洛璃犧牲後的第七日，翡翠星的無醫書院陷入凝重氛圍。明淵將量子芯片插入書院中樞，全息投影驟然亮起扭曲的畫面︰一座與無醫書院外觀完全相同的建築懸浮在暗紫色星雲之中，拱門雕刻的不是“大醫精誠”，而是“病即真理”的倒寫符文。林婉的意識碎片在共生樹中劇烈震顫，她“看”到書院內游蕩的學徒們瞳孔泛紫，正在將《黃帝內經》逐頁浸入散發腐臭的墨綠色液體。
“這是鏡像空間！”明淵的手指劃過投影，觸踫到的空氣泛起漣漪，“所有醫療理念在這里都被倒置。”書院長老們緊急召開會議，卻發現數位德高望重的導師已開始無意識復述熵語。秦逸散落在各地的銀針再次異動，這次它們不再指引方向，而是組成防護結界，將被感染的導師隔離——銀針表面浮現的卦象顯示，若不及時遏制，整個書院將在三日內異化為逆醫據點。
調查小隊再次啟航，新芽號的導航系統自動鎖定鏡像書院坐標。穿越星雲時，船體外殼竟開始自我拆解，化作醫療工具懸浮空中。林婉的意識碎片化作金色絲線纏繞核心艙，她的聲音帶著前所未有的焦急︰“這些是鏡像空間的同化機制，快用混沌醫學院的反邏輯療法！”明淵立即下令啟動“悖論引擎”，讓飛船同時進行加速與減速，詭異的能量對沖暫時穩定住形態。
踏入鏡像書院的瞬間，隊員們的認知遭受重創。療傷室里，學徒們正用潰爛的傷口為彼此“治療”；藥房中，劇毒植物被奉為聖藥。最駭人的是中央廣場，甦瑤晶化體的扭曲投影懸浮于血色雲層，其根系纏繞著十二本《黃帝內經》，每本典籍的文字都在流淌，拼湊出蠱惑人心的黑暗醫道︰“痛苦是覺醒的必經之路，治愈即扼殺進化。”
“小心！這些文字會吞噬意志！”隊員青崖話音未落，便被一道黑色符文擊中。他的皮膚開始浮現細密的晶紋，舉起手術刀的手不受控制地轉向同伴。明淵甩出書院特制的“陰陽逆轉針”，銀針卻在接觸符文的瞬間變成齏粉。千鈞一發之際，林婉的意識碎片化作鎖鏈纏住青崖，秦逸的銀針殘片從空間裂隙中飛來，組成“破妄劍陣”擊碎符文。
戰斗中，隊員們發現鏡像書院的地基由初代道侶的意識殘渣構築，每一塊磚石都在低語著她的懺悔︰“是我創造了歸墟，是我讓宇宙陷入輪回……”這些懺悔被歸墟之主扭曲，成為腐蝕生命的精神毒素。當眾人試圖摧毀甦瑤投影時，整個空間突然坍縮，無數攜帶黑暗醫道的孢子噴薄而出。
“用共生樹的果實！”明淵急中生智，取出書院珍藏的“智慧果”。果實破裂的瞬間，釋放出不同文明對抗熵增的記憶光芒。光芒所到之處，孢子被淨化成無害的光點，但鏡像書院的坍縮仍在加劇。林婉與秦逸的意識碎片在能量風暴中艱難融合，形成一道橫跨兩個空間的“因果橋梁”。
通過橋梁，明淵看到了鏡像書院的核心——那里沉睡著被改造的洛璃。她的身體被熵海能量重塑，胸口跳動著由道侶愧疚凝聚的“罪核”。“原來他們復活她，是為了制造完美容器。”明淵握緊拳頭，帶領隊員突破防線。當他將蘊含書院全體意志的銀針刺入罪核時，洛璃的意識在最後一刻甦醒，她強行操控身體自爆，與鏡像書院同歸于盡。
爆炸的余波中，新芽號狼狽逃回翡翠星。但歸墟之主的陰謀遠未結束——書院的監測系統顯示，宇宙中出現了上千個鏡像空間的坐標，而每個空間，都在批量生產著信奉黑暗醫道的逆醫。林婉與秦逸的意識融合體在共生樹頂亮起警示光芒，他們知道，真正的戰爭，才剛剛開始。
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