仙劍奇俠傳四的故事要從兩把劍說起。
望舒羲和，一為月神一為日神，乃瓊華派執劍長老宗煉為了定住幻瞑界吸取靈力所鑄。
瓊華派妄圖舉派飛升，卻是動了犧牲幻瞑界的心思，此舉自然遭到幻瞑界妖族的反撲。雙方大戰爆發，瓊華掌門隕落，幻瞑界主嬋幽重傷。而就在這關鍵時刻，瓊華弟子雲天青與夙玉攜帶望舒劍私自出逃，導致幻瞑界脫離束縛，大戰結束。瓊華派功虧一簣，傷亡慘重，羲和劍主玄霄更是因為失去望舒調和而走火入魔。
另一邊，望舒劍主夙玉同樣也因為失去羲和劍調和而寒毒入體，最終在生下一子後死去。NTR了自己兄弟的雲天青也因為被寒氣入侵而早早地殞命，只留下一子——雲天河，也就是仙劍四的第一男主角。
雲天河自幼生活在青鸞峰上，幾乎不與人接觸，成了一個野人，同時也獲得了“野豬的一生之敵”稱號。
仙劍四正篇的劇情也是從一頭野豬開始的。
盜墓賊韓菱紗為了解決自己一族短壽的問題，循著仙人的傳說掘開了雲天青與夙玉的墓穴。雲天河追著野豬進入墓穴，誤把她當成野豬精，險些用望舒劍射殺。韓菱紗雖然沒有被射中，卻因為接觸到望舒劍而激活了這柄沉睡已久的神劍。
她與前任劍主夙玉命格相同，激活望舒劍後自動就成為了它的宿主。這便是一切悲劇的開始。
杜子轅一直很好奇，如果給韓菱紗一個重來的機會，她還會願意上青鸞峰與那個野人邂逅嗎？
這個答案他注定是不會知道了，或許可以交給讀者們去思考。他只負責畫。
望舒劍被激活，雲天河不知輕重無意間毀了自己父母的墓穴。因為害怕老爹變成鬼來教訓自己，他順勢被韓菱紗忽悠下了山。
兩人一路尋仙，途中結識了柳夢璃、慕容紫英等人，最終機緣巧合之下竟然找到了雲天河父母當年的門派。
雲、韓、柳三人拜入瓊華，隨著一系列的經歷，他們終于認識到了這個門派的真相。最終，柳夢璃回歸幻瞑界，繼承母親的王位，與三位伙伴相隔兩界。韓菱紗因為被望舒劍吸攝過多靈力而壽元大損，她本來就不長命，這一吸更是雪上加霜，唯一能夠慰藉的大約就只有她人生的最後一段路是雲天河在身邊陪她走完的。
兩位男主角，慕容紫英一心求仙，最終渡劫成功踏入散仙之境，而對于韓菱紗的那一份情愫也早已被深埋，只剩一道九龍縛絲劍穗常伴身邊。雲天河則因為催動後羿射日弓過度而遭反噬，雙目失明，同時因為燭龍之息獲得悠久壽元，最終在韓菱紗去世多年後等到了柳夢璃的歸來。
一般來說，兩男兩女的主角配制的話，都是平均分成兩對，就像是仙劍三一樣。但是仙劍四卻很奇葩，雲天河1V2，慕容紫英從始至終都沒有感情戲，只有一個關于九龍縛絲劍穗的暗示。
而仙劍四處理得最好的大概就是雲天河明明喜歡著兩個女主角，最終也和兩人在一起了，卻並沒有劈腿。韓菱紗本來就短命，望舒劍吸不吸差別也不大，她跟雲天河相伴至死，在歷代仙劍女主角里面算是不錯的了（看看人家趙靈兒）。而柳夢璃守得雲開見月明，最後和雲天河重逢那一幕也正是讓杜子轅最感動的地方。
另外，仙劍四除了優秀的劇情以外，配樂也是一絕。一曲《回夢仙游》杜子轅至今難忘。
“反正現在也開了副職業，音樂也能獲得功德，就一次性全搞出來吧。”杜子轅其實還有一個想法，那就是他不僅要畫《仙劍四》的漫畫，還要把它搞成一個大IP，真人電視劇、動畫版甚至是游戲他都想做。
先把漫畫畫出來，等作品積累到一定的人氣之後，他就會開始這個IP打造計劃。
有心拓術的加持，杜子轅畫得飛快，刪減掉一些被詬病成“半成品”的多余劇情，杜子轅一口氣畫到了八公山劇情。在主角們打算進入淮南王陵前他停了下來。
算算時間，也是時候吃完飯然後。
五個新收的弟子早已恭敬地站在桌子旁邊等候，桌子上則放滿了林玉顰精心烹調的菜肴。五人年紀最大也不過十六七，還是少年心性，哪里受得了這種誘惑，一個個都在咽口水，尤其是夏安，死死地盯著一盤龍蝦眼珠子都快掉出來了。
“都站著干嘛，坐下吃啊，”杜子轅擺了擺手，示意道，“我們家又不是皇宮大內，沒那麼多規矩。”
五人一听，立刻跑到桌邊坐下，杜子轅則坐到了上首。他看了看，林玉顰坐在右邊，夏安和古家兄妹坐在她邊上，左邊是寧寒露和聶雪還有江毅、雲婷兄妹。李存鋒去看他爹了，所以不在。
杜子轅問林玉顰︰“還有個呢？”
林玉顰看了看時間，道︰“差不多到時間了，她自己會下來的。”
正說著呢，就听見樓上一陣腳步聲傳來。沒過一會兒，就看到一個穿著寬松睡衣，一頭金發亂得像雞窩的女子撓著肚臍眼從樓梯上走了下來，一邊還打著哈切。
“咦？今天怎麼特別香，我靠！”莉莉蒂婭這才看到客廳里的人，“你你你怎麼回來了！？你不是在皇城嗎？”
杜子轅白了她一眼︰“我飛回來的，不行嗎？快把衣服放下，不要污染孩子的眼楮！”
莉莉蒂婭連忙推回了二樓，一陣手忙腳亂之後換了一套白色長裙才重新下來︰“混蛋你要帶人回來早說啊！老娘這都被看光了，這損失你得賠！”
“我賠個雞兒，你還想要什麼？”杜子轅覺得這墮天使真的貪得無厭，看來得趕緊催一催風暮昭了，讓她趕緊把這貨帶走。
“嘿嘿，”莉莉蒂婭來到桌子邊上，夏安很自覺地讓出了空位，她坐下後對杜子轅道，“我最近在游戲里看中了一套裝備，但是賣家不要金銀只要靈石，我哪里拿得出來？你借我點唄。”