楊眉證道成聖之後，遂遁世歸隱，不問洪荒諸事。天庭紛爭、人族興衰，似乎對其而言皆如過眼雲煙，虛空一脈雖偶有異動，楊眉亦不顯神通，任其自然運轉。即使鎮元子等人尋訪其蹤，卻也見不得真容，實在令人費解！
自此之後，洪荒天道自行修正，原本因人皇隕落而黯淡的人族氣運長河，重新奔流不息。又加上沒了三清女媧等聖人壓制，人族氣運長河慢慢怒濤拍岸，金光璀璨！祖廟聖火重燃，先民英靈顯化，守護山河。
各大部落薪火相傳，人族文明之光再度照耀洪荒大地。洪荒大地，諸多人族部落林立，人族再次顯現出洪荒霸主之姿！
洪荒東域，有熊部族上空，忽有紫氣垂落，如天河傾瀉，籠罩族長少典居所。嬰孩啼哭之聲清越如劍鳴，震散晨霧。族人驚見，那孩子掌心天生一道玄奧紋路，似山川河岳交織，雙眸開闔間隱現日月輪轉之象，少典賜名其為軒轅。
軒轅三歲能言天道，五歲可辨百獸之音，部落強者皆言此子非凡，未來必有大成就。
一日，有熊部落上空，忽有仙雲垂落，紫氣浩蕩三千里。闡教十二金仙之首廣成子踏雲而至，手持玉清仙符，目光如炬，來到有熊部落，點名要見軒轅。
"汝有人皇之姿，吾特來收你為徒！"
見到軒轅之後，廣成子立馬取出一枚九轉金丹，丹成九竅，隱有龍吟鳳鳴之聲。軒轅見此立馬拜師後服下金丹，霎時間周身金光暴漲，紫府元神凝練，三花聚頂，一步登臨大羅金仙之境！
軒轅得道之後，勵精圖治，推行文字、定度量衡、制禮樂、興農耕，使有熊部落日漸強盛。同時率軍征戰四方，以仁德服人，以兵法懾敵。短短千年，洪荒東部諸部盡皆臣服，有熊部落威名遠播。
洪荒北域，有一巫人部落，名曰九黎，某日，部落血祭祖巫之夜，祭壇中央的龜甲突然炸裂。當夜九黎一族酋長夫人生下一嬰孩，其背生暗紅紋路，如古老戰陣圖騰。
嬰孩出世之後，即刻便能直立行走，不哭不鬧，族中豢養的猛獸盡皆俯首，九黎部落之人皆震驚失色，九黎酋長也當即為其取名，之後立其為九黎部落之繼承人。
孩童五歲時便已如成人高大，徒手便能撕裂豺狼虎豹，某日其偶然撿到一塊淚石，漫天煞氣突然繞其身而行，一柄魔刀奧秘天而降，自動認主。
同時孩童眼中閃過一絲不易察覺的血芒，隱隱可以從中看到一朵熊熊燃燒的業火紅蓮，孩童記起前世，隱去其父所起之名，自號蚩尤，從此不尊諸聖，只拜天地。
而蚩尤繼任九黎族長之位後，將自身巫族與人族血脈比例精準控制，使人族血脈略佔上風，同時令九黎部眾同樣如此，盡可能保留巫族戰體之強橫，卻又不失人族血脈靈慧。
蚩尤知曉若想爭奪人皇之位，必須得到人族認可，以鐵腕手段整肅部族，重訂族規，主動推行人族禮法，學農耕，制陶器……使得九黎部落雖然好戰，卻也是充滿禮儀教化之部落。
九黎部落通曉巫術，以獸骨為基，融煞氣為刃，錘煉鍛造凶煞戰兵，在古老巫紋的加持下，戰兵煞氣沖霄，可裂山岳，使得九黎部落之戰力遠強于其他部落。
蚩尤天生通曉戰陣變化，觀天地殺伐之氣，自創八十一戰陣圖。每一陣皆含天地至理，或如烈火焚野，或似寒霜覆地，九黎戰士演練此陣，可借天地之勢，戰力暴漲。
蚩尤白日統軍征伐周邊部落磨練戰陣，夜間汲取戰場殺伐之氣，淬煉肉身，不過萬年便達到前世之境界，混元金仙，蚩尤突破之時，九黎部落上空血雲翻涌，凝聚成一尊兵主戰魂虛影，威震北荒大地。
自九黎部落與有熊部落崛起，人族戰火肆虐。東方氏族扶老攜幼東遷，求軒轅庇護；北荒大地部落或懾于蚩尤之威，或感巫人強大戰力，紛紛歸附。
而純正人族部落與巫人等混血人族部落的矛盾逐漸加劇，導致洪荒大地劫氣再起，此時，人族急需一位雄主統一人族，結束紛爭。
火雲洞天，子鼠長老夜觀天象，見北斗七星盡染赤芒，聲道︰"大劫至矣！可惜皆非我人族明主！"
軒轅背後是闡教，蚩尤背後亦有後土聖人的影子，二人雖有人皇命格，卻終究是聖人傀儡罷了。至于上一任人皇，也是佛門的棋子，想到這里，子鼠長老不由得仰天長嘯，
山雨欲來，九黎部落與有熊部落于涿鹿原野對峙，大戰一觸即發。盤古神殿內，後土聖人眸光垂落，大地之氣翻涌如潮。
"蚩尤此戰，關乎巫族氣運。若能奪得人皇之位，巫族便有再次逐鹿洪荒之機！"
後土指尖輕點，盤古神殿中三道神光破空而去，正是刑天帶領風伯雨師直奔九黎部落。
"有諸位兄弟助力，何愁軒轅不敗？"三人降臨九黎部落，蚩尤大笑，戰意更盛！
昆侖山玉虛宮，元始天尊尚未歸來，由副教主燃燈道人暫理闡教之事，盤古幡亦留于玉虛宮中，由大弟子南極仙翁掌管。二人眸光淡漠，袖袍一揮，仙光垂落人間。燃燈道人和南極仙翁率領十一金仙亦下山而至有熊部落。
軒轅執劍而立，肅然一禮，說道︰"多謝諸位仙長相助，軒轅必不負眾望！"
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