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恢復和太平洋陣線的聯系後，歐盟此時才終于得知了日本遭到cn部隊佔領的消息，太平洋陣線的部隊撤往了其他還未淪陷的地區，其中一些還未能成功撤離的重要技術人員被留在了那里。
盟軍抓住通訊設施重歸安全的短暫時間重建了與太平洋陣線的通訊聯系，獲勝的機會依然是存在的。雖然波西米亞最終還是被甦聯攻陷，但好在盟指終于從西格弗里德那里獲得了悖論計劃的關鍵情報︰這是為將失去一切的人所準備的希望。在上一次世界大戰之後，愛因斯坦認為干預時空連續性是極其危險且違背人道主義的。實驗中出現的一個又一個犧牲者折磨著愛因斯坦的良心，于是他在臨死前決定加密有關悖論計劃的全部科研數據和資料。缺少如他一般的天才頭腦的支持，悖論計劃有可能永久塵封于歷史中。但愛因斯坦和他的朋友知道，自由國度的軍隊或許將再一次需要超時空傳送儀的幫助。
愛因斯坦為超時空科技留下了線索，所以人們在必要時可以重新啟動這些裝置。現在，西格弗里德的命運科技在歐洲領導著這項研究。顯然，在日本的太平洋陣線人員也參與了悖論計劃的研究，他們的研發由金川工業領導。但不幸接踵而至，cn最終還是參戰了，目前他們已經佔領了日本的部分地區。若不是尤里的心靈技術已經將這個消息封鎖了幾個月，盟軍早就該得知這一情報。（難道不是情報部的廢物才導致了這樣的情況麼？）為了這一計劃的完成，西格弗里德需要撤回這些科學家，因而他決定使用目前仍不穩定的下一代超時空傳送儀進行一場賭博，嘗試救出被困的科學家。根據科學家們傳來的最後訊息，他們躲藏在京都的妙心寺之中。
“他又一次拯救了盟軍。”盟指得知悖論計劃的由來後感嘆愛因斯坦的遠見。“是的，教授還是為我們留下了後手，時間的錯誤只能由時間來彌補。他在生命的最後時間里經常對我這麼說。”西格回應。
“我們能調動的部隊有多少?”盟指問副官。“所剩無幾，只有一名特工待命，他事先準備了一台長劍機甲。”
“長劍機甲，怎麼樣的軍備？”盟指問。
“長劍步兵裝甲在太平洋陣線的地位和其他盟軍子陣營的步兵戰車相同。這種步兵裝甲還具有一些獨有的優勢︰相比于其他的步兵戰車，它裝備了經過強化的炮塔，使它能夠更快地應對即將到來的威脅，它擁有更高的載員存活率，並且完全不受諸如輻射，毒氣之類的不良環境影響。這種曾被用于執法的機器人，最初的計劃是要將其全自動化。然而全自動化機甲的人工智能系統在東京的某次示範演習中發生了故障，導致了一名企業家被誤殺。這個計劃因此不得不被廢棄，改為由一名駕駛員來駕駛。”副官把長劍機甲的資料告訴了盟指。
“ai控制的武器麼？我記得我們以前也開發過類似的武器，後來因為ai失控被放棄了。”盟指對這種武器很感興趣。
“本次任務所用的長劍機甲原型機需要一名駕駛員才能運作。我們的特工可以勝任。”副官提醒盟指別想直接交給ai運作，還得由他指揮。
“那就開始吧。”盟指得知基本情況後連接上了指揮系統，開展營救行動。
“為了保證超時空傳送的安全性，我們準備了一輛戰斗要塞，把營救出來的科學家集中放置在里面準備傳送。”西格提醒。
“明白。”
日本京都，妙心寺。cn的部隊和太平洋陣線的叛徒部隊正在附近搜尋著這些科學家的身影。盟軍潛藏于此處的特工找到了潛藏在此的長劍機甲原型機，“謝了伙計，我又欠你一個人情了。”特工對著幫自己送到任務目標的合作伙伴說道。
“沒事兒，這是你幫我的報答。”特工的線人把特工送到長劍機甲的原型機附近後就離開了，他要去找一個女孩兒。
