終末輪回的枷鎖被打破後，宇宙本源之力突然產生劇烈的裂變反應。阿雷克斯的量子監測網絡顯示，構成宇宙的基本粒子正在以違背常理的方式分裂重組，恆星內部的核聚變反應逆向進行，將能量重新壓縮為物質；萊婭的靈羽族聖地，守護聖樹的根系開始瘋狂吸收周圍的靈能，樹干上浮現出無數張痛苦扭曲的面孔，發出撕裂靈魂的哀嚎。整個宇宙仿佛一台零件錯位的精密儀器，發出瀕臨崩潰的嗡鳴。
甦塵與洛瑤的力量在這場本源動蕩中瀕臨失控。甦塵的混沌之力如同脫韁的野馬，每次施展都會在空間中撕開巨大的裂痕，從中涌出散發著腐朽氣息的暗物質洪流；洛瑤的星光之力則變得黯淡而冰冷，治愈的光芒觸踫之處，反而加速了物質的衰變。兩人的意識被強行拽入一個由破碎本源構成的異空間，這里漂浮著無數發光的晶體，每一塊晶體都蘊含著宇宙誕生時的原始法則，卻都在以肉眼可見的速度崩解。
銀河守望者聯盟的艦隊在試圖穩定局勢時遭遇重創。戰艦的引擎系統被本源裂變產生的能量流摧毀，船員們的身體開始與接觸到的物質發生同化——有人的皮膚變成金屬質地，卻在下一秒又化作液態；有人的骨骼逐漸透明，最終消散成漂浮的光粒。薇爾莉特帶領的特遣隊裝備了特制的“本源穩定服”，試圖在亂流中尋找突破口，卻發現穩定服反而成為加速裂變的催化劑，隊員們的意識開始與不同維度的本源意識產生共鳴，陷入瘋狂的邊緣。
萊婭發動靈羽族最後的禁忌儀式“寰宇歸源”，以燃燒全族生命本源為代價，終于窺探到這場危機的根源。在宇宙誕生之初，十二工匠將蘊含著無限可能的“本源核心”封印在宇宙深處。但隨著宇宙經歷無數次危機，核心內部的平衡被徹底打破，產生了名為“裂源者”的邪惡意識。它是所有不穩定因素的集合體，妄圖通過不斷分裂本源之力，將宇宙徹底解構為無序的混沌。
阿雷克斯帶領科研團隊啟動“本源聚合計劃”，在各個星域建造巨型“歸墟塔”。他們試圖用機械聯邦最尖端的引力控制技術，將分裂的本源粒子重新聚合；用靈羽族的古老咒文安撫暴走的法則之力。然而，裂源者不斷扭曲歸墟塔的能量輸出，將聚合的粒子再次撕裂，咒文也被轉化為加劇裂變的指令。普通星球上，山川河流開始逆向演化，生物的進化鏈出現斷裂，整個生態系統瀕臨崩潰。
甦塵與洛瑤在異空間中艱難前行，每走一步都要承受本源之力的撕扯。他們遭遇由裂化本源具象化的怪物︰擁有無數觸手的暗物質巨怪、能操控法則的混沌之眼、由反物質構成的毀滅使者。裂源者化作一個由破碎晶體組成的人形，它的聲音如同萬千金屬同時斷裂︰“本源的裂變是宇宙的宿命，你們的抵抗不過是螳臂當車！”
在這千鈞一發之際，全宇宙尚存希望的文明將對“完整”的渴望與對“新生”的信念注入兩人意識。甦塵與洛瑤將混沌之力、星光之力與文明的集體意志融合，形成能重塑本源的“創世熔爐”。當熔爐的光芒照亮異空間，崩解的本源晶體開始重新聚合，裂源者發出淒厲的慘叫，逐漸消散在光芒之中。
戰後，創生之樹生長出“本源脈絡”，自動監測並修復宇宙中的本源裂隙。甦塵與洛瑤的力量化作守護宇宙根基的壁壘，他們的光芒成為穩定本源的定海神針。但在宇宙最隱秘的角落，裂源者的殘念仍在悄然聚集，等待著給予文明最後的致命一擊……
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