熵化艦隊覆滅後的宇宙迎來短暫安寧，破碎的星帶間漂浮著戰斗殘骸，卻也孕育著新生的契機。翡翠星上，萬象共生樹王在吸收了熵盾淨化後的能量後，枝干上抽出晶瑩剔透的新芽，每片嫩葉都流轉著黑白金三色光暈，宛如將熵盾與無界醫心的力量凝于草木之間。明淵將培育出的新芽分發給各文明使者，這不僅是醫療技術的革新，更象征著宇宙從對抗走向共生的新起點。
機械文明的鋼樞七號率先響應，將新芽基因嵌入城市的能量中樞。原本冰冷的金屬建築表面開始生長出柔性的共生脈絡，破損的零件會被自動修復，而多余的能量則被轉化為供居民使用的清潔能源。魔法文明的霧隱群島上，巫師們將新芽煉化成“平衡魔杖”，當治愈咒語與傷害咒語同時施展時，魔杖頂端的嫩芽會綻放光芒，將沖突的魔力調和成滋養萬物的靈霧。
然而，表面的繁榮下暗流涌動。望舒在冥想時，熵盾的黑白光芒總會不受控制地劇烈閃爍，他的意識中頻繁閃現歸墟之主的獰笑。更令人不安的是，宇宙黑市中悄然流傳起“熵核碎片”的交易，黑市商人宣稱這些碎片能賦予持有者操控生死的力量，實則是歸墟殘識精心布置的誘餌。
無醫書院的監測系統捕捉到異常的熵能波動，在獵戶座懸臂的一顆廢棄星球上，出現了非法培育逆種共生樹的跡象。明淵帶領精英小隊前往調查，卻發現這里早已被改造為“熵化教團”的秘密據點。教團成員將自身改造成半機械半植物的形態，胸口瓖嵌著疑似熵核碎片的紫色晶體，他們高呼著“疾病即真理”的口號，向小隊發動瘋狂攻擊。
戰斗中，一名教團首領竟能操控熵能形成鎖鏈，將銀針束縛並腐蝕。關鍵時刻，望舒揮動熵盾，黑白光芒所到之處，熵能鎖鏈瞬間崩解。但當他試圖淨化教團成員體內的熵核碎片時，碎片突然爆炸，釋放出的暗物質沖擊波險些將整個星球撕裂。僥幸逃生的小隊帶回了重要線索——教團背後的資助者，是一個自稱為“熵界守望者”的神秘組織。
翡翠星的科研室內，青崖帶領團隊對繳獲的熵核碎片進行分析，驚人地發現碎片中殘留著望舒的量子符波動。“有人在故意混淆視听，將矛頭引向你。”青崖的臉色凝重，“這個‘熵界守望者’恐怕早就盯上了熵盾的力量。”而此時的望舒，正獨自前往初代道侶記憶中提及的“熵寂之地”，他瞞著眾人出發，只為搶在敵人之前找到終極密鑰，卻不知自己早已踏入敵人設下的陷阱。
在熵寂之地，望舒遭遇了前所未有的精神攻擊。荒蕪的星球表面不斷浮現他內心深處的恐懼︰被歸墟能量吞噬後成為毀滅宇宙的惡魔，親眼看著無醫書院在熵潮中化為灰燼。熵盾的光芒在此處變得微弱，黑白雙色竟開始相互排斥。千鈞一發之際，林婉與秦逸的意識碎片穿越時空而來，金色光芒驅散黑暗，銀針組成的古老醫陣護住望舒的心脈。
“熵寂之地並非終點，而是考驗。”林婉的聲音在虛空中回蕩，“真正的密鑰，藏在每個生命對抗熵增的勇氣里。”望舒頓悟，他不再執著于尋找實體密鑰，而是將熵盾的力量與自身信念融合，在星球表面刻下象征無界醫心的符文。符文亮起的瞬間，整個熵寂之地的地貌開始重塑，一座由能量構成的古老祭壇緩緩升起，祭壇中央，懸浮著一枚與熵盾共鳴的“共生核心”。
但望舒還未來得及觸踫核心，一道暗紫色的光束突然襲來，擊碎祭壇。熵界守望者的首領現身，他的身軀由無數熵化生物拼接而成，手中握著一把散發著死亡氣息的鐮刀。“把熵盾交出來，少年。”首領的聲音充滿誘惑，“有了它，我就能讓宇宙徹底擺脫虛假的平衡。”一場關乎熵盾歸屬與宇宙未來的決戰，就此拉開帷幕……
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