“指揮官，我已就位。”特工爬上長劍機甲原型機向盟指報告。
盟指看向地圖上已經被副官標記好的四位科學家的位置，心中已經擬定好路線，“開始行動。”他下達了命令。
“指揮官，鑒于長劍機甲並不適合面對甦軍的裝甲部隊。所以我建議不要和它們產生正面沖突。”副官建議盟指。
長劍機甲原型機啟動後的第一目標是到東南角的一處廢棄基地里找到一個補給箱，里面裝有一些備用配件可以用來強化機甲的火力。
取得補給後機甲大踏步地到達了科學家a的所在位置附近，甦軍的小隊在尋找過程中被長劍機甲的機炮殺死。
“哦，謝天謝地。終于有人來救我們了。”科學家a確認周圍沒有埋伏後提著滿載著資料的手提箱走出了躲藏地。
“指揮官，每一位科學家都可以通過他們手里掌控的資料在長劍機甲原型機里組裝一種新武器。”
小心繞過巡邏的坦克，向著第二位科學家所在地前進。甦軍在此地還部署有女媧加農炮這種重型火炮，長劍機甲的護甲可擋不住它的轟擊。
科學家b帶出來了一個修理箱幫助長劍機甲修復了損傷。
科學家b所掌握的武器是一種特制的光稜科技，他利用手頭的資料在長劍機甲上攢出來一台光稜炮。
盟指靠著這台光稜炮把擋路的炮台打掉後發現了科學家c，如此一來已經有三位科學家被找到，只剩下最後一位距離相對較遠的科學家了。
等待科學家們集合完畢，盟指指揮特工駕駛著長劍機甲向最後的目標前去。
長劍機甲的載員位有限，科學家們提著資料艱難地跟在長劍機甲原型機後面，盟指焦急地看著遠遠落在後面的科學家卻毫無辦法。
特工在前方開路，掃清一切障礙。為了避開巡邏的裝甲部隊，他們走的是遍布樹林的地區。路況不好長劍機甲原型機完全可以克服，後面的科學家可就遭老罪�@ br />
有驚無險的行進過後，盟指發現營救部隊和最後一名科學家之間有重兵把守，自己手里缺乏對抗重型單位的武器。
這時候科學家a給盟指提議在不遠處的一處采礦場里還有一名忠于太平洋陣線的重裝大兵，他可以幫助盟指解決問題。
事不宜遲，科學家們藏在樹叢里，盟指指揮長劍機甲原型機朝著采礦場而去。
一路上並沒有發現什麼異常，除了躲避甦軍巡邏的麒麟坦克以外並沒有發生什麼意外。趁著礦車外出采集礦石時溜進去了采礦場當中聯系上那位重裝大兵，順便幫助他消滅了追擊的部隊。
帶著重裝大兵的長劍機甲原型機破壞了擋在盟指面前的障礙。最後一名科學家終于回歸了盟軍。
接下來就是帶著科學家們前往撤離點了，那里會有提前安排好的車輛幫助他們撤離。
“指揮官，西格會在十分鐘後投放超時空傳送，請在此之前把科學家們送到撤離點。”
撤離點距此並不遠，長劍機甲很快就為科學家們掃清了前進路上的障礙，四名科學家成功登上了玄武戰斗要塞。
“這麼快，真是讓人驚訝。指揮官。”操作超時空傳送儀的西格提前釋放了超時空傳送，玄武戰斗要塞駛進了超時空漩渦。
科學家們被安全傳送到了德國境內，這使得盟軍高層們都松了一口氣。同時這也讓盟軍意識到超時空傳送儀是一種不可或缺的強大武器，這次行動的順利成功也是給盟軍的將士們吃了一顆“定心丸”。
然而一波未平一波又起，“指揮官，壞消息。科學家們並沒有傳送到預定地點，根據定位顯示，傳送地點偏離了幾公里，他們被直接傳送到了黑森林的戰場上。”
“該死，馬上組織周圍所有部隊朝著目標位置靠攏，我馬上就到。”盟指顧不上休息，準備投入下一場營救行動當中。
而此時，甦俄與cn的部隊正在對黑森林以及命運科技實驗室發起猛攻。盟軍指揮官和西格弗里德不得不再次披掛上陣，親自護送科學家們安全抵達。
“任務完成，指揮官。”東京，隱秘特工成功捕獲了目標人物，正在等待上級指令。
“準備撤離。”