在幫助秦始皇橫掃六國的征程中，孫大寶、甦小寶與他們不知真實身份的父親孫建、扶甦緊密協作，共同書寫著一段波瀾壯闊的歷史篇章。
當秦軍在攻打魏國時，遇到了一個棘手的難題。魏國都城大梁城，城牆高大堅固，護城河寬闊且水深湍急，魏軍憑借著這些天險，堅守不出。強攻必然會造成秦軍重大傷亡，且勝算不大。
孫大寶仔細研究了大梁城周邊的地理環境，發現大梁城地勢較低，且附近有一條大河。他向扶甦和孫建提出了一個大膽的計策︰“我們可截斷河水，水淹大梁。”孫建听後，微微皺眉︰“此計雖能破城，但城中百姓也將遭殃，恐非仁義之舉。”
扶甦沉思片刻道︰“孫大寶此計雖狠，但如今戰事緊急，魏國久攻不下，拖得越久對我大秦越不利。若能提前告知城中百姓撤離，再行此計，或許可行。”孫大寶點頭稱是︰“公子所言極是，我們可派人混入城中，暗中通知百姓，約定撤離時間。”
于是，他們一面安排士兵悄悄截斷河水，改變河道，一面派人潛入大梁城。經過一番秘密行動，成功將消息傳遞給了城中百姓。約定之日，百姓們紛紛朝著城門涌去。魏軍將領察覺到異樣，想要阻攔，但百姓們在秦軍內應的幫助下，沖破了魏軍的防線，順利出城。
待百姓撤離完畢，孫大寶一聲令下，滔滔河水如猛獸般沖向大梁城。城牆在洪水的沖擊下，漸漸崩塌。魏軍大亂，秦軍趁勢攻城，一舉拿下大梁，魏國宣告滅亡。
在攻打楚國時，楚國地大物博，兵力雄厚，且楚人剽悍，善于山地作戰。秦始皇召集眾人商議對策，朝堂上氣氛凝重。甦小寶站了出來，他分析道︰“楚國幅員遼闊，我們不宜分散兵力。可先在楚國邊境集結大軍，擺出強攻的架勢，吸引楚軍主力。同時，暗中派遣一支精銳部隊，繞道楚國後方，切斷他們的糧草供應。”
孫建補充道︰“楚國多山地，我軍騎兵難以發揮優勢。可訓練一批擅長山地作戰的步兵，配備輕便靈活的武器，與楚軍周旋。”秦始皇听後，龍顏大悅，采納了他們的建議。
扶甦主動請纓，率領大軍前往楚國邊境。孫大寶隨他一同出征，負責指揮佯攻行動，迷惑楚軍。甦小寶則與孫建留在秦國，籌備糧草，訓練山地步兵。
扶甦和孫大寶在邊境與楚軍對峙，每日耀武揚威，做出即將攻城的假象。楚軍果然中計，將主力部隊集結在邊境防御。而此時，甦小寶和孫建訓練的山地步兵已悄然出發，繞道楚國後方。
這支步兵部隊行動迅速，他們翻山越嶺，避開楚軍的巡邏，成功抵達楚國的糧草囤積地。甦小寶指揮士兵們，趁夜突襲，一把火燒毀了楚軍的糧草。楚軍得知糧草被燒，軍心大亂。扶甦和孫大寶抓住時機，率領秦軍發起總攻。楚軍腹背受敵，無力抵抗，秦軍勢如破竹，一路南下，楚國最終覆滅。
在秦國統一六國的最後階段，只剩下齊國。齊國地處東海之濱，長期與秦國保持友好關系，國內承平日久，戰備松弛。但齊國畢竟是大國，若貿然進攻，也會有諸多變數。
孫大寶提出︰“齊國自恃與我大秦交好，防備松懈。我們可派遣使者前往齊國，以結盟之名，邀請齊王來秦國會盟。待齊王到達秦國後，將其扣押，再逼迫齊國投降。”
扶甦有些猶豫︰“此舉雖能兵不血刃拿下齊國，但恐為天下人詬病，說我大秦不講信用。”孫大寶解釋道︰“公子，如今天下統一在即，若因小義而失大局，恐錯失良機。況且，我們可在事後善待齊王，給予他優厚的待遇，以彰顯我大秦的仁德。”
秦始皇權衡利弊後，決定采納孫大寶的計策。使者前往齊國，齊王果然中計，欣然前往秦國。齊王到達秦國後，立刻被秦始皇扣押。齊國群龍無首，在秦國的威逼下，不得不投降。
至此，在孫大寶、甦小寶、孫建和扶甦的共同輔佐下，秦始皇終于完成了橫掃六國的大業，建立了大一統的大秦帝國。然而，隨著帝國的建立，他們之前察覺到的那股神秘勢力愈發活躍，一場新的危機正悄然降臨。
隨著大秦帝國的建立，孫大寶、甦小寶、孫建和扶甦四人在朝中聲望日隆。然而，那股神秘勢力並未因六國的覆滅而偃旗息鼓，反而在暗處蠢蠢欲動，策劃著更大的陰謀。
一日，孫大寶在宮中處理政務時，無意間發現了一些奇怪的奏章。這些奏章雖表面上是關于地方民生的事務，但其中一些用詞和隱晦的暗示，讓他覺得背後似乎隱藏著不可告人的目的。他敏銳地察覺到，這可能與那股神秘勢力有關。
孫大寶立刻將此事告知了甦小寶，兩人經過一番仔細研究，發現這些奏章都指向了一個名為“暗星會”的組織。這個組織極為隱秘，他們在大秦各地滲透，拉攏官員，收集情報，似乎在籌備著一場針對大秦帝國的顛覆行動。
甦小寶皺眉道︰“看來這‘暗星會’來者不善，我們必須盡快將此事告知父親和公子扶甦，一同商討對策。”
于是，孫大寶和甦小寶找到了孫建和扶甦，詳細講述了他們的發現。孫建听聞後，神色凝重地說︰“沒想到在這太平盛世之下，竟隱藏著如此大的隱患。我們不能掉以輕心，必須盡快查明這個‘暗星會’的底細和他們的陰謀。”
扶甦點頭表示同意︰“父王剛剛統一六國，天下初定，百姓渴望安寧。若讓這股勢力得逞，大秦將再次陷入戰亂，百姓又要生靈涂炭。”
四人決定兵分兩路，孫大寶和孫建負責在朝中秘密調查與“暗星會”有牽連的官員，甦小寶和扶甦則喬裝打扮，前往民間探尋“暗星會”的巢穴。
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