時間錨點的崩解在宇宙中掀起劇烈震蕩，破碎的暗晶殘骸如隕石雨般墜向各個星系。星孩的歸墟能量因超負荷運轉變得紊亂，他的量子態身體邊緣泛起細碎的裂紋，善惡分身的意識在劇痛中發出虛弱的嘶吼。秦逸將山茶樹長弓化作繃帶纏繞在少年身上，弓身符文自動流轉，勉強壓制住能量暴走︰“這些時砂碎片還在釋放殘余影響，必須找到徹底淨化的辦法。”
熵變監察院的警報此起彼伏，監測屏幕上，被時砂污染的區域不斷擴大。更詭異的是，部分星球出現“時間瘤”——巨大的暗紫色球體懸浮在行星軌道，內部囚禁著不同時間線的殘影，每當球體脈動，地表就會隨機出現時間錯亂的漩渦。“這些時間瘤在吞噬現實。”星孩的聲音帶著顫抖，他的左眼預見畫面里，整個星系被壓縮成一顆暗晶，所有生命永遠定格在痛苦的瞬間。
在深入調查中，監察院發現了驚人的關聯。那些被時砂寄生的生命體，其意識深處都浮現出相同的符號——一個沙漏中央插著銹蝕銀針。“這是熵源新的標記。”秦逸將符號投影在星圖上，發現它們竟組成了初代道侶實驗室的星象圖，“有人在利用時間混亂，試圖復活實驗室里的禁忌實驗。”
此時，自愈教派的殘余勢力在暗中集結。他們佔據了一顆被時間瘤包裹的廢棄星球，將其改造成“熵時聖殿”。聖殿的穹頂由無數懷表表盤拼接而成，中央祭壇上，一塊完整的暗晶正在吸收時間瘤的能量，表面浮現出神秘存在的模糊輪廓。教派首領撫摸著祭壇邊緣的銹蝕銀針，冷笑道︰“時間的傷口永遠無法愈合，而我們...將成為撒鹽的人。”
星孩與秦逸率領的突擊小隊剛接近聖殿，便陷入時間陷阱。隊員們的身體開始不受控地切換年齡，有的瞬間變成孩童，有的則衰老成佝僂老者。“別反抗時間的流動！”星孩強撐著引導歸墟能量，雙色光芒在他周身形成保護罩，“順著時砂的波動，找到它們的共振頻率！”當他的能量與祭壇暗晶產生共鳴時，意外讀取到一段記憶——金色面紗女子曾在此處將自己的意識碎片注入時砂，等待復活的時機。
在聖殿深處，祭壇暗晶突然暴漲，化作巨大的沙漏形態。神秘存在的虛影從中踏出，它的身軀由時間與暗晶交織而成，每走一步，周圍的空間就會出現裂痕。“你們以為摧毀錨點就能阻止熵變？”它的聲音如萬座時鐘同時敲響，“時間本就是最鋒利的手術刀，而宇宙...早已病入膏肓。”隨著它的揮手，無數時砂組成的銹蝕銀針射向眾人，所到之處，空間被切割成混亂的拼圖。
秦逸拉開山茶樹長弓，黑白二氣化作箭矢迎擊銀針雨。但他的經絡在時間之力的沖擊下再次斷裂，鮮血順著弓弦滴落，將箭矢染成詭異的紫色。星孩見狀，將最後的歸墟能量注入銹蝕銀針，大喊︰“既然時間無法逆轉，那就讓它停滯！”銀針爆發出耀眼的光芒，形成能凍結時間的“剎那結界”，暫時困住了神秘存在。
然而，結界的維持消耗了星孩全部力量。他的量子態身體開始透明化，善惡分身的意識逐漸融合成一道微弱的光。千鈞一發之際，林婉遺留的金色種子突然爆發出強光，種子內部浮現出初代道侶最後的記憶︰“時間的真諦，不是掌控，而是接納。”星孩頓悟，將歸墟能量轉化為能調和時間流的“平衡之息”，與神秘存在的時間之力相撞。
劇烈的爆炸中，聖殿崩塌，時間瘤開始瓦解。神秘存在的虛影發出不甘的怒吼，化作時砂消散在宇宙中。但在爆炸的余波里，秦逸發現了更可怕的事——自愈教派首領帶著一塊暗晶核心逃脫，核心表面刻著“熵時計劃第二階段”的字樣。星孩虛弱地靠在新火種樹上，歸墟能量變得前所未有的平靜︰“我們暫時守住了現在，但熵源的下一次攻擊...恐怕會直指宇宙的根基。”而在宇宙深處，無數暗紫色的時砂正順著量子網絡潛伏，等待著新的宿主。
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