在第四戰區開始攻佔硫磺島的時候，西太平洋的第二戰區也同時發動了對菲律賓和荷屬東印度的進攻。
在菲律賓的登陸行動，讓山下奉文第一時間選擇暫時避開鋒芒，撤離沿海地區，放棄城市，轉為菲律賓的游擊戰術。
在登陸當天，第二戰區的三支主力部隊分別在菲律賓不同位置登陸。
第二戰區所屬的第十一陸戰師在呂宋島西部的聖安東尼奧登陸，攻佔聖馬塞利諾機場，甦比克海軍基地以及封鎖巴丹半島，阻止日軍往巴丹半島方向的撤退路線。
另一邊是第二戰區所屬的第三空降師以及一個滑翔傘降團在呂宋島南部的納甦格布登陸，向馬尼拉前進，邊上還有兩個步兵旅登陸，朝塔蓋山脊向北前進。
余下這是特種部隊零星作戰，負責協助三支不同方向的部隊，快速攻佔菲律賓境內的橋梁和交通要道。
此刻的菲律賓，早已經是一片狼藉，日本人放棄了大城市，也劫掠了大量的物資撤離，在紅警兵團抵達的城市之中，都是饑餓的菲律賓人，城市當中，留下了很多都還未打掃走的尸體。
然而就在紅警兵團登陸的時候，所面對的敵人，可不單單只有日本人，還有菲律賓人組成的游擊隊。
這些菲律賓的游擊隊，原本是抵抗日本侵略的武裝，以前一直都是美國人在資助，然而美國被滅，他們也就在菲律賓內自生自滅。
紅警兵團的到來，他們非但沒有感激，反而主動發起攻擊，菲律賓境內也爆發了三陣營之間的戰爭。
山下奉文並沒有如同歷史上，堅持到戰爭結束，在戰斗開始的三天之內，山下奉文的指揮部便被端掉，山下奉文的人頭高高的懸掛在馬尼拉的城市中心。
菲律賓境內的戰爭細節外界難以得知，只是知道當日本全面戰敗的時候，菲律賓境內的人口剩下不到原來的十分之一。
大屠殺的罪名被安放在日本人的頭上，歷史從來都是由勝利者來書寫的。
菲律賓戰爭之中，為了消滅游擊隊，動用了大量的化學武器，使得菲律賓從戰爭開始到持續結束的這段時間，爆發了十分可怕的傳染病。
然而有意思的是，這種爆發出來的傳染病，只有在日本人和菲律賓幾個主要種族之內傳播。
與菲律賓相隔的荷屬東印度也是如此，在登陸菲律賓的時候，第二戰區也同時在印尼登陸。
在菲律賓逐漸淪陷的時候，荷屬東印度的情況也是如出一轍，戰爭並沒有怎麼用到槍械武器，登陸荷屬東印度的紅警兵團，主要的任務就是收尸。
利用空氣傳播的病毒，一旦人體成功感染，持續的時間內，在三個小時到三天的時間之間，便會死亡。
因為病毒的死亡的人，外表沒有任何變化，病毒直接讓患者心髒衰竭，直到停止跳動。
過程十分的迅速，患者一般都是在睡夢之中，永久醒不過來。
一般被人發現的時候，身體都涼透了。
這種利用空氣傳播的病毒，十分有針對性，紅警兵團收尸的士兵，連防毒面具都不需要，也不需要防化服裝和手套，可以直接接觸感染者尸體，完全沒事。
而生活在這片區域的華人，也一點事情都沒有，一些人數較少的種族，也完全對病毒免疫。
這是因為傳播的病毒，都是專門針對性種族基因的病毒。
來自紅警兵團輻射工兵的產物，針對性的病毒，早已經研究透徹，這種病毒能夠根據不同種族的dna選擇性.感染，是一種能夠被控制，且壽命極短的病毒。
這種病毒存在于空氣中的時間，最多不會超過七天的時間，便會自我死亡。
存在于人體之後，在人體死亡之後，也會跟著死亡。
是專門針對菲律賓和荷屬東印度的很多種族研發出來的專用病毒，也有專門針對日本大和民族的病毒。
每一個種族之間，dna有一些固定的共同點，這些共同點，也就成為了病毒覆蓋的點。
此次戰爭之後，第二戰區也有魔鬼戰區的名稱，當然是內部稱謂。
外界只是知道，在這場戰爭的時候，菲律賓和荷屬東印度爆發了可怕的病毒瘟疫，因為戰爭的關系，患者得不到救治，加上病毒十分的可怕，患者短時間內大量的死去。
最終戰爭還沒有開始便已經結束，而外界也對紅警兵團報以同情的目光。
因為外界得到的消息之中，紅警帝國第二戰區，也有十幾萬精銳部隊因為病毒感染而死亡，如果不是醫療發達，及時遏制了病情，還會有更多人因此而死。
大量的尸體，在當地進行了焚燒，據說焚燒所產生的濃煙，讓這一個月的天空，充滿了陰霾。
沒有人覺得紅警帝國第二戰區，以如此重大傷亡取得菲律賓和荷屬東印度的戰斗，是一場勝利。
要知道，就算是攻佔美國，紅警帝國對外宣布的傷亡數量，也就是比這個多一點。
從太平洋戰爭爆發到現在，紅警帝國對外宣布的陣亡數量名單，也就只有幾千人。
一下子陣亡了十幾萬人，這對紅警帝國來說，是空前的代價。
日本國內到處都是慶賀的新聞，甚至對國內表示，紅警帝國在攻佔菲律賓和荷屬東印度的時候，付出了十幾萬精銳部隊的損失。
唯一比較遺憾的是，這個代價是犧牲菲律賓和荷屬東印度內的所有日本軍隊，所取得的戰果。
而就在外界以為第二戰區無力繼續發動攻擊的時候，第二戰區便在東南亞戰場進行了登陸。
東南亞的日本南方軍還沒有完全反應過來，便付出了沉重的傷亡代價。
日本南方軍總司令部被導彈摧毀，南方軍總司令寺內壽一直接被炸死，南方軍所有的聯隊級以上的指揮部，也全都遭到了毀滅性攻擊。
當第二戰區的主戰坦克登上東南亞的時候，日本軍隊早已經亂成了一團，各自為戰，毫無秩序。