甦小寶、李娜和扶甦等人也紛紛施展自己的能力，與黑暗能量展開了激烈的戰斗。量子態科學家們則在一旁不斷地調整能量節點的參數，試圖讓它與永恆之眼的力量更好地結合。
戰斗異常激烈，黑暗能量不斷地發起攻擊，而孫健等人也毫不退縮，憑借著頑強的意志和團結的力量，一次次地擊退了黑暗能量。
在戰斗的關鍵時刻，孫健突然發現了黑暗能量的一個薄弱點。他看準時機，將永恆之眼的力量集中在一點，猛地沖向那個薄弱點。隨著一聲巨響，黑暗能量被撕開了一個大口子，文明之光順勢涌入，與能量節點的光芒融合在一起。
剎那間，整個時空圖書館都被耀眼的光芒所籠罩。能量節點釋放出強大的淨化力量，順著核心算法的脈絡迅速蔓延，將黑袍人首領的意識徹底包裹起來。
黑袍人首領的意識發出一陣憤怒而又絕望的咆哮，但在淨化力量的作用下，逐漸變得微弱。最終，隨著光芒的消散，黑袍人首領的意識被徹底淨化，時空圖書館恢復了平靜。
孫健等人疲憊地坐在地上，臉上露出了欣慰的笑容。他們成功地阻止了黑袍人首領的陰謀，再次守護了時空的平衡。
然而，他們還來不及好好休息，時空圖書館的警報突然再次響起。量子態科學家們急忙查看數據，發現由于之前的戰斗和能量波動，時空出現了一些新的裂縫，這些裂縫有可能會導致咸陽城再次陷入危機。
“我們不能讓咸陽城再次受到威脅。”孫健站起身來，雖然身體很疲憊，但眼神依然堅定，“大家一起想辦法修復這些時空裂縫。”
眾人紛紛點頭，他們與量子態科學家們一起開始研究修復時空裂縫的方法。經過一番努力，他們發現需要收集散布在不同時空的五種神秘能量晶體，才能修復這些裂縫。
于是，孫健等人再次登上時空戰車，踏上了收集能量晶體的征程。他們首先來到了古代的埃及，在金字塔的深處找到了第一顆能量晶體。接著，他們又穿越到了古希臘，在奧林匹斯山上找到了第二顆。
在尋找第三顆能量晶體時，他們來到了一個神秘的原始部落。這個部落的人們生活在一個被強大魔法保護的山谷中，能量晶體就隱藏在山谷中的一座古老神廟里。然而，部落的人們把能量晶體視為聖物，不允許任何人靠近。
孫健等人試圖與部落的首領溝通，解釋他們的目的，但部落的首領並不相信他們。就在雙方僵持不下時，山谷中突然出現了一只巨大的怪物，它朝著部落和孫健等人發起了攻擊。
孫健等人與部落的人們聯手，共同對抗怪物。在戰斗中，他們展現出了強大的實力和智慧，幫助部落的人們擊退了怪物。部落的首領終于被他們的行為所感動，同意將能量晶體交給他們。
在收集到第四顆能量晶體後，他們來到了一個未來的科技世界。這里的人們生活在漂浮的城市中，科技高度發達。能量晶體被保存在一個高科技的研究所里，但研究所被強大的能量護盾保護著，無法強行進入。
孫健等人與這個世界的科學家們合作，通過破解護盾的密碼和解決一系列復雜的技術難題，最終成功地進入了研究所，拿到了第四顆能量晶體。
最後一顆能量晶體的位置最為神秘，它隱藏在一個時空的夾縫中，周圍充滿了強大的時空亂流。孫健等人小心翼翼地駕駛著時空戰車，在時空亂流中穿梭，尋找著能量晶體的蹤跡。
經過一番艱難的探索，他們終于找到了最後一顆能量晶體。然而，就在他們準備取走晶體時，時空亂流突然變得異常強大，將他們的時空戰車卷入其中。
孫健等人在時空亂流中奮力掙扎，他們運用永恆之眼的力量和各自的能力，試圖穩定時空戰車，擺脫時空亂流的束縛。經過一場驚心動魄的戰斗，他們終于成功地逃離了時空亂流，帶著五顆能量晶體回到了時空圖書館。
在量子態科學家們的幫助下，孫健等人將五顆能量晶體放入了時空裂縫的修復裝置中。隨著能量晶體的光芒亮起，修復裝置釋放出強大的能量，緩緩地將時空裂縫一一修復。
咸陽城的時空線也逐漸恢復了穩定，那座古老而又充滿魅力的城市重新展現在眾人眼前。現代建築與歷史遺跡和諧共存，人們在城市中安居樂業，仿佛一切都從未發生過改變。
孫健等人站在咸陽城的上空，俯瞰著這座歷經磨難的城市，心中充滿了感慨。他們知道，這一次咸陽城的危機雖然解除了，但未來還會有更多的挑戰等待著他們。
“我們會繼續守護好每一個時代的文明之光，無論遇到什麼困難，都不會退縮。”孫健看著身邊的伙伴們，堅定地說。
眾人相視一笑，他們的目光中充滿了自信和勇氣。在永恆之眼的光芒照耀下，他們的身影顯得格外高大，仿佛成為了時空歷史中最堅實的守護者。而他們的傳奇故事，也將在時空的長河中繼續流傳下去，激勵著更多的人去守護文明，守護美好的未來。
接下來的日子里，孫健等人並沒有放松警惕。他們留在時空圖書館，與量子態科學家們一起對時空系統進行了全面的檢查和升級，以防止類似的危機再次發生。
在檢查過程中，他們發現了一些黑袍人首領留下的殘余信息。這些信息顯示，黑袍人首領背後可能還有一個更強大的勢力在支持他，這個勢力的目的是擾亂整個時空秩序，以達到某種不可告人的目的。
“看來我們不能掉以輕心，這個背後的勢力才是我們真正需要面對的挑戰。”孫健皺著眉頭說。
甦小寶握緊了拳頭，“不管他們是誰，我們都不會怕他們。我們有永恆之眼，有大家的團結和智慧，一定能夠戰勝他們。”