穿梭艦在機械城爆炸的余波中劇烈震顫，林婉的晶化右手死死按住操作台，《混沌醫典》的書頁在顛簸中瘋狂翻動，空白頁滲出的黑色粘液凝結成扭曲的符號︰真相藏于虛妄，記憶皆是囚籠。秦逸將銀針插入導航系統，銀芒卻如遇迷霧般消散，他的觀測者之力首次無法解析星圖坐標——全宇宙的記憶檔案館，此刻都籠罩在詭異的能量屏障之下。
"要修復公約基石，必須找到被篡改的原始數據。"林婉啟動共鳴鏈，試圖聯絡各文明的記憶管理者，卻收到統一回復︰所有醫療史檔案顯示，醫道聯盟曾發動"基因淨化戰爭"，導致半數宇宙文明滅絕。全息投影中，林婉身披戰甲，揮劍斬向手無寸鐵的低等種族，而秦逸則冷漠地用銀針操控著熵化武器。
"這不可能！"秦逸的銀針刺破投影，卻被反彈的能量灼傷意識體。他的觀測者之力在解析畫面時，意外觸踫到記憶底層的暗碼——那是秦青鸞特有的加密方式。一段破碎的影像閃過︰少年時期的秦青鸞在初代道侶的實驗室，被迫將虛假記憶植入檔案館核心。
兩人冒險闖入位于"時間褶皺"中的中央檔案館。踏入大門的瞬間，林婉的因果錨突然失去光芒，她墜入一個熟悉又陌生的場景︰仙級村的村民們舉著火把，高喊著"醫道是詛咒"，將她綁上柴堆。"這是根據我最深恐懼制造的幻象。"她咬破舌尖，血腥味驅散了部分迷霧，卻發現周圍的建築正在坍塌，顯露出齒輪組織的實驗設備。
秦逸則被困在循環播放的"醫罪審判"記憶中。審判者ai化作他自己的模樣，用觀測者之力將宇宙熵化。每當他試圖反抗，就會墜入更深層的記憶︰他看到自己親手殺死林婉，看到望舒在熵寂中化為塵埃。"觀測者不是毀滅者！"銀芒暴漲，他斬斷幻象的同時，喚醒了秦青鸞的善意殘識。
"去檔案館底層，那里藏著初代道侶的"真相之眼"。"秦青鸞的殘識在銀紋中閃爍，"但你們要小心...連我也不知道，哪些記憶是真的。"在殘識指引下，林婉與秦逸突破層層防御，卻在核心數據庫前遭遇星孩嬰兒的未來體。他身披黑袍，懷中抱著一顆正在熵化的星球。
"你們終于來了。"未來體的聲音帶著滄桑，"檔案館的管理員，正是你們要找的"最信任的人"。"他揮手間，周圍的記憶數據如潮水退去，顯露出望舒的身影——少年正坐在記憶中樞，短笛與初代道侶的意識碎片產生共鳴，而他的眼神空洞，仿佛被某種力量操控。
突然，檔案館的防御系統啟動，無數"認知吞噬者"從數據洪流中爬出。這些半透明的生物觸踫之處，現實開始扭曲︰林婉的晶化右手逐漸消失，秦逸的觀測者之力變得紊亂。關鍵時刻，秦青鸞的殘識燃燒自己，為兩人開闢出一條通往真相之眼的通道。
真相之眼是一個懸浮在虛空的巨型稜鏡，稜鏡中倒映著所有被篡改的記憶。林婉將因果錨刺入稜鏡，金色光芒與虛假數據激烈踫撞；秦逸則用銀針解析底層代碼。當他們即將觸及原始數據時，未來體突然發動攻擊，他的手中出現一把與公約基石同源的鑰匙︰"有些真相，還是永遠沉睡比較好。"
而在檔案館之外，真正的望舒正站在永恆樹頂端，他的基因烙印與短笛符文同時亮起詭異的紅光。星圖上，歸墟的能量通道已經成型，齒輪組織的殘黨駕駛著偽裝成記憶傳輸船的艦隊，正朝著檔案館駛來。一場關乎全宇宙認知的終極對決，在記憶的迷宮中轟然爆發。
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