回到多元宇宙後，星際聯盟總部內，各方勢力代表緊鑼密鼓地籌備對抗混沌力量的計劃。墨星隕、逸風等人與各勢力代表反復商討戰略，氣氛嚴肅而熱烈。
然而，在他們積極準備之時，混沌力量的余孽並未停止行動。在一個偏遠的宇宙角落，一處被廢棄的星球基地中，殘留的混沌信徒們正在秘密謀劃著新的破壞行動。
這些信徒身著黑袍，臉上戴著詭異的面具，圍聚在一個巨大的混沌水晶周圍。水晶中閃爍著扭曲的光芒，不斷釋放出邪惡的氣息。為首的信徒身形高大，他舉起雙手，聲音低沉地說道︰“主人的計劃雖受到阻礙，但我們仍有機會。他們以為找到‘元始之心’就能高枕無憂，卻不知我們已在各個宇宙埋下了更深的隱患。”
原來，在眾人尋找“元始之心”的過程中，混沌力量早已安排信徒在多元宇宙的關鍵節點布置了混沌能量裝置。這些裝置如同隱藏的定時炸彈，一旦啟動，將再次引發混亂，削弱各方對抗混沌的力量。
與此同時，在星際聯盟總部，負責情報收集的人員傳來消息，多個宇宙出現了不明原因的能量波動異常，部分星球的秩序開始出現混亂跡象。墨星隕等人意識到，這很可能是混沌余孽的陰謀。
“看來混沌力量不會輕易罷手，他們在暗處的動作不斷。”墨星隕皺著眉頭說道。
逸風點頭，眼神堅定︰“我們不能坐以待斃，必須盡快找出這些隱藏的危機，阻止他們的陰謀。”
于是，眾人迅速分成多個小組，前往各個出現異常的宇宙進行調查。墨星隕與沈棠疏、凌霜一組，來到了一個科技高度發達的宇宙。這里的天空中懸浮著巨大的城市，科技之光閃耀，但此刻，城市的運行卻出現了明顯的紊亂。
他們剛進入這個宇宙，就感受到一股濃郁的混沌氣息。城市中的人們驚慌失措，各種高科技設備不受控制地發出刺耳的警報聲。墨星隕釋放出星核之力，試圖感知混沌力量的源頭。
“我感覺到，混沌力量似乎集中在城市下方的能源核心區域。”墨星隕說道。
三人迅速朝著能源核心趕去。在能源核心的入口，一群被混沌力量侵蝕的機械守衛攔住了他們的去路。這些機械守衛身形巨大，全身閃爍著詭異的黑色光芒，手中的武器不斷發出混沌能量的波動。
凌霜毫不猶豫地啟動機甲，沖向機械守衛。機甲的拳頭閃爍著能量光芒，狠狠砸向機械守衛。沈棠疏操控納米蟲群，如黑色的洪流般涌向機械守衛，試圖干擾它們的行動。墨星隕則揮動骨刃，骨刃上的毒液和星核之力相互交融，斬殺靠近的機械守衛。
經過一番激烈的戰斗，他們終于突破了機械守衛的防線，進入了能源核心內部。在核心的中央，一個巨大的混沌能量裝置正在瘋狂運轉，不斷向整個城市乃至整個宇宙散發著混沌能量。
“就是這個裝置在搞鬼，我們必須毀掉它。”墨星隕說道。
然而，當他們靠近裝置時，裝置突然釋放出一層強大的混沌護盾，將他們阻攔在外。凌霜操控機甲發射能量炮，試圖打破護盾，但護盾只是微微顫動，沒有絲毫破裂的跡象。
沈棠疏仔細觀察護盾，發現護盾上刻滿了奇異的符文。她操控納米蟲群，嘗試解析符文的含義。經過一番努力，納米蟲群傳來反饋信息，沈棠疏找到了破解護盾的方法。
她指揮納米蟲群按照特定的順序覆蓋在符文上，隨著納米蟲群的移動，護盾上的符文光芒逐漸黯淡。最終，護盾出現了裂痕，墨星隕看準時機，揮動骨刃，將混沌能量裝置劈成兩半。
裝置被摧毀後，城市的混亂逐漸平息，能源核心恢復了正常運轉。但墨星隕等人知道，這只是混沌余孽陰謀的一部分，還有更多的危機隱藏在各個宇宙中等待著他們去解決。
在另一個宇宙，逸風與艾琳•夜梟、古武族劍姬一組，他們遇到了一群被混沌力量蠱惑的古老種族。這個種族擁有強大的精神力量，此刻卻被混沌力量利用，對其他宇宙生物發動攻擊。
逸風揮動霜寒魔劍，釋放出冰寒之力，試圖阻止這些被蠱惑的生物。艾琳•夜梟手持量子切割刀，身形靈活地穿梭在敵群中，切斷敵人的精神聯系。古武族劍姬揮舞燃燒業火的骨刃，以強大的武技斬殺靠近的敵人。
經過艱難的戰斗，他們發現這些生物是受到了混沌力量在一座古老神廟中釋放的精神信號影響。于是，他們深入神廟，找到了隱藏在其中的混沌能量發射器，成功將其摧毀，解除了這個宇宙的危機。
隨著各個小組不斷深入調查，越來越多的混沌隱患被發現並解決。但眾人知道，混沌力量的陰謀或許遠比他們想象的更為復雜，一場更為嚴峻的考驗正等待著他們。在這個過程中，他們也更加深刻地認識到，想要徹底擊敗混沌力量，守護多元宇宙的和平，必須全力以赴，不能有絲毫懈怠。而那隱藏在暗處的混沌力量，似乎也在等待著一個合適的時機，發動一場更為猛烈的攻擊，真正的終局之戰，或許才剛剛開始......
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