逆命之樹的瘋狂生長將星系攪得天翻地覆，而更可怕的危機正在時間維度悄然蔓延。星孩善體驅散共生體時引發的能量波動，意外喚醒了初代實驗室深處的“時間銹蝕裝置”。林婉突然感到一陣強烈的眩暈，失明的雙眼中，金色微光開始扭曲——她“看”到無數時間線正在崩解，被熵菌感染的文明歷史如銹蝕的金屬般剝落。
“秦逸！時間線出現異常！”林婉的意識體劇烈震顫，典籍自動翻開至殘缺的“溯時篇”，但書頁上的文字正在迅速氧化變黑。艦橋的警報聲尖銳刺耳，儀表盤顯示多個文明的科技樹出現逆向生長︰星際戰艦退化為木質帆船，量子計算機變回算盤，甚至連醫療技術都倒退回巫醫祭祀的原始形態。
秦逸的銀紋在操作台瘋狂游走，觀測者之力構建的時間錨點剛成型就被腐蝕︰“是熵菌污染了時間長河！它們在篡改歷史，讓文明主動向熵寂力量‘朝聖’！”他的聲音帶著驚恐，銀紋上出現斑駁的銹跡，“這些銹痕...和初代實驗室的禁忌文獻記載的‘因果銹蝕’完全一致！”
醫療艦隊試圖通過時空跳躍修復歷史，卻發現所有躍遷坐標都被暗紫色的時間銹跡覆蓋。更糟的是，被銹蝕的時間線開始反噬現實——艦隊的武器系統出現故障，激光炮發射出的竟是燃燒的箭矢；治愈光束接觸傷員時，傷口反而長出詭異的青銅銹。一名船員絕望地喊出︰“我們的未來...正在被過去吞噬！”
林婉強撐著意識，驅動典籍釋放“溯光”之力。金芒如同一把利刃，試圖劃開銹蝕的時間屏障，但每前進一步，典籍的書頁就剝落一層。在時間亂流中，她與秦逸看到了令人毛骨悚然的畫面︰某個文明的醫療史被篡改成“疾病崇拜”，醫者不再治病救人，反而將患者獻祭給巨大的熵菌圖騰；另一個星系的科技發展停滯在蒸汽時代，因為所有發明創造都會在誕生瞬間被銹跡腐蝕。
關鍵時刻，秦逸在時間碎片中發現了初代道侶的銹蝕銀針。這枚蘊含著熵能的古老器械，竟能短暫中和時間銹痕。但每使用一次，銀針的腐蝕就加深一分。“用銀針開闢時間通道，我們必須回到過去阻止熵菌污染的源頭！”秦逸將銀紋與銀針綁定，觀測者之力強行撕開一道不穩定的時空裂縫。
兩人穿越回熵菌爆發初期，卻發現歷史早已被篡改。初代實驗室的研究員們不再是追求真理的學者，而是狂熱的熵寂信徒。他們將熵菌注入時間長河的舉動，竟是為了“修正”宇宙中“過度進化”的錯誤。林婉試圖用典籍喚醒他們的良知，卻遭到研究員們的攻擊——他們的身體同樣布滿時間銹痕，早已淪為歷史篡改的傀儡。
戰斗中，秦逸發現實驗室核心的“時間鍛造機”正在不斷復制銹蝕模板。只要摧毀這台機器，或許就能終止時間污染。但當他們接近目標時，星孩惡體的身影突然出現在時間亂流中。他的手中握著半塊刻滿悖論的懷表，懷表指針逆向飛轉，每轉動一圈，現實世界的時間銹蝕就加劇一分。
“你們以為能對抗時間的意志？”惡體的聲音混著齒輪摩擦的轟鳴，“當文明在歷史的銹跡中腐爛，熵寂才是唯一的救贖！”他揮動手表，無數銹蝕的時間線化作鎖鏈，纏住林婉與秦逸。典籍的金芒與銀紋的光輝在鎖鏈的侵蝕下逐漸黯淡，而在現實世界，逆命之樹的熵化進程因為時間混亂而愈發失控。
千鈞一發之際，林婉突然想起典籍中記載的“同頻共振”之法。她與秦逸將自身的醫療信念注入銹蝕銀針，銀針爆發出耀眼的光芒。光芒所到之處，時間銹痕開始崩解，被篡改的歷史片段重新拼湊。但銀針也在此時徹底碎裂，化作飛灰消散在時間長河中。
摧毀時間鍛造機的瞬間，實驗室開始崩塌。林婉與秦逸在時間亂流中掙扎，他們知道，雖然暫時阻止了時間銹蝕，但星孩惡體的陰謀遠未結束。而在現實宇宙，逆命之樹的命核已經熵化過半，初代道侶留下的最後警告即將成真......
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