然而，大蛇丸絕非那種坐以待斃、任由他人擺布之人。憑借著多年積累下來的豐富戰斗經驗以及海量的忍術知識儲備，他迅速地思索出了一套行之有效的應對策略。
只見他在不斷的蛇皮走位中，他的雙手飛速結印，同時口中低喝一聲，緊接著施展出了強大的防御忍術——三重羅生門！這三道巨大而堅固的門戶瞬間拔地而起，成功抵擋住了宇智波熾接連不斷釋放而來的幾波焰流星沖擊。
眼見自己的攻勢被輕易化解，宇智波熾眉頭微皺，但並未因此亂了陣腳。他深知要想在今日這場與大蛇丸的較量中達成合作並佔據上風，就必須以絕對的實力從正面將對方擊潰。
于是，他不再隱藏實力，他毫不猶豫地啟動了體內潛藏已久的力量——炎遁•查克拉模式！剎那間，熊熊烈焰自其周身噴涌而出，仿佛要將整個空間都燃燒殆盡一般。
與此同時，宇智波熾還巧妙地借助了九尾的力量來進一步增強自身實力。在九尾之力的加持下，他的每一次攻擊都變得威力驚人，特別是那原本就極具殺傷力的焰流星，本就是模仿尾獸玉而改進的忍術，此刻在九尾之力的加持之下，更是發生了質的飛躍，猶如一顆顆尾獸玉般呼嘯著朝大蛇丸砸去。
宇智波熾和九尾經過一段時間的磨合與適應之後，對于如何駕馭九尾之力已然得心應手。此時此刻，他毫無保留地將這份強大的力量盡數展現在了大蛇丸面前，大有一舉定勝負之勢。
在如此狂暴而猛烈的攻勢之下，那看似堅不可摧的三重羅生門瞬間就變得脆弱不堪，根本無法為大蛇丸提供有效的防護，沒一會便被擊潰了。
與此同時，體型巨大的萬蛇盡管有著令人畏懼的身軀，但正因它過于龐大的體積，反而成為了明顯的目標，輕易地就被宇智波熾所釋放出的焰流星精準命中，而且連續數次。
所以，伴隨著一聲淒厲的慘叫，萬蛇遭受了沉重的打擊，身受重傷，不得不狼狽地逃回了龍地洞去養傷，這還是宇智波熾特異留手了，否則萬蛇就是不死，也得八分熟。
隨著萬蛇的敗退，接下來的戰局愈發清晰明了，大蛇丸完全處于劣勢，被宇智波熾死死地壓制著。在雙方都無意拼個魚死網破的情況下，大蛇丸又不是勝負欲太強的人，自然不會生死相博。
在此期間，大蛇丸也曾數次企圖發起反擊，試圖扭轉局面。然而，面對宇智波熾那壓倒性的強大實力，他的這些努力都顯得蒼白無力，收效甚微。
終于，意識到繼續纏斗下去對自己毫無益處的大蛇丸，果斷地選擇了主動認輸，並向宇智波熾提議結束這場激烈的戰斗。見此情景，宇智波熾也順水推舟，同意了大蛇丸的請求。于是，兩人迅速收起了各自的敵意，轉而開始心平氣和地商討起合作的具體事宜來。
值得一提的是，這兩位可都並非那種心胸狹隘、錙銖必較之人。因此，整個合作商討的過程異常順利，幾乎沒有遇到什麼太大的阻礙。經過一番深入細致的協商之後，他們很快便達成了一致意見︰
大蛇丸如願以償地獲取到了根部所有珍貴無比的實驗資料以及絕大部分的實驗室，還有那白絕的部分殘軀擁有權和資金援助；而作為交換條件，大蛇丸將親自出馬，傾盡全力幫助宇智波熾穩固其剛剛獲得的火影地位，同時大蛇丸承諾宇智波熾共享實驗成果的豐厚回報。就這樣，一場原本充滿火藥味的激戰，最終演變成了一次互惠互利的合作。
因為宇智波熾和大蛇丸的交易，所以在關鍵時刻，宇智波熾挺身而出，為大蛇丸發聲開脫，並巧妙地將所有的主要過錯一股腦兒地全都推到了志村團藏的頭上。
最終的結果是，大蛇丸完完全全只是因為自身的能力，參與了那些早已被禁止的研究試驗而已。大蛇丸搖身一變，從禁忌實驗的罪魁禍首之一變成了一名看似無辜的研究員，這樣的結局與原著中的設定恰好相反！
這場風波整整持續了數日之久，期間各方勢力紛紛發力。經過眾人不懈的努力，最終成功地將神秘且強大的“根部”組織一舉鏟除，不僅如此，連猿飛一族的大部分成員也受到了牽連。
面對如此嚴峻的形勢，猿飛日斬為了保住家族的根基命脈，不得不放下身段，私底下悄悄約見了宇智波熾一面，而宇智波熾也不想自己在剛剛掌權後，就發生昔日的火影家族反叛事件，那對他的名譽影響實在是太大了，所以同意了他的會見請求。
兩人見面之後，便開始了一場漫長而又緊張的談判。他們你來我往、各抒己見，足足交談了大半天才總算達成了一致意見。
根據最終的協商結果來看，對于猿飛四族中那些情節特別嚴重之人，也就是除了貪污之外還牽扯到其他重大問題的家伙們，一律嚴懲不貸，絕不姑息；
而剩下的那些相對較輕者，則需要繳納高達三倍的巨額罰款，同時，一旦戰爭爆發，這些人將會被優先征召入伍。至于具體的征召次數嘛，則要依據每個人所犯罪行的輕重程度來決定。
而猿飛日斬則需要前往火之國的大名處，幫助木葉要來一筆資金，同時也要幫助宇智波熾獲得大名的認可，雖然這事宇智波熾並不是很在意，但是終究是多一事不如少一事的好。
木葉的的暗中，經過一場驚心動魄、精彩紛呈的激烈博弈之後，宇智波熾憑借著自身強大的實力和卓越的智慧，成功地掃除了所有橫亙在其通往火影之路的重重阻礙。
緊接著，木葉村毫不猶豫地向外界公開發布了宇智波熾即將擔任第五代火影這一震撼人心的消息。就在這個關鍵時刻，曾經游離在外的自來也以及綱手二人，也都紛紛踏上了回歸木葉村的旅途。
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