熵巢爆炸的余波尚未平息，星穹醫盟的監測網絡已被海量的孢子信號淹沒。星孩的手指在全息鍵盤上瘋狂跳動，銀發間閃爍著電流火花︰“孢子已擴散至本星系群70區域！它們在恆星內部構建‘熵核’，按照《傷寒論》的病理邏輯重組天體結構！”林婉的燒火棍突然發出蜂鳴，棍身浮現出古老的甲骨文，拼湊成“上古疫劫”四個大字，她的盲眼泛起幽藍微光︰“這些孢子的根源...或許能在中醫文明的起源處找到。”
秦逸的基因共鳴能力在孢子浪潮中劇烈震蕩，他的意識不受控地回溯時空。在混沌的記憶碎片里，他看到上古時期，一群被稱為“巫醫”的神秘人用九針與某種不可名狀的黑暗力量戰斗。“九針...是對抗古神的關鍵！”少年猛然睜眼，皮膚表面浮現出與遺跡圖騰相似的紋路，“我們必須重返針灸遺跡，激活九針的真正力量！”
當本草星艦抵達空間夾層的遺跡時，卻發現這里已被紫色瘴氣籠罩。遺跡表面的針灸圖騰正在逆向旋轉，釋放出能腐蝕靈魂的“病紋射線”。秦青鸞駕駛時空針灸舟嘗試突破，艦體表面的銅人圖騰突然流淚，淚水落地後化作吞噬能量的“饕餮蟲”。“這些蟲子的消化系統...是按照《本草綱目》的相克原理構建的！”她緊急拉升飛船，“它們能吞噬任何攻擊！”
林婉將燒火棍插入星艦經絡核心，引導兩艘星艦組成“陰陽化毒陣”。當歸艦釋放的補血光網化作赤色蓮花，大黃艦的攻毒射線凝成金色蓮葉，試圖淨化瘴氣。但孢子仿佛擁有智慧，竟按照《黃帝內經》的“五行生克”原理，指揮瘴氣變換形態。當光網觸及瘴氣時，後者立即轉為“水”屬性，將能量引入虛無；射線襲來時，又化作“金”屬性，反彈攻擊。
關鍵時刻，秦逸的基因共鳴與遺跡產生更深層次的共振。他的意識被拉入遺跡核心，見到了九根神針的器靈。這些器靈形似半透明的古醫，手中分別握著九針虛影︰“想要激活九針，需以‘仁心、慧心、勇心’為引，破解我們各自的醫道謎題。”第一關， 針器靈拋出難題︰“當疫病無法治愈，醫者該如何抉擇？”
星艦上，眾人陷入苦戰。孢子匯聚成的“疫獸”，其身體結構對應人體十二經絡，攻擊招式暗含《難經》中的“五邪理論”。當歸艦的護盾被“寒邪”凍結，大黃艦的武器系統遭“熱邪”侵蝕。林婉通過共情之力感受到孢子深處的意識——那是被扭曲的“醫道執念”，它們堅信唯有毀滅現存生命，才能孕育“完美文明”。
“答案是...永不放棄！”秦逸在意識空間中高呼，“上古巫醫即便面對必死之局，也從未拋棄任何生命！” 針器靈頷首，神針綻放出鋒銳金光，瞬間刺破包圍星艦的瘴氣。緊接著，圓針器靈提出“如何調和對立療法”的悖論， 針器靈設下“以毒攻毒卻傷及無辜”的困境。秦逸在伙伴們的信念支持下，分別以“陰陽平衡”“標本兼治”的醫道智慧化解。
當九根神針全部激活時，遺跡爆發出璀璨光芒。九針化作流光融入本草星艦，當歸艦、大黃艦與針灸舟的武器系統產生質變——發射的能量束中， 針的鋒銳、圓針的溫潤、鋒針的疾刺等特性完美融合。然而，就在眾人準備反擊孢子時，秦逸的基因共鳴突然感知到一個恐怖真相︰在銀河系最古老的星域，有一座按照《黃帝外經》倒寫經文構建的“終焉祭壇”，而疾厄古神的殘識，正在那里孕育真正的本體。
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