永歷五年五月二十二，鄭成功所部按照原定計劃進入磁灶地區。隨即，鄭成功所部明軍便開始收集糧草、稅賦，一如半個月前進攻永寧衛城和崇武千戶所城那般。
這是再正常不過的事情了，畢竟軍無糧則散。更離譜的鄭成功都做過，比如奪取廈門島後，鄭成功一度奪取了高浦寨，結果卻並非是為了佔據，僅僅是把寨子的磚石都卸下來運走，最後留了一個被夷為平地的寨子給清軍。而那些被運走的磚石，則大多用在了修復五通寨以及鄭芝莞修復中左所城的用途上了。
收集物資是鄭成功所部向清軍佔領區動攻勢時幾乎必做的事情，福建這邊見識過太多次了，卻也並不新鮮。然而，新鮮與否不重要，重要的是磁灶一帶的地主們受苦了，鄭成功收集糧草時，對窮苦百姓往往會網開一面，但是這些地主家里有糧有錢的，肯給清廷交稅卻不肯給明軍納稅，這總是說不過去的吧。
這邊鄭成功開始收集糧草和賦稅，那邊地主們便派了人去向清軍求援，以求減免損失。數日後，漳州總兵王進率一千騎兵、兩千步兵抵達，便與明軍對峙于此。
原本的漳州總兵王邦俊已經死在了盤陀嶺，清廷以王進為總兵官，也是看上了永歷元年的泉州之戰，王進為泉州清軍解圍時的表現。奈何這位王老虎接下的卻是個爛攤子，王邦俊被殺，近兩千漳州清軍失蹤于盤陀嶺，被殺、被俘，他們連個大概的數字也無，唯有重建。而他的對手，也不再是當年的那個初出茅廬的鄭成功了，而是如今鄭氏集團的新領，帶甲不下兩萬的國姓爺。
按照原定計劃，鄭成功以戎旗鎮埋伏于磁灶山坑南，以援剿右鎮埋伏于磁灶山坑北，以左先鋒鎮和援剿左鎮埋伏于磁灶社內，另遣親丁鎮、前鋒鎮、右沖鎮三鎮誘敵。
鎮守漳州府總兵官一職，前後二人皆是姓王。奈何，歷史上的王邦俊先是在盤陀嶺之戰大敗明軍，陣斬柯宸樞，全殲中沖鎮，隨後在第二年又順利的為潮州解圍，逼得鄭成功不得不重新下海，對鄭成功心存不屑，才會誤入包圍圈。而今時今日的王進，雖然也曾為泉州解圍，奈何他一不是王邦俊，二來鄭成功這幾年展比之歷史上要順遂太多，前不久的馬得功、黃澍不說，就連王邦俊的腦袋都已經用來妝點福建明軍的功勞簿了，此時此刻的他是萬萬不敢再輕敵了。
王進一邊在此保持存在，與明軍對峙，一邊派人回漳州向協守的福建左路總兵王之綱求援。王之綱本是高杰的部將，所部比之他的那些前流寇部下的戰斗力更勝一籌。王進不敢托大，便在此對峙，只可惜鄭成功從不是個不知變通的榆木疙瘩，此刻一旦現王進不肯進入圈套，便立刻解除設伏，出動全軍向清軍起進攻。
明軍總兵力不下八千，是清軍的兩倍有余，王進透過探馬，現明軍的編制似乎有些奇怪，仗著騎兵數量遠勝于明軍，擇一寬闊適于騎兵揮的所在列陣，借交鋒權作試探，結果竟被明軍輕而易舉的擊潰。
王進小挫即逃，清軍仗著騎兵數量的壓制力，不斷的利用機動能力與明軍周旋，最終帶著大半的部下逃了回去，與剛剛出城的王之綱一同縮回到了漳州府城里。
磁灶之戰，最終以明軍取勝告終，鄭成功更是擊潰了多年前恨之入骨的敵軍。唯獨有些可惜的是，王進沒有王邦俊那般驕橫，沒有進入埋伏圈，雖說同樣是戰敗了，但是損失要少上太多，丟下了一些實在救不出來的殿後部隊便逃之夭夭了。
斬獲不及預期，但終究是一場勝仗，鄭成功按照眾將及各鎮表現，以甦茂、林勝二鎮為功，甘輝官兵為副功，萬禮、柯鵬官兵為又副功，照中敵賞格升賞。隨即，率部返回廈門，結果剛剛回來便听說了施瑯越獄而逃的消息，當即便是勃然大怒。
