今天，tpc總部收到恐龍研究中心的報警，說是挖到了一具結冰的恐龍化石，要求勝利隊過去調查。
于是大古和崛井開車來到恐龍研究中心。一名研究員告訴崛井和大古，這次發現的恐龍化石，屬于距今1億3500萬年到6500萬年的白堊紀時期的恐龍，和一種塔波特的恐龍非常相似。
兩人被帶到化石前面，看到巨大的恐龍化石，也是發出一陣驚呼。
“哇，好大啊！”
“實在大的驚人！”
“真是不敢相信啊！”
在一番觀察後。兩人更加難以置信。原來這只恐龍竟然做過生化電子手術！
這怎麼可能！
就在兩人還在震驚的時候，tpc總部卻被強烈的電磁波所籠罩。在一陣電閃雷鳴之後，tpc總部的整個系統都斷了。
就在眾人不知所措時，屏幕卻自動亮了起來，並發出聲音，還出現一艘巨大的宇宙飛船。
原來是那伽人在搞鬼！
那伽人自稱是宇宙之神，還鄭重的警告人類，說地球今後將歸他們那伽人統治！如果有誰敢違抗，就會將其消滅。
一番大言不慚的講話，可見那伽人是多麼自大！
大古和崛井原本收到總部的通知讓他倆馬上回去，結果剛走到外面，雷達顯示電子恐龍出現巨大能量反應。
于是兩人重新返回電子恐龍處，結果中途有一名女子對他倆發動了攻擊，而這女子正是喚醒電子恐龍的人。
在打斗過程中，崛井一槍擊中那名女子，女子昏迷了過去，不過在昏迷前按下了控制器，將電子恐龍釋放。
大古和崛井並不知道電子恐龍即將甦醒，只是帶著女子回到總部進行治療。
就在大古他們回去沒多久，電子恐龍丸迫奈扎甦醒了過來，並發出聲音︰“我們那伽人曾經統治過地球上的恐龍，丸迫奈扎就是最好的證明！”
總部眾人看到屏幕中的生化電子恐龍也是一臉震驚。
此時總部系統得到了修復，澤井總監也發來視頻。要求勝利隊對付侵略者。
于是居間惠命令勝利隊全體出動！
眾人駕駛兩架飛燕號，對著丸迫奈扎就是一頓激光發射，可惜並沒有對電子恐龍造成任何有效的傷害。
此時，丸迫奈扎來到城市邊緣，再次發出警告︰要求人類在一個小時內投降，否則丸迫奈扎就會再次醒來，發動連續攻擊，直到將人類全部消滅為止。
勝利隊趁機開始對電子恐龍內部進行掃描，結果發現電子恐龍內部有一顆中子彈！
而這麼大一顆中子彈，萬一爆炸的話，地球上至少一半的生物將遭到毀滅！
……另一邊，大古帶著女子在研究中心進行檢查。結果發現這位少女與白堊紀時期的一種叫特異龍的恐龍擁有相同的dna。
此時，恐龍少女醒了過來，並劫持了真由美。
其實恐龍少女早就醒了，她听到了崛井的談話。她原本非常信任那伽人，但如今听到丸迫奈扎體內有中子彈，難以接受。
此時崛井假裝跟恐龍少女說話，然後沖了上去，救下真由美。
恐龍少女見機逃走，而大古追了出去。
大古一邊追恐龍少女，一邊大喊著勸說恐龍少女。
少女有點被大古說動了。但少女的同伴阿達姆此時卻從門後走出。
“伊舞不要被他騙了，人類都是一些花言巧語的生物，不要相信他們！”
“你又是誰！”本來那少女就要被他說動了，結果出來個攪局的，大古氣道。
阿達姆一番自我介紹，原來他是經由那伽人之手進化成功的第一個恐龍人。
阿達姆說完就伸出爪子向大古發動攻擊。
大古左躲右閃，避開所有攻擊，此時有其他警備人員到來，開槍擊中阿達姆面部。阿達姆的臉被打破，露出了恐龍人的皮膚。
阿達姆逃到天台，準備開啟丸迫奈扎，可惜沒有成功。
于是阿達姆聯系宇宙中的那伽人，那伽人用意念回應了阿達姆，讓其復活丸迫奈扎2號。隨後阿達姆啟動丸迫奈扎2號開始對城市進行破壞！
大古和伊舞來到天台開始勸說阿達姆。一番動之以情，曉之以理後，阿達姆听了伊舞的話，開始嘗試將丸迫奈扎2號停下來。結果丸迫奈扎2號不受他控制。
阿達姆有點崩潰，因為他意識到那伽人真的在欺騙他們！
此時，2號丸迫奈扎正在向1號前進。
原來當兩頭怪獸靠在一起時，中子彈就會爆炸。這就是那伽人的陰謀。
楊光看到這里，突然有了一個想法，就是將兩只怪獸體內的中子彈取出，扔到那伽人飛船上引爆。
“哈，我真是個天才，我的智力雖然沒有點在發明上，但點在了戰術上。”楊光自豪的心想。
“大古，能听到嗎，我準備將怪獸體內的中子彈取出來，然後扔到那伽人的飛船上，到時我們發射光線引爆中子彈，將那伽人和他的飛船一同銷毀。我來取丸迫奈扎2號體內的中子彈，你去取1號的。”楊光用奧特念力與大古交流道。
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“明白！”大古回答。
楊光來到沒有人的地方，掏出神光棒變身為蓋德奧特曼出場。
看到丸迫奈扎2號開始向1號前進，二話不說上去就是一個正蹬，將其踹倒在地。
為什麼總是這招先起手！
蓋德也很無語，因為對方不還手，一心想要和1號合體，身體直接往前送，本能就出腳了。
那伽人看到有奧特曼阻擾，知道不解決這個奧特曼，無法讓1號和2號合體，于是命令丸迫奈扎2號攻擊蓋德奧特曼。
說實話，機械恐龍丸迫奈扎的力量非常強，而且防御很高，要是迪迦的話估計又要被捶。可對戰的是蓋德，那就不一樣了。
蓋德對著丸迫奈扎2號就是一頓攻擊，然而丸迫奈扎2號雖然不斷的被蓋德打倒在地，可是受到的傷害不高，防御高得確實沒話說。
蓋德眼看平a不起作用，于是將光能蓄力到右手，整個右手和小臂都發出光芒。蓄力轟擊在丸迫奈扎2號的頭部，將整個頭打碎。丸迫奈扎2號此時終于失去行動能力。
蓋德徒手取出中子彈。
大古那邊也變身為迪迦，順利取出中子彈。
兩奧點頭確認，飛上太空來到那伽人的飛船附近。同時將中子彈扔出，兩奧開始蓄力，又同時發出光線，將中子彈引爆。巨大的爆炸使那伽人和他的飛船都化成了碎片。
在這麼大的爆炸下，那伽人肯定無法存活！
兩奧返回地面變成人間體的模樣。來到兩位恐龍人面前。
“你們可以留下來在地球生活。因為你們本來就是地球種族。希望我們可以和平相處。”楊光說道。
“不了，我們差點釀成大錯毀滅地球，沒有資格生活在這里了。”阿達姆說道。
“我們恐龍人會找到一個新的家園。”伊舞也說道。
“再見蓋德奧特曼，迪迦奧特曼！謝謝你們保護了地球。”阿達姆和伊舞同時說道。
然後變成恐龍人的真面目，召喚出飛船離開了地球。
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