眾人立刻轉變目標，開始搜尋起了康杰博士的行動。
不過在眾人離開之後，之前一只沉睡的那只怪物，甦醒了過來，對著眾人開始了追逐，眾人設計將她困在了一間金屬房間，這才擺脫了這只怪物。
所以故意將情報泄露給了反動者聯盟，想要將康杰博士解救出來。
康杰博士的手下團隊看不過，康杰博士的作為，所以將康杰博士給囚禁了起來，準備銷毀康杰博士的研究資料。
這就是導致接下來一連串的行動。
眾人知道真相後皆是一臉的錯愕，其中正義的警察大叔都忍不住爆粗口，狠狠的罵了康杰博士一頓。
造成地球這副模樣的原因就是康杰博士的研究。
于是他們直接在地面上開了一個大洞，朝著地下墜去。
很快他們就來到了地下二層，在這里他們遇到了更多的怪物，不過憑借著眾人的能力和優秀的裝備，眾人還是突破了怪物的封鎖，找到了康杰博士。
此時的康杰博士正一臉興奮的，在一台超級計算機前面做著。
在眾人出現了一瞬間，康杰博士也發現了眾人。
還沒等眾人的動作，康杰博士之後笑著夸贊了眾人幾句，然後直接摁開了某一個按鈕。
緊接著地面開始劇烈的震動，最後開始瘋狂的塌陷，此時地面上的科技塔開始了劇烈的震蕩，緊接著全部崩潰，一個巨大的身影走了出來，這是一個人形怪物，不同于其他怪物的是，這只人形怪物當中有百米之高，人類在他面前就如同螻蟻一般。
而他身上有許許多多的通道，這些通道上方都掛著之前對主角他們出手的那種怪物。
既然這些怪物的源頭就是這只巨大的人形怪物！
而這只人形怪物可以號令這些怪物，進行攻擊，而從他的行為上來，這家伙顯然是擁有智慧的。
在這只怪物出現之後，多方勢力立刻聯合對其打擊，但一直不見效果。
打到最激烈的時候，主角他們也終于從地下出來了。
與此同時，他們手中正抓著康杰博士。
原來在最後關頭，他們還是將康杰博士抓住了，只不過康杰博士絲毫不配合，面對這巨大的災難，一直宣稱這是人類的進化。
眾人沒有辦法，只能選擇另尋他法。
好在之前的塌陷，並沒有損害之前那套超級計算機，學生準備通過異能從超級計算機里尋找辦法。
其他人則是面對那不斷來襲的怪物。
看著那些體格龐大的怪物，眾人不禁咽了咽口水。
之前面對一直，眾人已經被打得焦頭爛額，現在卻要面對這麼多只，看起來眾人就要命喪于此了。
但眾人也沒有辦法，只能與這些怪物進行周旋。
看著眾人拼命的場景，學生也是急不可耐，拼命壓榨自己的能力。
在這種情況下，他的能力再一次進發，整個人必為數據化進入了電腦之中，以超絕的速度進行搜尋。
看到這副景象，康杰博士卻突然急了，有些瘋狂的沖向了超級計算機，結果中途就被摁了下去。
看到康杰不是這副樣子，眾人知道，超級計算機里一定有解決的辦法。
于是眾人玩命的進行防守，再堅持了整整一刻鐘之後，學生終于出來了。
一出來他就大喊道，有辦法了，有辦法了。
原來，研究這個項目的主科專家並不止康杰一個人，還有另一個偉大的科學家——格斯勒，這家伙的天賦比康杰博士還要強。
不過比起康杰博士來，這家伙的性格比較穩鍵，無論康杰博士怎麼說，這家伙都不同意康杰博士的人類進化計劃。
一怒之下，康杰博士殺死了格斯勒博士，不過他沒想到的是，性格穩健的格斯勒博士在死之前就研究出了進化的解藥。
雖然康杰博士銷毀了所有的資料，但是看著面前的解藥，他最終還是沒有直接扔掉，而是選擇藏了起來，而這份解藥就是解決目前困境的最好方法。
在一連串的激發之後，主角成功了，他成功將自己的能力開發出了新的技能——陰影探索。
通過陰影探索，主角發現地下並不只有一層，還有更深的一層被隱藏了下來。
如果猜的不錯，康杰博士正在這更下面的一層，開始主角他們根本找不到通往下層的道路。
只不過反動者聯盟終歸不是政府軍和科研機構，還有幸存者聯盟的對手，只能邊打邊退，進入了科技塔，跟隨著反動者聯盟，其他勢力也全部都進入了，科技塔，最後的決戰馬上就要爆發了。
另一邊，康杰博士也從反動者聯盟的控制中消失了，現在所有的勢力都在尋找康杰博士的位置。
主角這邊經歷了幾場大戰，但始終沒有搜尋到康杰博士的位置。
眾人現在急不可耐，在這時主角想起了自己能力的介紹，和之前能力覺醒的樣子，覺得可以依靠自己的能力進行一波實驗。
于是主角使用了大量的能量藥劑，對自己的能力進行深度開發。
而在這一段時間，政府軍，科研機構，反動者聯盟，正打的十分激烈。
不過現在顯然不是計較這個的時候，必須盡快捉住康杰博士才行。
這時三姐妹的老三說她有辦法。
原來他的能力是形態轉變，可以將物質和能量的形態進行轉變。
之所以將真相隱藏，就是為了防止真相被公布，引起慌亂。
雖然不想這麼做，但為了解決這場危機，他們需要康杰博士的大腦，所以才留下了康杰博士一命。
結果被康杰博士率先發覺，這家伙一不做二不休，直接將自己的研究成果發送到了全世界，然後就造成了這場巨大的危機。
政府軍是為了解決這場危機，所以才將康杰博士帶我，而那些科技團隊也是為了解決這場危機，主動投靠的政府軍。
但是沒想到，在所有的科學家中，還有一部分人贊同康杰博士的行動，認識為這是一場人類的進化。
之前在營地里那個科學家，就是康杰博士的弟子，而且十分認同康杰博士的行為。
(a)