施瑯其人，雖然權謀水平，或者說是情商方面不高，但是統兵、練兵的上面還是很有一套的。除此之外，施瑯一度作為鄭成功的謀主，對于鄭氏集團以及鄭成功麾下的這支福建明軍的內情知之甚深，一旦為清軍所用，危害極其巨大。
這方面乃是其一，更重要的在于，鄭成功將看押施家父子、兄弟的任務交給了他的親信部將林習山，結果人莫名其妙的沒了。林習山對此一無所知不說，其副將吳芳的供詞之中，也多有匪夷所思之處。比如來人持鄭成功下公文，吳芳為何沒有仔細查看；再比如行至半路，吳芳一行人被打暈，一是來人為何沒有殺他們滅口，二是他們被突然打暈，是一起被打暈的，全部都沒有反應過來，就好像是商量好的一樣，這些疑點無不是在暗示著林習山大有存在著監守自盜，派遣部將設計暗放施瑯的可能。
鄭成功盛怒之下，便要處死林習山，以儆效尤。林習山是鄭成功的老部下了，追隨多年，與眾將的關系也都不錯，此刻當即便有眾將下跪請求鄭成功收回成命。
節堂之中，眾將懇求之聲此起彼伏，便是鄭成功，其心中也不免有些觸動。當年清軍屠戮安平鎮，他趕到時已經晚了，埋葬了母親的尸骨，決定焚衣起兵。當時如洪旭、陳輝、林習山這等人物，雖然手上都沒有什麼兵馬了，但是在那些奉鄭芝龍命令降了清軍的舊部中的威望卻還是頗重的。前去降清，多了不說，一個富家翁總還是有的，更有存在著清軍為分化降清閩軍而要用他們的可能。但是他們一個個的，不光是沒有降清，更是連諸如鄭彩、鄭鴻逵這般比他實力更強的鄭氏集團頭目也未有跟隨，反倒是跟著他一路漂泊到了南澳島，從那毫無希望的絕境中走到了現在。
盛怒褪卻，鄭成功已經有了悔意，而且細算起來，林習山確實存在著設計釋放施瑯的可能，因為是他將施瑯交給了吳芳來看押，但是吳芳的問題更大。而且無論是林習山，還是吳芳，他都沒有切實的證據。此刻眾將苦勸，鄭成功也打算就著這個台階下來，但是對于吳芳，即便是沒有監守自盜，也存在著看押上的疏忽，他是絕對不會輕易放過的。
話已在嘴邊，奈何尚未出口，一個親兵急匆匆的推門而入，隨即三步並作兩步的趕到鄭成功身旁，附耳報告。
聞言，鄭成功當即便是一愣，隨即也顧不上這些部將了，連忙趕了出去。直到一艘剛剛駛來不久的海船上，看到了施瑯的那具早已經涼透了的尸身，懸著的心落下的同時，更大的震驚接踵而至。
“陳參軍沒有說他是如何確認施瑯一定會從那里登岸逃亡的嗎？”
“回國姓爺的話，沒有。陳參軍只說了句以防萬一，瞎貓還真撞上了死耗子，便再沒說過旁的。”
“瞎貓撞上死耗子？”
鄭成功旋即搖了搖頭，心中暗自道了句絕非那麼簡單，便轉而開始盤問那幾個被俘的親兵和隨從。結果得到的答案，與蔡巧派人帶回來的毫無出入。
“甦茂！施福！”
回到了節堂，眾將依舊保持著剛剛他離開時的姿態。此刻，無需懇求，鄭成功走到林習山的身前，雙手將這個追隨多年的老部下扶了起來。
“事情已經查明了，您是被冤枉的。”
“末將，末將……”
扶起了林習山，鄭成功隨即令眾將起身。然而就在眾將不由得松了口氣，準備站起來重新落座之際，鄭成功緊接著便說出了此言的後半句來。
“……除左先鋒鎮總兵官甦茂外。”
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