熵海的時空屏障在熵核心髒的脈動下扭曲成漩渦，林婉消散前的靈識如同一把鑰匙，強行打開了方舟量子回溯裝置的封印。“秦逸，星孩，我們必須回到初代道侶創造熵影的時刻！”她的聲音在虛空中回蕩，“只有改寫那段歷史，才能斬斷熵變的源頭！”
方舟的引擎發出超負荷的轟鳴，艙室內的時間流速開始紊亂。星孩握緊破碎的量子符，雙色歸墟能量在他周身形成不穩定的防護罩︰“但強行穿越會被時間風暴撕成碎片！”秦逸將神農鼎殘片按在胸口，重組的太極靈根迸發出耀眼的黑白光芒︰“用我的靈根當錨點！林婉，你引導方向，星孩維持穩定！”
當他們沖破時空壁障，眼前的景象令三人瞳孔驟縮。初代實驗室懸浮在混沌之中，巨大的培養艙內，兩具胚胎緩緩生長——其中一個是與林婉容貌相同的女性，另一個則是年幼的星孩。實驗室中央的全息投影顯示著令人震驚的演算數據︰初代道侶正在進行“文明免疫計劃”，她認為宇宙文明過度依賴醫療科技，終將在安逸中衰亡，唯有引入“熵變因子”，才能讓文明在危機中進化。
“原來從一開始，我們就是對抗熵變的實驗品...”林婉的意識體微微顫抖，她的晶化皮膚下，金色數據流瘋狂涌動。就在此時，實驗室的警報突然響起，數十個身披黑袍的身影闖入。為首者摘下兜帽，竟是熵影的初始形態——那時的他眼神清澈，手中捧著一枚閃爍著詭異光芒的黑色晶體。
“那是熵核心髒的雛形！”星孩的歸墟能量劇烈波動，“熵影偷走了初代道侶的研究成果！”秦逸立即揮動神農鼎殘片，試圖阻止熵影，卻發現自己的攻擊如同穿過虛影。林婉突然領悟︰“我們是觀察者，無法直接干預歷史！必須找到影響因果的關鍵節點！”
他們的目光同時落在實驗室角落的量子信標上。信標閃爍的頻率，與當前宇宙中熵變病毒的傳播頻率完全一致。“如果切斷這個信標，就能斬斷熵影與未來的聯系！”秦逸的聲音帶著興奮，卻在靠近信標時被一道無形的屏障彈開。屏障上浮現出初代道侶的投影，她的眼神中充滿悲憫︰“後來者，你們以為改變過去就能拯救未來？看看這個！”
投影切換，顯示出無數平行宇宙的畫面。每個宇宙中，林婉和星孩都成功阻止了熵影，但最終都陷入了新的災難——有的宇宙因過度淨化失去進化動力，有的則被新的病毒吞噬。“熵變不是疾病，而是宇宙的呼吸...”初代道侶的聲音低沉，“唯有找到平衡之道，才能真正破局。”
星孩突然想起在熵核心髒中看到的畫面，他的雙色歸墟能量化作絲線，纏繞在信標上︰“我明白了！初代道侶故意讓熵影偷走研究成果，她在等有人能超越她的實驗！”隨著歸墟能量注入，信標開始逆向運轉，實驗室的時間線出現裂縫。熵影的身影在混亂中回頭，他的眼神中閃過一絲迷茫。
就在此時，現實宇宙中的熵核心髒突然劇烈震顫。荊棘醫團的成員們陷入混亂，他們體內的病毒開始反噬。熵影的怒吼聲穿透時空︰“你們以為能改變命運？因果的齒輪一旦轉動，就無法停下！”他的身影在歷史與現實中重疊，手中的熵核心髒雛形與現實中的巨物產生共鳴。
林婉的意識體在時間亂流中逐漸透明，她將最後的力量注入星孩體內︰“記住，真正的平衡不是消除熵變，而是讓生命有選擇的權利...”秦逸的太極靈根開始崩解，他用最後的力量將神農鼎殘片化作鎖鏈，纏住即將暴走的信標。星孩的歸墟能量達到極限，他的身體開始量子化。
當信標被成功逆轉，實驗室的畫面漸漸模糊。三人被時間風暴拋回現實宇宙，卻發現熵核心髒並未消失，反而變得更加龐大。在心髒表面，初代道侶的虛影若隱若現，她的嘴唇無聲地張合，仿佛在說︰“這只是開始...”而在宇宙的暗處，熵影的笑聲依舊回蕩，他的手中握著一枚全新的黑色晶體，上面刻滿了無人能解的熵變符文。
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