袁宗煥尋赴前屯安置遼人之失業者，夜行于荊棘、虎、豹之中，四鼓天入城，將士莫不壯其膽。王在晉深為倚重他，王在晉上疏在八里鋪壘重城，袁崇煥卻認為此舉無遠略，不盡遵其令，反向當時任首輔的葉向高建議守宗遠。
孫承宗沒有馬上表態，而是和薊遼總督王象乾商議。王象乾道︰“廣寧之戰我軍新敗，榆關守軍不宜輕動，可與插汗部商議，讓虎敦兔汗發兵三千人往。”
關于十三山義民的事情，孫承宗回京後，在給天啟皇帝的奏折里，是這麼說的︰“至九月初六日山民被陷。此一事，臣從七月間于督臣議于檀，督臣許為臣諭密出兵三千防東西之患，臣更欲從眾議以兵屯寧遠，稍近迎之以為依，而竟不能得。今接之無多，忽為所陷，此中關系甚大、甚遠。”
王象乾因為虎敦兔汗沒有發兵營救，自感對不起這些遼民，于是上了辭呈，曰︰“遼民被陷引咎乞罷”，天啟皇帝沒有同意他的辭呈。
王在晉其實早在孫承宗來巡視之前，對營救十三山義民之事就有安排；王在晉給天啟皇帝上過一道題《救遼民疏》︰“臣惟山海一關習逃之卒，心如不𡡒D 邸 治勢 我醞 齲 簧礁 荒薌聰攏 氳霉儔 藶卜嬌剎哂Α７蛞運氖 鎦 剿奈Ы右 塹檬 蛉瞬豢桑 孛歐朗匚炊 蟊 慰汕岱 擅裰 豢紗媯 砦藜纂校 薨奧恚 豢晌 Ｗ笫制蓿 沂腫櫻 荒茉抖蕁 摶言蛭┬惺怪 倍藎 乙員 蛹冒捕儆誥躉 骸！ br />
胡子睿曾經看過地圖，寧遠距離十三山堡有二百里路，十三山堡一帶的山勢險峭，而且還隔了大凌河、小凌河兩條河；這麼大的運動量，別說在大明，就拿到現代來說，也可以構成鐵人三項賽的內容了；試問“貧寒交迫”的遼民們即無甲冑，也無馬匹，更攜妻帶子，如何能逃出建虜的包圍圈和追擊，到達寧遠？所以袁崇煥這個建議，對于十三山義民來說是一個“不可能完成的任務”！只是袁崇煥為實現自己主張守寧遠的借口而已。
王在晉坦言如果要將十三山堡一帶的遼民都救出來，需要數萬大軍才能成功，當時取集到山海關的軍隊，都是從廣寧等地撤出來的殘兵敗將，被建虜追擊嚇得“驚魂未定”，他們又如何能完成如此高難度的營救行動，所以只能靠民眾自救；但是王在晉並不是沒有任何作為的，王在晉派出游擊魯之甲以米三千、布二萬、綿一萬往迎乘雨逃出的陷虜回者，其人可六千，即十三山義民也，後來又檄通判吳士科以舟船泊筆架山迎之。
在接回十三山義民之後，王在晉在給天啟皇帝的奏折中，曾記錄了一件催人淚下的軼事︰“今大山有七百人黑夜潛偷下山，至海邊渡上覺華島，嬰孩都害死，問其何以害死，曰︰‘恐兒啼，賊來追趕也’。”
王在晉被暴動者寧可害死自己的兒子，也要回歸明朝的信念所感動，決心好好安置這些歷經九死一生的義民︰”俟天寒冰結奴騎可驅，兵船難渡，或暫移于寧前之間。蓋覺華島去寧遠城二十里，凍則履海如平地，非遠洋巨浸之可擬也。島無薪無水不能容多人，且人多船少難于接濟。臣又檄朱梅、周守廉等撥發哨兵暨勇健家丁，以夷人為引路護導前行，留駐前屯安頓。挑選精壯訓練為兵，存留老弱撥田使種。”
胡子睿知道後來袁崇煥在守寧遠時，也是一樣的隆冬時節，當時也是海河結冰；袁崇煥不但不學王在晉轉移覺華島居民，反而將糧食、軍械搶運上覺華島，結果建虜果然踩著冰攻上覺華島，:後來同知程維漗巡視後上報道︰“虜騎既至，逢人立碎，可憐七八千之將卒，七八千之商民，無一不顛越糜爛者。王鰲，新到之將，骨碎身分;金冠，既死之櫬，俱經剖割。囤積糧料八萬二千余，實已盡焚。“
王在晉之後的命運已經確定，就在孫承宗的這篇奏折之後沒多久，王在晉就被天啟皇帝調出遼東，去當南京吏部尚書。王在晉這個好不容易被選出來的遼東經略被孫承宗趕走了，現在這個位置又差人了。
孫承宗上疏道︰”大約關上之弊，將不問兵，獨有乞升乞調；兵不問技，獨有乞賞乞糧。臣之意，欲以及時練兵選將為實著，而以用毛文龍，西虜為虛活之著。其道在有沉雄博大、端謹精詳之大臣，力去逃官逃將，以洗天下之心而新其耳目。其主意在守，而其守在力修戰具。其戰具在關，而提掇全鎮之精神在關以外。“
孫承宗繼寫道︰”遼之土雖陷關外，而當有聯絡關內之襟期；遼之人雖奔關內，而當有安頓關外之籌策。故必有包括全遼之度乃可以畢遼事。議不在同，而要在盡天下之情，以竭其智。謀或有異，而要在研天下之幾，以集其成。如督臣王象乾，有大臣之概而曉鬯夷情，即眼以老昏而精神尚自矍鑠；經臣王在晉，精勤有余，而筆舌更自迅利，然沉雄博大之未能；兩撫臣李瑾、王國禎，俱精祥端謹；道臣袁崇煥，英發貼實，綽有擔當，自願為大將，臣取其志尚欲練其氣；閻鳴泰沉雄博大有之，端謹精詳亦有之，然成色未滿八分。又聞諸臣言，新侍郎王之吴之精練、舊淮撫李三才之挺拔、宣撫王之臣之主持熟夷情，皆可備經略之用，而臣未見其人也。”
孫承宗還推薦了一個人，那就是在後世大名鼎鼎的袁崇煥，不過此時的孫承宗還認為他需要歷練一番；孫承宗認為王之吴、李三才、王之臣三個人都可以出任遼東經略的人選，而閻鳴泰不是合適的人，然而與孫承宗的想法“背道而馳”，廷議的結果仍然是閻鳴泰，孫承宗不認同，當時就有朝臣出來質疑孫承宗，王在晉熟悉軍務，能寫會說，你非要說人家不夠沉雄博大；閻鳴泰沉雄博大有之，端謹精詳亦有之，你又說人家火侯不夠，那你老推薦一個？