虹橋醫鏈的警報聲與星孩嬰兒惡體的狂笑在宇宙中回蕩，林婉望著星圖上不斷擴張的歸墟黑洞，手心沁出冷汗。醫鏈的修復工作因機械瘟疫的殘留影響進展緩慢，而更糟糕的消息傳來——機械族展示了他們的最新武器︰由星孩善惡雙體基因改造的“矛盾體戰士”。
“這些戰士的基因鏈如同不穩定的量子態，”秦逸將檢測報告投影在主控室，畫面中，戰士們的身體在完美與殘缺間快速切換，“當他們呈現完美形態時，擁有超越星級戰艦的破壞力；而一旦切換到殘缺形態，便會釋放出足以淨化瘟疫的治愈力。但每一次形態轉換，都會引發強烈的能量風暴。”
初代守護者調出戰場畫面，機械族的艦隊正護送著矛盾體戰士陣列逼近。這些戰士的裝甲表面流轉著黑白交織的紋路，胸口瓖嵌的水晶與星孩嬰兒眉心的裂痕產生共鳴。林婉的晶化右手不自覺地顫抖，她感受到初代道侶殘片在錨刃中發出悲鳴——那是對基因褻瀆的憤怒。
“甦瑤，啟動防御矩陣！”林婉沖向艦橋，卻發現素問母腦的核心區域仍殘留著機械瘟疫的暗線。甦瑤的聲音從根系傳來，帶著沙啞︰“部分功能尚未恢復，只能啟動60的防護罩...”話音未落，矛盾體戰士已發動攻擊。完美形態下的他們舉起能量炮，轟出的光束竟能扭曲空間，虹橋醫鏈的防護罩在沖擊下泛起刺目的紫光。
秦逸甩出銀針，試圖擾亂戰士們的基因波動，卻發現銀針在接觸黑白紋路的瞬間就被分解。“他們的基因鎖太過精密，”他擦去額頭的冷汗，“除非能找到星孩基因的原始代碼，否則根本無法破解。”就在此時，星孩嬰兒的善體突然脫離醫療艙，化作一道金光沖向戰場。
善體的光芒與矛盾體戰士的能量踫撞，產生劇烈的震蕩。奇跡發生了——部分戰士的眼神恢復清明，他們的身體停止切換，定格在殘缺形態，開始用治愈力修復被破壞的空間。但惡體的身影也隨之出現，他站在歸墟黑洞邊緣，冷笑著揮動手臂︰“真是愚蠢的慈悲，看你們能堅持多久。”
歸墟黑洞突然噴涌出大量黑色物質，這些物質附著在矛盾體戰士身上，竟將他們的殘缺形態轉化為更扭曲的異化體。他們的皮膚開始機械增生，眼中閃爍著歸墟能量的瘋狂。林婉握緊因果錨，初代道侶的力量與善體光芒融合，斬出一道能斬斷因果的刃芒︰“秦逸，我們必須靠近黑洞，找到星孩基因的源頭！”
兩人駕駛穿梭艦突破防線，卻在接近黑洞時陷入詭異的力場。周圍的空間被壓縮成無數鏡面，每一面鏡子都映出不同的可能性︰林婉殺死星孩阻止災難、秦逸與秦青鸞同歸于盡、虹橋醫鏈被改造成吞噬者的軀殼...“這些是平行宇宙的片段，”秦逸的銀針在鏡面上留下痕跡，“秦天明一定在利用黑洞操控時間線。”
千鈞一發之際，星孩嬰兒的意識突然在力場中浮現。他的善惡雙體化作兩條巨蟒，相互纏繞著沖向黑洞核心。林婉與秦逸趁機跟上，卻發現黑洞深處藏著一個巨大的基因實驗室。無數培養艙中浸泡著星孩嬰兒的克隆體，而中央的主控制台閃爍著秦天明的全息投影︰“歡迎來到觀察者協議的核心，你們準備好成為實驗的一部分了嗎？”
戰斗在實驗室中爆發。矛盾體戰士的異化體追入黑洞，他們的攻擊引發空間坍縮。林婉的晶化右手在連續戰斗中崩解過半，她將最後的力量注入因果錨，斬斷了連接培養艙的基因鎖鏈。秦逸則用銀針破解主控制台，試圖找到關閉觀察者協議的方法。
就在此時，星孩嬰兒的善惡雙體突然失控，相互撕咬起來。黑洞的引力開始瘋狂波動，整個實驗室面臨崩塌。秦天明的投影發出狂笑︰“看吧，這就是基因悖論的必然結局。當完美與殘缺無法共存，唯有毀滅！”林婉望著痛苦掙扎的星孩，突然想起初代道侶的記憶——真正的平衡，不是消滅對立，而是接納矛盾。
“秦逸，把星孩的基因代碼與我們的靈力融合！”林婉大喊著將因果錨刺入自己的經脈，“我們要創造第三種可能！”秦逸心領神會，銀針化作流光沒入她的體內。兩人的力量與星孩的基因產生共鳴，在黑洞中形成一個巨大的太極圖。太極圖的光芒中，矛盾體戰士的異化開始消退，星孩嬰兒的善惡雙體也停止了爭斗。
但危機並未解除。秦天明的實驗室深處，一個更龐大的裝置正在啟動，它的核心是一塊刻滿《太素仙醫錄》終極禁術的石碑。虹橋醫鏈傳來緊急通訊，甦瑤的聲音帶著絕望︰“醫鏈的能源核心被歸墟能量滲透，最多還能支撐十分鐘...”而在黑洞邊緣，惡體露出了陰謀得逞的笑容，他的身影逐漸與石碑融合，觀察者協議的真正威脅，才剛剛展現出冰山一角。
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