此時，清廷團練軍的戰力遠不及後世曾國藩所建的湘軍。
湘軍以地緣、血緣、師生和親友關系為紐帶，大量任用忠于清廷的士大夫為軍官，如羅澤南、李續賓等人。
基層士兵多從吃苦耐勞、身體健壯且畏懼官府、易于駕馭的鄉村農夫中招募，堅決不納城市油滑之人。
同時，湘軍極為重視訓練。
“訓”包含訓家規、訓營規，即對士兵進行思想與紀律教育，向他們灌輸忠君、義氣、誠信等儒家價值觀，培養紀律意識與服從精神；
“練”則涵蓋操演陣法、練習技藝等軍事技能訓練，每日有固定訓練時間，通過反復操練讓士兵熟練掌握軍事技能。
在基層軍官選拔上，營官由統領挑選，哨弁由營官挑選，什長由哨弁挑選，士兵由什長挑選。
這種層層選拔、上級挑選下級的方式，使湘軍內部形成緊密的私人關系網絡，士兵對上級忠誠度高、凝聚力強。加之豐厚餉銀，以及劫掠、繳獲所得，前期湘軍頗具戰斗力。
直至攻破南京城，湘軍對南京城大肆劫掠，並將太平天國積攢多年的財貨洗劫一空。湘軍將士如飽腹的豺狼，只想帶著財寶盡快回鄉快活，無心再在戰場賣命，戰斗力日益下降，最終被李鴻章的淮軍、左宗棠的楚軍取代。
而西軍，從隊伍的組織架構、士兵的訓練、官兵關系、思想教育、賞罰體系到軍規軍紀等，皆源自後世那支赤軍。加上蕭雲驤親自臨陣，林部軍官無人懷疑蕭雲驤能率劣勢兵力擊破當前清軍。
林鳳祥表情嚴肅、語氣決絕地下達指令︰
“諸位回去，務必明白告知兄弟們，這兩日清妖可能狗急跳牆。”
“按西軍死戰規矩，從班長起，各級主官都要指定接替者，以防主官戰死、負傷無法指揮時影響戰斗。若接替者皆戰死，士兵們便依軍餃自行組織作戰。”
“我的接替者是第三師師長吳定彩。”
“無論如何，都要頂住這兩日，配合西王大軍殲滅當前清妖。屆時，整個成都府，不！整個四川都將是我們的！”
第二日清晨，正如林鳳祥所料，清軍瘋狂向魁山堡壘發起攻擊。
他們仗著人多勢眾，以火炮、火槍掩護，填平壕溝、搭建雲梯，不顧士卒死傷地蟻附攻城。
林部西軍士卒深知這是清軍的最後瘋狂，咬緊牙關，依托巧妙的堡壘與清軍死戰。
雙方鏖戰一上午，皆傷亡慘重。戰事最危急時，有五六百清軍一度攻上稜堡第一層，林鳳祥親率兩百余廣西老兄弟發起肉搏沖鋒，終將這股清軍趕下城去。
他左肩膀被砍了一刀，所幸身上甲冑厚實，並無大礙。
中午時分，清軍力竭退去。林鳳祥顧不得休息，簡單包扎傷口後，便帶著幾個參謀四處巡視，慰問傷員、統計剩余物資、組織人手修補工事。
僅一上午，林部就戰死五百余人、受傷一千兩百余人，而清軍粗略估計傷亡至少四五千，這場血戰慘烈至極。若再來兩場這樣的戰斗，林部恐將耗盡兵力。
西軍將士搬運戰死者尸體、救治傷員、磨刀擦槍，在各自陣地匆匆用餐後，準備再戰。然而，就在西軍將士抱定死戰決心時，當面清軍卻退縮了。
直至下午，在岑毓英嚴令下，數百清軍攻到魁山堡壕溝邊，遭西軍一陣火槍打擊，丟下數十具尸體後便退了回去。此後，無論岑毓英如何催促，再無清軍敢攻到壕溝邊。
岑毓英無奈，只得鞭笞這些膽怯的清軍官兵出氣，卻又怕引發嘩變，不敢殺人立威。
直至夜里，清軍都未再發起攻擊。
又先後有兩名軍情局探子摸到堡壘下，被守城的西軍戰士用繩子拉上城來。
原來李竹青為了確保消息能傳遞到林鳳祥手上，竟一次同時發三人。這兩人就是與任剛同批出發、向林部傳遞消息之人。
翌日清晨，林部西軍上下摩拳擦掌，準備與清軍再苦戰一場。但直到日上三竿，當面清軍不僅未攻城，反而有大量清軍渡過凱江，向南面田野進發。
林鳳祥心中一喜，三步並作兩步，跑上魁山閣四樓，拿起單筒望遠鏡看向清軍大營後方。
只見南面田野上，清軍已列好嚴整陣型，視線盡頭涌出密密麻麻的軍隊，身著西軍特有的黃色軍服，打著西軍特有的紅色旗幟。
林鳳祥哈哈大笑道︰“這岑毓英真是不知死活，見西王人少，竟親自督軍，妄圖在野戰中擊潰西王。”
吳定彩和王敬之跟上了閣樓，林鳳祥將望遠鏡遞給王敬之。
王敬之用望遠鏡看了一會兒，又遞給吳定彩，思索半晌不得其解，便問林鳳祥︰“軍長，這岑毓英為何如此冒進？”
林鳳祥指著遠處清軍帥帳，神態輕松地說︰“老王，這岑毓英和西王一樣，都是廣西僮人，他從廣西帶來的兩千本部人馬，也多是僮人。自沒有外人對僮人的那種神秘畏懼感。”
“且他是頭人的後裔，而蕭家只是貧苦百姓。說不定幾十年前，蕭家還是他岑家的下人、奴僕呢。他自然有瞧不起西王的本錢。”
“且他自幼文武兼修，今年二十四歲便做到署理四川巡撫這般高位，怎會看得起西王這個山里娃？”
王敬之思索片刻，仍是不解︰“僅身份差距，就能讓這岑巡撫如此大膽？”
林鳳祥搖頭道︰“當然不止。這岑毓英從廣西起就一直追在我軍後面，作戰對象多是我軍掉隊部眾，從未與我軍主力遭遇，自然勝多敗少，頗為輕視我軍。”
“且我軍進入湖南後，他便被清廷調入四川，何曾與西王交過手？”
吳定彩用望遠鏡看了許久，听到兩人言語，插話道︰
“這廝與太平軍主力作戰的經驗，也就這幾個月和我們對陣了。”
“他仗著兵力、物資遠超我們，將我們困住，恐怕把西軍戰力，等同于我們這支邊打邊擴充的隊伍了。”
“這種情形下，他怎不敢率五六萬之眾，對陣兩萬余西軍？說不定還想一勞永逸，直接擊殺或擒獲西王，徹底解決清廷在四川的問題呢。”
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