萬歷二十九年（公元一千六百零一年）利瑪竇將《坤輿萬國全圖》獻給萬歷皇帝，得到萬歷皇帝的稱贊，還發給他大明官員的俸碌；內閣首輔葉向高接見了利瑪竇，並與他下了一盤圍棋，利瑪竇在《利瑪竇中國札記》中記錄此事，這件事也是歐洲人對中國圍棋的最早記錄。
內閣首輔葉向高贈給利瑪竇一首詩，《詩贈西國諸子》“天地信無垠，小智安足擬。爰有西方人，來自八萬里。言暮中華風，深契吾儒里。著書多格言，結交盡賢士。淑詭良不矜，熙攘乃所鄙。聖化被九埏，殊方表同軌。拘儒徒管窺，大觀自一視。我亦與之游，冷然待深旨。”葉向高此首詩的手稿後來碾轉來到歐洲，現存于法國國家圖書館。
後來利瑪竇于萬歷三十八年（公元一千六百一十年）病逝于北京，按照大明制度規定，傳教士死後都應該葬于澳門，不能夠葬在京城。
接任利瑪竇的傳教士龐迪我向萬歷皇帝上奏章，力求讓利瑪竇葬于北京“利瑪竇以年老患病身故，情實可憐，況臣利瑪竇自入聖朝，漸習熙明之化，讀書通理，朝夕虔恭，焚香祝天，頌聖一念，犬馬報恩忠赤之心，都城士民共知，非敢飾說。生前頗稱好學，頗能著述，先在海邦，原系知名之士，及來上國，亦為縉紳所嘉？臣等外國微臣，悲其死無葬地，泣血祈懇天恩，查賜閑地畝余，或廢寺閑房數間，俾異域遺骸得以埋瘞，而臣等見在四人，亦得生死相依，恪守教規，既享天朝樂土太平之福，亦畢螻蟻外臣報效之誠。”
龐迪我在此封奏章中，稱中國文明為熙明之化，大明王朝為天朝樂土，又將利瑪竇和自己比作犬、馬、螻蟻，言詞恭敬地表達了對中國文化及大明皇帝的敬意。萬歷皇帝念及利瑪竇所獻之《坤輿萬國全圖》有功勞，于是動了惻隱之心，並批準了龐迪我的要求，將利瑪竇葬于北京西郊的藤公柵欄（今存于北京行政學院院內）。
言官曾經對萬歷皇帝批準利瑪竇葬于北京的事，以“從來無此先例”為由，提出反對意見。葉向高慨然道“自古來華洋人中，其道德學問，有一如利子乎？毋論其它事，即譯《幾何原本》一書，便宜賜葬地矣。”
利瑪竇墓園現仍存有萬歷三十八年立的墓碑一座，碑文是:“利先生諱瑪竇，號西泰，大西洋意大利亞國人。自幼入會真修，明萬歷壬辛年航海首入中華衍教，萬歷庚子年來都，萬歷庚戌年卒。在世五十九年，在會四十二年。”利瑪竇也成為中國歷史上首位葬于北京的西方傳教士。利瑪竇的著作不僅影響了中國人，也影響了同屬中華文化圈的朝鮮，日本等國，日本作者平川佑弘在其所著《利瑪竇傳》就對其作了高度評價，稱贊他是”世界公民！“、“人類歷史上第一位集歐洲文藝復興時期的諸種學藝，和中國四書五經等古典學問于一身的巨人。”
在胡子睿看來，這張《坤輿萬國全圖》已經非常接近于後世的世界地圖了，而這張圖本身是中西文化互相交流的產物，比如在這張圖上的歐羅巴洲西班牙國，上面有注解文字:“(歐羅巴洲）去中國八萬里，自古不通，今相通近七十余載雲。“
利瑪竇本身只活了五十九年，為耶穌會工作也只有四十二年的時間，怎麼可能相通七十余載？更何況明朝後來一直在萬歷皇帝死後的隆慶時期才開海，利瑪竇在地圖上”原封不動“地引了用這段話，足以證明在他編制地圖時，參考過不少前人編制的地圖，這些圖中很可能包括鄭和當年下西洋的海圖，從鄭和下西洋的年代倒推七十余載，應該是蒙元時期，這倒是勉強可以對得上面這段話了。
在關于南美洲的地方還有一段文字也可以證明“南亞墨利加今分為五邦，一曰孛露，以孛露河為名;二曰金加西蠟，以所產金銀之甚多為名;三曰坡巴牙那，以大郡為名;四曰智里，古名;五曰伯西兒，即中國所謂甦木也“，旁邊還有一段注文稱:“伯西爾此古甦木“。胡子睿知道所謂甦木是明朝人對巴西的簡稱。
這些證據都有力證明了明朝對于整個世界都有清楚的認識，整體的文化範圍是”包容並舉“、”積極吸收先進科技知識；直到明朝末年，中國人的地理知識、制圖水平並不比西方人落後太多；而到了滿清執政時，由于他們狂妄自大的心態，導致對世界的認識出現了極大的倒退。
滿清入關後，將《大明混一圖》不分鑒別的全部貼上滿文標鑒，以滿足其並吞四海的虛榮心，直到第一次鴉片戰爭時，道光還不知道打敗了自己的這個英吉利，畢竟在那里，光緒時的眾臣徐桐在談判時連西班牙、葡萄牙都不知道，還說這是英、法國胡編出來的，最後還得從幾百年前明朝人的《坤輿萬國全圖》，找到準確的地理位置和海上航線。
在地球另一端的歐洲，提出日心說的伽利略受到教廷的迫害，被囚禁在家中；相比之下，明朝上至崇禎皇帝、下至徐光啟這樣的大臣，對于西方先進的科技文化，是那樣“如饑似渴”的吸收、引進，崇禎皇帝在其執政晚期，那種極度困難的情況下，還命徐光啟編輯《崇禎歷書》；然而，直到明朝滅亡的時侯，牛頓還沒有出生，科技發展的曙光還沒有出現
幾千年來，從秦漢到宋明，中國一向奉行“睜眼看世界“的傳統，而滿清為了鞏固自己的野蠻統冶，大搞文字獄，自已選擇“閉關鎖國“、，沉浸在天朝上國的美夢中，殊不知，就在他們“閉上眼楮睡大覺“二百年的時間，正是西方工業化飛速發展，科技水平日新月異的時期，不得不說，滿清的統冶正是近代落後的政冶根緣所在