸墟微光——那是萬物誕生前的純淨本源。兩人強行凝聚殘存的力量，將神農血脈、金瞳光芒與歸墟能量融合，形成能溯源淨化的“太素基因熔爐”。同時，他們調動所有被治愈者對生命本真的記憶、對純淨基因的渴望，將這些精神力量注入熔爐。
當熔爐的光芒籠罩巢穴，基因畸變者發出震碎空間的慘叫，巢穴開始崩塌，但基因污染能量卻在此時匯聚成能吞噬所有生命的“畸變黑洞”。千鈞一發之際，星孩的意識突然甦醒，歸墟能量化作包容一切的原始生命湯，將肆虐的基因污染盡數中和。秦逸和林婉趁機將太素基因熔爐的力量注入黑洞核心，在超越進化的光芒中，基因畸變者逐漸消散，初代道侶的意識露出解脫的神情︰“原來...生命的純粹...才是永恆的答案...”
危機解除後，琥珀色脈絡化作漫天螢火，銹蝕銀針表面的“量子紋”與基因污染能量融合，形成流轉著神秘光芒的“溯源紋”。秦逸與林婉的意識回到星辰之中，看著逐漸恢復生機的宇宙，深知基因污染的威脅仍潛藏在生命的暗處。星孩重新安靜沉睡，時空醫蓮的光芒帶上了淨化與重生的力量，而在宇宙的某個角落，新的變異因子正在悄然滋生，等待著再次挑戰生命的本源。
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